More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3893 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3893  Cytochrome b/b6 domain protein  100 
 
 		 575 aa  1174    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.290413  normal  0.541896 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0424  Cytochrome b/b6 domain protein  31.39 
 
 		 610 aa  249  1e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.628358  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3544  cytochrome b/b6 domain-containing protein  40.44 
 
 		 488 aa  231  2e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.148449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1923  cytochrome b/b6-like  36.61 
 
 		 367 aa  214  4.9999999999999996e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.08033  normal  0.565515 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3174  Cytochrome b/b6 domain protein  35.77 
 
 		 367 aa  207  4e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2380  cytochrome b/b6 domain-containing protein  35.79 
 
 		 367 aa  204  4e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00314618  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1649  cytochrome b/b6  36.21 
 
 		 367 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1087  cytochrome b/b6 domain protein  36.16 
 
 		 367 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2218  Cytochrome b/b6 domain protein  37.98 
 
 		 469 aa  196  1e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.905711  normal  0.211353 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0750  Cytochrome b/b6 domain protein  37.79 
 
 		 464 aa  194  3e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0241162  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5927  Cytochrome b/b6 domain protein  42.67 
 
 		 268 aa  194  3e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5002  putative cytochrome b  36.18 
 
 		 403 aa  194  5e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0257192  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57560  putative cytochrome b  36.18 
 
 		 403 aa  194  5e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.1208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0489  cytochrome b6  43.64 
 
 		 224 aa  193  7e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1986  Cytochrome b/b6 domain  34.19 
 
 		 431 aa  192  9e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.282251  normal  0.259595 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1247  cytochrome b6  43.18 
 
 		 224 aa  192  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.363884  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1650  cytochrome b6  43.18 
 
 		 224 aa  192  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1433  cytochrome b6  43.18 
 
 		 224 aa  192  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0673238  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1405  cytochrome b6  43.18 
 
 		 224 aa  192  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1405  cytochrome b6  43.18 
 
 		 224 aa  192  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00694033  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1545  cytochrome b6  43.18 
 
 		 224 aa  192  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1686  cytochrome b6  43.18 
 
 		 224 aa  192  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1579  cytochrome b6  43.18 
 
 		 224 aa  192  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1617  cytochrome b6  43.18 
 
 		 224 aa  192  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.11169 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1448  cytochrome b6  43.18 
 
 		 224 aa  192  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.227629  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3766  cytochrome b6  43.18 
 
 		 224 aa  192  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4406  cytochrome b/b6 domain-containing protein  37.06 
 
 		 404 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.232418 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1318  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b  37.06 
 
 		 403 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.503431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4531  cytochrome b/b6 domain-containing protein  37.06 
 
 		 404 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0925  cytochrome b/b6 domain-containing protein  36.76 
 
 		 404 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1832  cytochrome B subunit of cytochrome bc1  35.23 
 
 		 410 aa  191  4e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.255708  normal  0.197515 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2130  cytochrome b6  42.73 
 
 		 224 aa  191  4e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000123643  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1779  Cytochrome b/b6 domain  34.56 
 
 		 422 aa  190  7e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.484297  decreased coverage  0.00239788 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13070  Cytochrome b/b6  35.62 
 
 		 403 aa  189  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0810  cytochrome b/b6, N-terminal:cytochrome b/b6, C-terminal  35.04 
 
 		 433 aa  188  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000295618  hitchhiker  0.00000153677 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1961  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome B  36.24 
 
 		 459 aa  186  8e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4691  cytochrome b/b6-like  35.88 
 
 		 403 aa  186  8e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.49849  normal  0.0253809 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2108  cytochrome b/b6 domain-containing protein  36.01 
 
 		 410 aa  186  9e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0919786  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0430  cytochrome b/b6 domain-containing protein  36.44 
 
 		 431 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00372181  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03380  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome B  33.24 
 
 		 421 aa  185  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000214101  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0904  cytochrome b/b6 domain-containing protein  36.47 
 
 		 403 aa  184  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.168662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0326  cytochrome b/b6-like  36.07 
 
 		 451 aa  184  3e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.756049 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0395  cytochrome b-c complex, cytochrome b subunit  35 
 
 		 426 aa  183  7e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.488441  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0298  cytochrome b/b6-like  35.59 
 
 		 408 aa  182  1e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.349609  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1395  cytochrome b  33.91 
 
 		 445 aa  182  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0062  cytochrome b/b6 domain-containing protein  33.91 
 
 		 445 aa  182  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.422457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3700  cytochrome b/b6-like  34.36 
 
 		 422 aa  181  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0123315  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0925  cytochrome c1  34.15 
 
 		 690 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2802  cytochrome b/b6 domain-containing protein  34.2 
 
 		 445 aa  181  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.387629  normal  0.411139 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2243  cytochrome b/b6 domain-containing protein  34.66 
 
 		 425 aa  181  4e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0363232  normal  0.819807 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0467  Cytochrome b/b6 domain  34.37 
 
 		 421 aa  180  4.999999999999999e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.776712  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2469  cytochrome b/b6 domain-containing protein  35.24 
 
 		 410 aa  180  4.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00715647  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3277  cytochrome b  36.18 
 
 		 449 aa  181  4.999999999999999e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1139  Cytochrome b/b6 domain protein  34.46 
 
 		 403 aa  179  1e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.222795  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2711  cytochrome b/b6-like protein  43.54 
 
 		 249 aa  179  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1385  cytochrome c1  32.93 
 
 		 688 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0677  cytochrome b/b6-like  34.94 
 
 		 429 aa  178  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.206684  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1303  cytochrome c1  33.23 
 
 		 689 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0992  cytochrome b/b6-like  34.99 
 
 		 410 aa  177  3e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.747252  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2813  cytochrome b/b6-like  36.08 
 
 		 442 aa  178  3e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.668626  normal  0.273997 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2957  cytochrome b/b6-like protein  44.5 
 
 		 257 aa  177  4e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0357  cytochrome b/b6 domain-containing protein  33.73 
 
 		 401 aa  177  6e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000177804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3240  cytochrome c1  34.15 
 
 		 688 aa  176  7e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1004  cytochrome b/b6-like  32.52 
 
 		 414 aa  176  8e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00661303  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1403  Cytochrome b/b6 domain protein  33.96 
 
 		 422 aa  176  9e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2210  cytochrome b/b6  35.31 
 
 		 413 aa  176  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.226305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0445  cytochrome b/b6 domain-containing protein  36.42 
 
 		 358 aa  176  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2301  cytochrome b/c1  33.23 
 
 		 688 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2873  fused ubiquinol-cytochrome c reductase and cytochrome b/b6  33.43 
 
 		 426 aa  174  2.9999999999999996e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00318002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2616  cytochrome c1  34.45 
 
 		 687 aa  174  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.634521  normal  0.325896 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2251  cytochrome b6  36.02 
 
 		 222 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00036602 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0415  putative cytochrome B subunit transmembrane protein  31.33 
 
 		 459 aa  172  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0850  cytochrome B  34 
 
 		 466 aa  172  1e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.833768 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1832  Cytochrome b/b6 domain protein  32.2 
 
 		 418 aa  171  2e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.485298  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2331  cytochrome b6  34.91 
 
 		 215 aa  172  2e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.520251 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1201  cytochrome c1  32.11 
 
 		 689 aa  172  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1454  Cytochrome b/b6 domain protein  33.23 
 
 		 394 aa  172  2e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000126052  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2306  cytochrome b/b6 domain-containing protein  31.17 
 
 		 440 aa  172  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226974  normal  0.0553063 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0741  Cytochrome b/b6 domain protein  32.2 
 
 		 418 aa  171  2e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0421  cytochrome b/b6 domain-containing protein  31.22 
 
 		 460 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000270463 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2665  cytochrome b/b6-like  31.22 
 
 		 460 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.628042  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0442  cytochrome b/b6 domain-containing protein  31.22 
 
 		 460 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1718  cytochrome b-c complex, cytochrome b subunit  34.78 
 
 		 429 aa  170  6e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000000282994  normal  0.360992 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3934  cytochrome b/b6 domain-containing protein  35.31 
 
 		 470 aa  170  6e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.930793 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0822  cytochrome b/b6-like  32.14 
 
 		 466 aa  170  6e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.887909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0360  cytochrome b/b6 domain-containing protein  30.46 
 
 		 460 aa  170  8e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0523678  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1071  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  31.25 
 
 		 409 aa  169  1e-40  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03491  cytochrome b6  35.89 
 
 		 218 aa  169  1e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.499188  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2576  cytochrome b6  34.45 
 
 		 222 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.953247 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03611  cytochrome b6  35.41 
 
 		 218 aa  169  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03511  cytochrome b6  35.89 
 
 		 218 aa  169  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3538  cytochrome b6  34.45 
 
 		 222 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1702  cytochrome b6  35.89 
 
 		 218 aa  169  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0511  cytochrome b/b6  31.79 
 
 		 408 aa  168  2e-40  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000312335  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0331  cytochrome b6  35.89 
 
 		 218 aa  168  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04171  cytochrome b6  35.89 
 
 		 218 aa  169  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.576344 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3200  cytochrome b/b6-like protein  35.17 
 
 		 404 aa  168  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.201205  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3543  Cytochrome b/b6 domain  30.48 
 
 		 459 aa  169  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.789963  normal  0.0181862 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2471  Cytochrome b/b6 domain  32.86 
 
 		 430 aa  168  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0219916 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03571  cytochrome b6  35.89 
 
 		 218 aa  169  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.223543  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>