More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0445 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0445  cytochrome b/b6 domain-containing protein  100 
 
 		 358 aa  711    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3893  Cytochrome b/b6 domain protein  35.9 
 
 		 575 aa  179  5.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.290413  normal  0.541896 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3174  Cytochrome b/b6 domain protein  32.76 
 
 		 367 aa  164  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4252  cytochrome b/b6 domain-containing protein  30.42 
 
 		 562 aa  159  6e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000252204  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2380  cytochrome b/b6 domain-containing protein  32.32 
 
 		 367 aa  157  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00314618  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1087  cytochrome b/b6 domain protein  34.34 
 
 		 367 aa  156  6e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1923  cytochrome b/b6-like  29.88 
 
 		 367 aa  146  5e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.08033  normal  0.565515 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0485  cytochrome b6  37.91 
 
 		 218 aa  144  3e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.153664  normal  0.560509 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1702  cytochrome b6  35.71 
 
 		 218 aa  143  5e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04171  cytochrome b6  35.71 
 
 		 218 aa  143  5e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.576344 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21851  cytochrome b6  36.19 
 
 		 218 aa  142  6e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.396242 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1849  cytochrome b6  35.38 
 
 		 218 aa  142  7e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.434753  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03611  cytochrome b6  35.71 
 
 		 218 aa  142  8e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1986  Cytochrome b/b6 domain  29.21 
 
 		 431 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.282251  normal  0.259595 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03571  cytochrome b6  36.81 
 
 		 218 aa  140  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.223543  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0331  cytochrome b6  37.36 
 
 		 218 aa  140  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2251  cytochrome b6  33.18 
 
 		 222 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00036602 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03511  cytochrome b6  37.36 
 
 		 218 aa  140  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03491  cytochrome b6  37.36 
 
 		 218 aa  140  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.499188  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2108  cytochrome b/b6 domain-containing protein  33.12 
 
 		 410 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0919786  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2331  cytochrome b6  34.29 
 
 		 215 aa  140  4.999999999999999e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.520251 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2711  cytochrome b/b6-like protein  37.84 
 
 		 249 aa  140  4.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3538  cytochrome b6  33.17 
 
 		 222 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2576  cytochrome b6  33.17 
 
 		 222 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.953247 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1554  Cytochrome b/b6 domain protein  31.58 
 
 		 451 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2404  cytochrome b/b6-like  31.58 
 
 		 451 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1459  cytochrome b/b6 domain protein  32.04 
 
 		 451 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3544  cytochrome b/b6 domain-containing protein  26.87 
 
 		 488 aa  137  3.0000000000000003e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.148449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3441  cytochrome b6  34.29 
 
 		 215 aa  136  5e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00977243  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1703  cytochrome b/b6 domain-containing protein  34.62 
 
 		 215 aa  136  5e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2347  cytochrome b6  35.16 
 
 		 222 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1649  cytochrome b/b6  32.21 
 
 		 367 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2130  cytochrome b6  40.44 
 
 		 224 aa  132  9e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000123643  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0489  cytochrome b6  40.44 
 
 		 224 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1779  Cytochrome b/b6 domain  27.69 
 
 		 422 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.484297  decreased coverage  0.00239788 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5927  Cytochrome b/b6 domain protein  34.47 
 
 		 268 aa  131  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2957  cytochrome b/b6-like protein  40.78 
 
 		 257 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2218  Cytochrome b/b6 domain protein  29.71 
 
 		 469 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.905711  normal  0.211353 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2210  cytochrome b/b6  29.68 
 
 		 413 aa  129  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.226305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2472  Cytochrome b/b6 domain protein  27.97 
 
 		 464 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1137  cytochrome b6  33.52 
 
 		 222 aa  127  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00720211 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0750  Cytochrome b/b6 domain protein  28.9 
 
 		 464 aa  126  5e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0241162  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1718  cytochrome b-c complex, cytochrome b subunit  32.8 
 
 		 429 aa  126  5e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000000282994  normal  0.360992 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1617  cytochrome b6  39.34 
 
 		 224 aa  126  7e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.11169 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1650  cytochrome b6  39.34 
 
 		 224 aa  126  7e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1433  cytochrome b6  39.34 
 
 		 224 aa  126  7e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0673238  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1405  cytochrome b6  39.34 
 
 		 224 aa  126  7e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1405  cytochrome b6  39.34 
 
 		 224 aa  126  7e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00694033  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1545  cytochrome b6  39.34 
 
 		 224 aa  126  7e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1448  cytochrome b6  39.34 
 
 		 224 aa  126  7e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.227629  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1579  cytochrome b6  39.34 
 
 		 224 aa  126  7e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1247  cytochrome b6  39.34 
 
 		 224 aa  126  7e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.363884  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3766  cytochrome b6  39.34 
 
 		 224 aa  126  7e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1686  cytochrome b6  39.34 
 
 		 224 aa  126  7e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2469  cytochrome b/b6 domain-containing protein  30.77 
 
 		 410 aa  124  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00715647  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5002  putative cytochrome b  30.1 
 
 		 403 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0257192  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57560  putative cytochrome b  30.1 
 
 		 403 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.1208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0467  Cytochrome b/b6 domain  31.29 
 
 		 421 aa  123  4e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.776712  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1961  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome B  29.49 
 
 		 459 aa  122  7e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1832  cytochrome B subunit of cytochrome bc1  27.32 
 
 		 410 aa  122  7e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.255708  normal  0.197515 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1534  Cytochrome b/b6 domain  30.98 
 
 		 400 aa  122  7e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000678475  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1454  Cytochrome b/b6 domain protein  28.44 
 
 		 394 aa  122  9.999999999999999e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000126052  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0578  Cytochrome b/b6 domain protein  34.59 
 
 		 267 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.101746  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4691  cytochrome b/b6-like  28.71 
 
 		 403 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.49849  normal  0.0253809 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2730  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  28.78 
 
 		 404 aa  120  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187395  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1139  Cytochrome b/b6 domain protein  28.8 
 
 		 403 aa  120  3e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.222795  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2352  Cytochrome b/b6 domain  28.78 
 
 		 404 aa  120  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.16814  hitchhiker  0.00000000117794 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0395  cytochrome b-c complex, cytochrome b subunit  28.92 
 
 		 426 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.488441  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0925  cytochrome b/b6 domain-containing protein  28.28 
 
 		 404 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0430  cytochrome b/b6 domain-containing protein  30.13 
 
 		 431 aa  119  6e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00372181  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1318  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b  28.36 
 
 		 403 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.503431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4531  cytochrome b/b6 domain-containing protein  28.36 
 
 		 404 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4406  cytochrome b/b6 domain-containing protein  28.36 
 
 		 404 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.232418 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0242  cytochrome b/b6 domain-containing protein  30.03 
 
 		 448 aa  119  9e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0677  cytochrome b/b6-like  31.27 
 
 		 429 aa  119  9e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.206684  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0647  Cytochrome b/b6 domain protein  35.29 
 
 		 269 aa  119  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.334233  normal  0.148451 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1004  cytochrome b/b6-like  27.71 
 
 		 414 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00661303  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2243  cytochrome b/b6 domain-containing protein  28.61 
 
 		 425 aa  117  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0363232  normal  0.819807 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3097  Cytochrome b/b6 domain protein  34.05 
 
 		 267 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1449  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  26.84 
 
 		 415 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3161  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase A subunit  32.05 
 
 		 747 aa  118  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.389145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0243  Cytochrome b/b6 domain-containing protein  28.9 
 
 		 429 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0278  Cytochrome b/b6 domain  31.66 
 
 		 417 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0904  cytochrome b/b6 domain-containing protein  34.95 
 
 		 403 aa  117  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.168662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0421  cytochrome b/b6 domain-containing protein  29.97 
 
 		 460 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000270463 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0925  cytochrome c1  29.21 
 
 		 690 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0415  putative cytochrome B subunit transmembrane protein  29.58 
 
 		 459 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0362  Cytochrome b/b6 domain  31.85 
 
 		 429 aa  117  3e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000296669  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13070  Cytochrome b/b6  30 
 
 		 403 aa  117  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0442  cytochrome b/b6 domain-containing protein  29.65 
 
 		 460 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3543  Cytochrome b/b6 domain  29.7 
 
 		 459 aa  116  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.789963  normal  0.0181862 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3540  cytochrome b/b6-like  29.49 
 
 		 459 aa  116  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2665  cytochrome b/b6-like  29.81 
 
 		 460 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.628042  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2873  fused ubiquinol-cytochrome c reductase and cytochrome b/b6  28.24 
 
 		 426 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00318002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2119  cytochrome b/b6-like  38.27 
 
 		 247 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.940192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0992  cytochrome b/b6-like  27.76 
 
 		 410 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.747252  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1237  cytochrome B  27.3 
 
 		 419 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0360  cytochrome b/b6 domain-containing protein  29.52 
 
 		 460 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0523678  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0369  cytochrome b/b6 domain-containing protein  29.52 
 
 		 460 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.723254 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0470  Cytochrome b/b6 domain protein  27.99 
 
 		 425 aa  115  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>