More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3544 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3544  cytochrome b/b6 domain-containing protein  100 
 
 		 488 aa  978    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.148449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3893  Cytochrome b/b6 domain protein  42.81 
 
 		 575 aa  227  4e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.290413  normal  0.541896 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1923  cytochrome b/b6-like  34.52 
 
 		 367 aa  218  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.08033  normal  0.565515 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5927  Cytochrome b/b6 domain protein  46.26 
 
 		 268 aa  202  7e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2380  cytochrome b/b6 domain-containing protein  32.88 
 
 		 367 aa  201  3e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00314618  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1649  cytochrome b/b6  32.6 
 
 		 367 aa  187  3e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3174  Cytochrome b/b6 domain protein  31.98 
 
 		 367 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2957  cytochrome b/b6-like protein  46.34 
 
 		 257 aa  180  5.999999999999999e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1087  cytochrome b/b6 domain protein  33.15 
 
 		 367 aa  179  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2711  cytochrome b/b6-like protein  43.27 
 
 		 249 aa  176  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1139  Cytochrome b/b6 domain protein  32.68 
 
 		 403 aa  169  1e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.222795  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2108  cytochrome b/b6 domain-containing protein  33.43 
 
 		 410 aa  160  4e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0919786  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2301  cytochrome b/c1  30.96 
 
 		 688 aa  160  6e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2331  cytochrome b6  35.85 
 
 		 215 aa  159  1e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.520251 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2210  cytochrome b/b6  30.98 
 
 		 413 aa  157  3e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.226305  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1703  cytochrome b/b6 domain-containing protein  35.85 
 
 		 215 aa  157  5.0000000000000005e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1448  cytochrome b6  37.27 
 
 		 224 aa  156  6e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.227629  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1650  cytochrome b6  37.27 
 
 		 224 aa  156  6e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1247  cytochrome b6  37.27 
 
 		 224 aa  156  6e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.363884  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1433  cytochrome b6  37.27 
 
 		 224 aa  156  6e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0673238  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1405  cytochrome b6  37.27 
 
 		 224 aa  156  6e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1405  cytochrome b6  37.27 
 
 		 224 aa  156  6e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00694033  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3766  cytochrome b6  37.27 
 
 		 224 aa  156  6e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1545  cytochrome b6  37.27 
 
 		 224 aa  156  6e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1617  cytochrome b6  37.27 
 
 		 224 aa  156  6e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.11169 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1686  cytochrome b6  37.27 
 
 		 224 aa  156  6e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1579  cytochrome b6  37.27 
 
 		 224 aa  156  6e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3538  cytochrome b6  35.55 
 
 		 222 aa  156  7e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2576  cytochrome b6  35.55 
 
 		 222 aa  156  7e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.953247 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1986  Cytochrome b/b6 domain  31.56 
 
 		 431 aa  156  8e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.282251  normal  0.259595 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3441  cytochrome b6  35.38 
 
 		 215 aa  156  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00977243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0925  cytochrome c1  28.81 
 
 		 690 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0992  cytochrome b/b6-like  31.33 
 
 		 410 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.747252  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1303  cytochrome c1  29.71 
 
 		 689 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1385  cytochrome c1  29.36 
 
 		 688 aa  154  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21851  cytochrome b6  34.12 
 
 		 218 aa  154  5e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.396242 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0489  cytochrome b6  36.82 
 
 		 224 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0485  cytochrome b6  34.12 
 
 		 218 aa  152  8.999999999999999e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.153664  normal  0.560509 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04171  cytochrome b6  33.65 
 
 		 218 aa  152  1e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.576344 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1702  cytochrome b6  33.65 
 
 		 218 aa  152  1e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1201  cytochrome c1  29.64 
 
 		 689 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2251  cytochrome b6  33.96 
 
 		 222 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00036602 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03491  cytochrome b6  33.49 
 
 		 218 aa  151  2e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.499188  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03511  cytochrome b6  33.49 
 
 		 218 aa  151  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2759  hypothetical protein  30.4 
 
 		 404 aa  152  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2632  hypothetical protein  30.67 
 
 		 404 aa  152  2e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1849  cytochrome b6  34.12 
 
 		 218 aa  152  2e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.434753  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2130  cytochrome b6  36.36 
 
 		 224 aa  152  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000123643  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0331  cytochrome b6  33.49 
 
 		 218 aa  151  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2471  Cytochrome b/b6 domain  28.93 
 
 		 430 aa  152  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0219916 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3240  cytochrome c1  28.57 
 
 		 688 aa  151  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03571  cytochrome b6  33.49 
 
 		 218 aa  152  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.223543  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0737  cytochrome b/b6  30.21 
 
 		 428 aa  151  2e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.113656 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03611  cytochrome b6  33.18 
 
 		 218 aa  151  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3161  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase A subunit  29.03 
 
 		 747 aa  151  3e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.389145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2347  cytochrome b6  33.96 
 
 		 222 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1137  cytochrome b6  35.71 
 
 		 222 aa  150  4e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00720211 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2543  cytochrome b/b6 domain-containing protein  28.65 
 
 		 430 aa  150  5e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.271762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2766  Cytochrome b/b6 domain  28.65 
 
 		 430 aa  150  5e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.447139 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2243  cytochrome b/b6 domain-containing protein  28.93 
 
 		 425 aa  150  5e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0363232  normal  0.819807 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2813  cytochrome b/b6-like  30.2 
 
 		 442 aa  148  3e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.668626  normal  0.273997 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1779  Cytochrome b/b6 domain  32.31 
 
 		 422 aa  147  3e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.484297  decreased coverage  0.00239788 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3277  cytochrome b  29.61 
 
 		 449 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1832  cytochrome B subunit of cytochrome bc1  29.2 
 
 		 410 aa  146  6e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.255708  normal  0.197515 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4691  cytochrome b/b6-like  29.86 
 
 		 403 aa  146  6e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.49849  normal  0.0253809 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0822  cytochrome b/b6-like  29.73 
 
 		 466 aa  146  9e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.887909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0750  Cytochrome b/b6 domain protein  28.49 
 
 		 464 aa  145  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0241162  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2873  fused ubiquinol-cytochrome c reductase and cytochrome b/b6  27.68 
 
 		 426 aa  145  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00318002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2218  Cytochrome b/b6 domain protein  29.58 
 
 		 469 aa  145  1e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.905711  normal  0.211353 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2616  cytochrome c1  27.87 
 
 		 687 aa  145  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.634521  normal  0.325896 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4252  cytochrome b/b6 domain-containing protein  28.26 
 
 		 562 aa  145  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000252204  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0445  cytochrome b/b6 domain-containing protein  29.3 
 
 		 358 aa  144  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2078  Cytochrome b/b6 domain protein  26.52 
 
 		 583 aa  144  4e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3097  Cytochrome b/b6 domain protein  38.38 
 
 		 267 aa  144  4e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3204  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome b subunit  31.61 
 
 		 422 aa  142  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.545864  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1395  cytochrome b  29.67 
 
 		 445 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1961  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome B  29.28 
 
 		 459 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0062  cytochrome b/b6 domain-containing protein  29.67 
 
 		 445 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.422457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57560  putative cytochrome b  29.35 
 
 		 403 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.1208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5002  putative cytochrome b  29.35 
 
 		 403 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0257192  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2802  cytochrome b/b6 domain-containing protein  30 
 
 		 445 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.387629  normal  0.411139 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0647  Cytochrome b/b6 domain protein  37.5 
 
 		 269 aa  141  3e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.334233  normal  0.148451 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0326  cytochrome b/b6-like  30 
 
 		 451 aa  140  4.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.756049 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2665  cytochrome b/b6-like  28.23 
 
 		 460 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.628042  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0714  cytochrome b/b6 domain-containing protein  30.98 
 
 		 469 aa  140  4.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.455479 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0442  cytochrome b/b6 domain-containing protein  28.23 
 
 		 460 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2472  Cytochrome b/b6 domain protein  28.42 
 
 		 464 aa  140  6e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2674  Cytochrome b subunit of the bc complex-like protein  28.43 
 
 		 545 aa  140  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.896825 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0421  cytochrome b/b6 domain-containing protein  28.23 
 
 		 460 aa  140  7e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000270463 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0931  cytochrome b/b6 domain-containing protein  28.74 
 
 		 467 aa  139  8.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0345  cytochrome b/b6 domain-containing protein  27.93 
 
 		 459 aa  139  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1949  Cytochrome b/b6 domain protein  29.94 
 
 		 556 aa  139  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000732927 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0369  cytochrome b/b6 domain-containing protein  27.93 
 
 		 460 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.723254 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0298  cytochrome b/b6-like  28.23 
 
 		 408 aa  139  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.349609  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0578  Cytochrome b/b6 domain protein  37.88 
 
 		 267 aa  139  1e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.101746  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00440  ubiquinol cytochrome C oxidoreductase, cytochrome B subunit  29.27 
 
 		 419 aa  139  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.121242  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0360  cytochrome b/b6 domain-containing protein  27.93 
 
 		 460 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0523678  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0850  cytochrome B  27.99 
 
 		 466 aa  139  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.833768 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1534  Cytochrome b/b6 domain  30.89 
 
 		 400 aa  138  2e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000678475  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3934  cytochrome b/b6 domain-containing protein  31.51 
 
 		 470 aa  139  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.930793 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>