284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2331 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2331  cytochrome b6  100 
 
 		 215 aa  439  9.999999999999999e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.520251 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2347  cytochrome b6  90.65 
 
 		 222 aa  407  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3441  cytochrome b6  90.7 
 
 		 215 aa  409  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00977243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21851  cytochrome b6  89.72 
 
 		 218 aa  404  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.396242 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1703  cytochrome b/b6 domain-containing protein  89.3 
 
 		 215 aa  406  1.0000000000000001e-112  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3538  cytochrome b6  87.38 
 
 		 222 aa  400  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2251  cytochrome b6  87.85 
 
 		 222 aa  402  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00036602 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2576  cytochrome b6  87.38 
 
 		 222 aa  400  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.953247 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1702  cytochrome b6  87.85 
 
 		 218 aa  399  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1849  cytochrome b6  88.32 
 
 		 218 aa  400  9.999999999999999e-111  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.434753  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0485  cytochrome b6  88.32 
 
 		 218 aa  399  9.999999999999999e-111  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.153664  normal  0.560509 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03611  cytochrome b6  88.79 
 
 		 218 aa  398  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04171  cytochrome b6  87.85 
 
 		 218 aa  399  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.576344 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03571  cytochrome b6  86.45 
 
 		 218 aa  394  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.223543  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0331  cytochrome b6  86.92 
 
 		 218 aa  394  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03511  cytochrome b6  87.38 
 
 		 218 aa  395  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03491  cytochrome b6  87.38 
 
 		 218 aa  395  1e-109  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.499188  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1137  cytochrome b6  86.92 
 
 		 222 aa  393  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00720211 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2130  cytochrome b6  43.05 
 
 		 224 aa  204  1e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000123643  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0489  cytochrome b6  42.6 
 
 		 224 aa  202  3e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1650  cytochrome b6  42.15 
 
 		 224 aa  199  3e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1433  cytochrome b6  42.15 
 
 		 224 aa  199  3e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0673238  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1405  cytochrome b6  42.15 
 
 		 224 aa  199  3e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1405  cytochrome b6  42.15 
 
 		 224 aa  199  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00694033  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3766  cytochrome b6  42.15 
 
 		 224 aa  199  3e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1686  cytochrome b6  42.15 
 
 		 224 aa  199  3e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1545  cytochrome b6  42.15 
 
 		 224 aa  199  3e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1448  cytochrome b6  42.15 
 
 		 224 aa  199  3e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.227629  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1247  cytochrome b6  42.15 
 
 		 224 aa  199  3e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.363884  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1579  cytochrome b6  42.15 
 
 		 224 aa  199  3e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1617  cytochrome b6  42.15 
 
 		 224 aa  199  3e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.11169 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1986  Cytochrome b/b6 domain  40.65 
 
 		 431 aa  181  8.000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.282251  normal  0.259595 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1923  cytochrome b/b6-like  39.07 
 
 		 367 aa  176  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.08033  normal  0.565515 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2380  cytochrome b/b6 domain-containing protein  38.6 
 
 		 367 aa  176  3e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00314618  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3174  Cytochrome b/b6 domain protein  39.25 
 
 		 367 aa  175  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0430  cytochrome b/b6 domain-containing protein  41.47 
 
 		 431 aa  175  5e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00372181  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1779  Cytochrome b/b6 domain  37.91 
 
 		 422 aa  174  9.999999999999999e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.484297  decreased coverage  0.00239788 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3893  Cytochrome b/b6 domain protein  34.91 
 
 		 575 aa  172  3.9999999999999995e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.290413  normal  0.541896 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0467  Cytochrome b/b6 domain  41.55 
 
 		 421 aa  171  1e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.776712  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1649  cytochrome b/b6  41.59 
 
 		 367 aa  169  3e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0395  cytochrome b-c complex, cytochrome b subunit  41.23 
 
 		 426 aa  168  5e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.488441  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1087  cytochrome b/b6 domain protein  39.25 
 
 		 367 aa  168  7e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1718  cytochrome b-c complex, cytochrome b subunit  41.47 
 
 		 429 aa  167  1e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000000282994  normal  0.360992 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2108  cytochrome b/b6 domain-containing protein  37.21 
 
 		 410 aa  164  9e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0919786  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5927  Cytochrome b/b6 domain protein  37.44 
 
 		 268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2711  cytochrome b/b6-like protein  40.28 
 
 		 249 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0362  Cytochrome b/b6 domain  41.94 
 
 		 429 aa  162  3e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000296669  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3097  Cytochrome b/b6 domain protein  41.27 
 
 		 267 aa  162  4.0000000000000004e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0647  Cytochrome b/b6 domain protein  36.44 
 
 		 269 aa  160  1e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.334233  normal  0.148451 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3544  cytochrome b/b6 domain-containing protein  35.85 
 
 		 488 aa  159  3e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.148449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4252  cytochrome b/b6 domain-containing protein  42.94 
 
 		 562 aa  159  4e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000252204  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2471  Cytochrome b/b6 domain  37.85 
 
 		 430 aa  159  4e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0219916 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0206  Cytochrome b/b6 domain protein  42.03 
 
 		 212 aa  158  6e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0464  cytochrome b/b6 domain-containing protein  38.14 
 
 		 428 aa  157  9e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.524709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0298  cytochrome b/b6-like  34.42 
 
 		 408 aa  156  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.349609  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0578  Cytochrome b/b6 domain protein  35.04 
 
 		 267 aa  156  2e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.101746  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2766  Cytochrome b/b6 domain  36.92 
 
 		 430 aa  156  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.447139 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2543  cytochrome b/b6 domain-containing protein  36.92 
 
 		 430 aa  156  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.271762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2218  Cytochrome b/b6 domain protein  34.93 
 
 		 469 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.905711  normal  0.211353 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7536  Cytochrome b/b6 domain protein  36.45 
 
 		 428 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0448545  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0750  Cytochrome b/b6 domain protein  33.02 
 
 		 464 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0241162  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6797  cytochrome b/b6 domain-containing protein  36.45 
 
 		 420 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0708619  normal  0.644393 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13070  Cytochrome b/b6  34.88 
 
 		 403 aa  155  6e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2759  hypothetical protein  34.88 
 
 		 404 aa  154  9e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2632  hypothetical protein  34.42 
 
 		 404 aa  154  1e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2210  cytochrome b/b6  36.36 
 
 		 413 aa  154  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.226305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2243  cytochrome b/b6 domain-containing protein  37.8 
 
 		 425 aa  154  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0363232  normal  0.819807 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1318  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b  34.88 
 
 		 403 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.503431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4406  cytochrome b/b6 domain-containing protein  34.88 
 
 		 404 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.232418 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4531  cytochrome b/b6 domain-containing protein  34.88 
 
 		 404 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4691  cytochrome b/b6-like  35.81 
 
 		 403 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.49849  normal  0.0253809 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0904  cytochrome b/b6 domain-containing protein  33.95 
 
 		 403 aa  152  4e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.168662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1454  Cytochrome b/b6 domain protein  37.62 
 
 		 394 aa  152  5e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000126052  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1815  pathogenicity island encoded protein: SPI3  38.94 
 
 		 414 aa  152  5e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00139349  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1449  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  35.58 
 
 		 415 aa  152  5e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1961  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome B  36.79 
 
 		 459 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0126  cytochrome b/b6 domain-containing protein  33.64 
 
 		 466 aa  151  7e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.469556  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2965  cytochrome b/b6-like  35.05 
 
 		 466 aa  150  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2957  cytochrome b/b6-like protein  38.39 
 
 		 257 aa  150  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0925  cytochrome b/b6 domain-containing protein  34.42 
 
 		 404 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3934  cytochrome b/b6 domain-containing protein  34.42 
 
 		 470 aa  149  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.930793 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5002  putative cytochrome b  34.42 
 
 		 403 aa  149  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0257192  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1920  cytochrome B(N-)/b6/PetB subfamily protein  38.46 
 
 		 414 aa  149  3e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57560  putative cytochrome b  34.42 
 
 		 403 aa  149  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.1208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2469  cytochrome b/b6 domain-containing protein  33.02 
 
 		 410 aa  149  4e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00715647  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0822  cytochrome b/b6-like  33.18 
 
 		 466 aa  148  5e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.887909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0625  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  35.05 
 
 		 410 aa  148  7e-35  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.393492  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1139  Cytochrome b/b6 domain protein  33.49 
 
 		 403 aa  148  8e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.222795  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1832  cytochrome B subunit of cytochrome bc1  31.63 
 
 		 410 aa  147  9e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.255708  normal  0.197515 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1004  cytochrome b/b6-like  33.97 
 
 		 414 aa  147  9e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00661303  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1201  cytochrome c1  35.98 
 
 		 689 aa  147  9e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5502  cytochrome b/b6 domain-containing protein  37.23 
 
 		 471 aa  147  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189406 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0992  cytochrome b/b6-like  33.97 
 
 		 410 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.747252  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0925  cytochrome c1  36.28 
 
 		 690 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0544  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  35.78 
 
 		 416 aa  147  1.0000000000000001e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1385  cytochrome c1  35.51 
 
 		 688 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0737  cytochrome b/b6  37.21 
 
 		 428 aa  146  2.0000000000000003e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.113656 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3695  cytochrome b/b6 domain-containing protein  38.3 
 
 		 472 aa  146  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.721065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2301  cytochrome b/c1  36.19 
 
 		 688 aa  145  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2958  cytochrome b/b6 domain-containing protein  36.62 
 
 		 424 aa  145  4.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.449932  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>