284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2119 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2119  cytochrome b/b6-like  100 
 
 		 247 aa  501  1e-141  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.940192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0198  cytochrome b/b6 domain-containing protein  55.27 
 
 		 251 aa  244  6.999999999999999e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1554  Cytochrome b/b6 domain protein  56.68 
 
 		 451 aa  219  3e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1459  cytochrome b/b6 domain protein  56.68 
 
 		 451 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2404  cytochrome b/b6-like  56.22 
 
 		 451 aa  217  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0242  cytochrome b/b6 domain-containing protein  54.38 
 
 		 448 aa  210  2e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4252  cytochrome b/b6 domain-containing protein  47.2 
 
 		 562 aa  196  4.0000000000000005e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000252204  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0485  cytochrome b6  43.68 
 
 		 218 aa  160  1e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.153664  normal  0.560509 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21851  cytochrome b6  44.63 
 
 		 218 aa  159  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.396242 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1849  cytochrome b6  43.68 
 
 		 218 aa  159  3e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.434753  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4024  cytochrome b/b6 domain protein  43.59 
 
 		 206 aa  159  4e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1702  cytochrome b6  44.07 
 
 		 218 aa  159  4e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04171  cytochrome b6  44.07 
 
 		 218 aa  159  4e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.576344 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03611  cytochrome b6  44.63 
 
 		 218 aa  158  6e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03511  cytochrome b6  44.63 
 
 		 218 aa  158  7e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0331  cytochrome b6  44.63 
 
 		 218 aa  158  7e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03491  cytochrome b6  44.63 
 
 		 218 aa  158  7e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.499188  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03571  cytochrome b6  44.07 
 
 		 218 aa  158  9e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.223543  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2251  cytochrome b6  42.94 
 
 		 222 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00036602 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5927  Cytochrome b/b6 domain protein  42.86 
 
 		 268 aa  156  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4115  Cytochrome b/b6 domain protein  42.86 
 
 		 206 aa  155  4e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.665119 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2711  cytochrome b/b6-like protein  43.96 
 
 		 249 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2347  cytochrome b6  43.96 
 
 		 222 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0647  Cytochrome b/b6 domain protein  43.82 
 
 		 269 aa  155  7e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.334233  normal  0.148451 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2932  cytochrome b/b6  43.37 
 
 		 206 aa  154  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2331  cytochrome b6  43.5 
 
 		 215 aa  154  1e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.520251 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2576  cytochrome b6  42.37 
 
 		 222 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.953247 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3538  cytochrome b6  42.37 
 
 		 222 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0578  Cytochrome b/b6 domain protein  42.61 
 
 		 267 aa  153  2e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.101746  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3097  Cytochrome b/b6 domain protein  42.61 
 
 		 267 aa  154  2e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1579  cytochrome b6  41 
 
 		 224 aa  152  5e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1650  cytochrome b6  41 
 
 		 224 aa  152  5e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1433  cytochrome b6  41 
 
 		 224 aa  152  5e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0673238  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1405  cytochrome b6  41 
 
 		 224 aa  152  5e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1405  cytochrome b6  41 
 
 		 224 aa  152  5e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00694033  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1247  cytochrome b6  41 
 
 		 224 aa  152  5e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.363884  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3441  cytochrome b6  43.5 
 
 		 215 aa  152  5e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00977243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1545  cytochrome b6  41 
 
 		 224 aa  152  5e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3766  cytochrome b6  41 
 
 		 224 aa  152  5e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1448  cytochrome b6  41 
 
 		 224 aa  152  5e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.227629  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1686  cytochrome b6  41 
 
 		 224 aa  152  5e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1617  cytochrome b6  41 
 
 		 224 aa  152  5e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.11169 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1703  cytochrome b/b6 domain-containing protein  43.5 
 
 		 215 aa  152  5.9999999999999996e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2130  cytochrome b6  40 
 
 		 224 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000123643  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1137  cytochrome b6  41.58 
 
 		 222 aa  150  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00720211 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0489  cytochrome b6  40 
 
 		 224 aa  149  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2957  cytochrome b/b6-like protein  42.86 
 
 		 257 aa  148  7e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1923  cytochrome b/b6-like  41.27 
 
 		 367 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.08033  normal  0.565515 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0458  cytochrome b/b6 domain-containing protein  44.95 
 
 		 206 aa  145  5e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1196  Cytochrome b/b6 domain  42.36 
 
 		 206 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2380  cytochrome b/b6 domain-containing protein  37.7 
 
 		 367 aa  138  6e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00314618  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0022  Cytochrome b/b6 domain protein  36.19 
 
 		 472 aa  138  7e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401541  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1986  Cytochrome b/b6 domain  35.91 
 
 		 431 aa  137  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.282251  normal  0.259595 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1333  Cytochrome b/b6 domain protein  36.6 
 
 		 488 aa  137  2e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.706322 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1649  cytochrome b/b6  42.86 
 
 		 367 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3893  Cytochrome b/b6 domain protein  37.02 
 
 		 575 aa  134  9e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.290413  normal  0.541896 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2472  Cytochrome b/b6 domain protein  33.81 
 
 		 464 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1779  Cytochrome b/b6 domain  39.39 
 
 		 422 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.484297  decreased coverage  0.00239788 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0206  Cytochrome b/b6 domain protein  43.23 
 
 		 212 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3544  cytochrome b/b6 domain-containing protein  34.93 
 
 		 488 aa  133  3e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.148449  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3174  Cytochrome b/b6 domain protein  37.97 
 
 		 367 aa  132  5e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1825  cytochrome b/b6 domain protein  32.43 
 
 		 522 aa  130  3e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3253  Cytochrome b/b6 domain  37.77 
 
 		 557 aa  129  6e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.510531  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1534  Cytochrome b/b6 domain  35.45 
 
 		 400 aa  126  3e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000678475  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2243  cytochrome b/b6 domain-containing protein  37.5 
 
 		 425 aa  125  6e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0363232  normal  0.819807 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2108  cytochrome b/b6 domain-containing protein  41.57 
 
 		 410 aa  125  6e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0919786  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1385  cytochrome c1  36.87 
 
 		 688 aa  125  9e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1087  cytochrome b/b6 domain protein  37.97 
 
 		 367 aa  124  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0445  cytochrome b/b6 domain-containing protein  38.86 
 
 		 358 aa  124  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0467  Cytochrome b/b6 domain  39.16 
 
 		 421 aa  124  2e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.776712  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1718  cytochrome b-c complex, cytochrome b subunit  38.38 
 
 		 429 aa  123  2e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000000282994  normal  0.360992 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0395  cytochrome b-c complex, cytochrome b subunit  38.1 
 
 		 426 aa  123  2e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.488441  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0430  cytochrome b/b6 domain-containing protein  38.55 
 
 		 431 aa  124  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00372181  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0737  cytochrome b/b6  36.41 
 
 		 428 aa  122  5e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.113656 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3617  Cytochrome b/b6 domain protein  32.13 
 
 		 537 aa  122  5e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1201  cytochrome c1  36.31 
 
 		 689 aa  122  7e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1303  cytochrome c1  37.43 
 
 		 689 aa  122  7e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0539  cytochrome b/b6-like  41.33 
 
 		 206 aa  121  8e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0925  cytochrome c1  35.2 
 
 		 690 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2301  cytochrome b/c1  36.31 
 
 		 688 aa  121  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2212  cytochrome b/b6-like protein  33.33 
 
 		 561 aa  121  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.184227  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2616  cytochrome c1  37.99 
 
 		 687 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.634521  normal  0.325896 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0243  Cytochrome b/b6 domain-containing protein  34.59 
 
 		 429 aa  119  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0362  Cytochrome b/b6 domain  34.15 
 
 		 429 aa  120  3e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000296669  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2813  cytochrome b/b6-like  35.06 
 
 		 442 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.668626  normal  0.273997 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2489  cytochrome b/b6-like  35.64 
 
 		 535 aa  119  6e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.613935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0464  cytochrome b/b6 domain-containing protein  38.55 
 
 		 428 aa  119  7e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.524709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3240  cytochrome c1  36.87 
 
 		 688 aa  118  9e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0155  cytochrome b/b6 domain-containing protein  36.96 
 
 		 418 aa  118  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.252364 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15680  cytochrome b subunit of the bc complex  30.85 
 
 		 566 aa  117  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1395  cytochrome b  35.06 
 
 		 445 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1812  cytochrome b/b6 domain-containing protein  32.45 
 
 		 546 aa  117  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.666264  normal  0.116322 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0470  Cytochrome b/b6 domain protein  36.96 
 
 		 425 aa  117  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2306  cytochrome b/b6 domain-containing protein  35.63 
 
 		 440 aa  117  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226974  normal  0.0553063 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0062  cytochrome b/b6 domain-containing protein  35.06 
 
 		 445 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.422457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1491  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  37.99 
 
 		 432 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.168905  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2078  Cytochrome b/b6 domain protein  31.28 
 
 		 583 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2471  Cytochrome b/b6 domain  37.43 
 
 		 430 aa  116  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0219916 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0326  cytochrome b/b6-like  35.63 
 
 		 451 aa  116  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.756049 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0544  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  35 
 
 		 416 aa  116  3.9999999999999997e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>