284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3253 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2078  Cytochrome b/b6 domain protein  58.42 
 
 		 583 aa  652    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16210  cytochrome b subunit of the bc complex  58.61 
 
 		 581 aa  635    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.180009  normal  0.762158 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3253  Cytochrome b/b6 domain  100 
 
 		 557 aa  1127    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.510531  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1949  Cytochrome b/b6 domain protein  60.19 
 
 		 556 aa  653    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000732927 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1889  Cytochrome b/b6 domain protein  59.2 
 
 		 580 aa  655    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.271737  hitchhiker  0.00145846 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15680  cytochrome b subunit of the bc complex  58.96 
 
 		 566 aa  662    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2212  cytochrome b/b6-like protein  58.53 
 
 		 561 aa  654    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.184227  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14160  cytochrome b subunit of the bc complex  56.96 
 
 		 559 aa  631  1e-180  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.409631  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2011  Cytochrome b/b6 domain protein  55.52 
 
 		 575 aa  615  1e-175  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.802913  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1680  cytochrome b/b6 domain protein  54.76 
 
 		 543 aa  608  1e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.76361 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1449  cytochrome b/b6 domain protein  55.86 
 
 		 547 aa  606  9.999999999999999e-173  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0373061  normal  0.0523763 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3137  cytochrome b/b6 domain-containing protein  57.72 
 
 		 582 aa  592  1e-168  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12150  cytochrome b subunit of the bc complex  53.37 
 
 		 564 aa  574  1.0000000000000001e-162  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145352  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3060  Cytochrome b/b6 domain protein  52.67 
 
 		 553 aa  559  1e-158  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00152334  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2674  Cytochrome b subunit of the bc complex-like protein  50.55 
 
 		 545 aa  549  1e-155  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.896825 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1293  cytochrome b/b6 domain-containing protein  54.44 
 
 		 542 aa  535  1e-151  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.327176 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8374  Cytochrome b subunit of the bc complex-like protein  51.29 
 
 		 545 aa  532  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1812  cytochrome b/b6 domain-containing protein  55.78 
 
 		 546 aa  527  1e-148  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.666264  normal  0.116322 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3105  cytochrome b/b6-like  52.19 
 
 		 527 aa  524  1e-147  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.041819  normal  0.378798 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3343  Cytochrome b/b6 domain protein  51.93 
 
 		 553 aa  520  1e-146  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1376  cytochrome b/b6 domain protein  55.24 
 
 		 564 aa  517  1.0000000000000001e-145  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131077  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3132  Cytochrome b/b6 domain protein  50.64 
 
 		 551 aa  513  1e-144  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0961  cytochrome b/b6 domain-containing protein  55.85 
 
 		 568 aa  513  1e-144  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0908958  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1019  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  50.84 
 
 		 548 aa  503  1e-141  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.110557  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3058  Cytochrome b/b6 domain protein  53.96 
 
 		 539 aa  498  1e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.489996  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3292  cytochrome b/b6 domain-containing protein  55.34 
 
 		 536 aa  495  1e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.632763 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3617  Cytochrome b/b6 domain protein  54.61 
 
 		 537 aa  493  9.999999999999999e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2695  Cytochrome b/b6 domain protein  47.51 
 
 		 541 aa  490  1e-137  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.692335  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3524  cytochrome b/b6 domain-containing protein  55.77 
 
 		 536 aa  490  1e-137  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10700  cytochrome b subunit of the bc complex  52.31 
 
 		 555 aa  479  1e-134  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.797183  normal  0.372195 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4117  Cytochrome b/b6 domain-containing protein  51.19 
 
 		 532 aa  479  1e-134  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.358172 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3560  cytochrome b/b6 domain-containing protein  50.93 
 
 		 549 aa  480  1e-134  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.723274  normal  0.0825671 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2953  cytochrome b/b6 domain-containing protein  52.63 
 
 		 557 aa  478  1e-133  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3294  cytochrome b/b6-like protein  49.07 
 
 		 558 aa  476  1e-133  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.550671  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3305  cytochrome b/b6 domain-containing protein  49.07 
 
 		 558 aa  477  1e-133  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.216309  normal  0.394132 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3356  cytochrome b/b6 domain-containing protein  49.07 
 
 		 558 aa  476  1e-133  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.162526  normal  0.0239806 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12224  ubiquinol-cytochrome C reductase qcrB (cytochrome B subunit)  48.84 
 
 		 549 aa  474  1e-132  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3251  Cytochrome b/b6 domain protein  45.34 
 
 		 542 aa  462  1e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00015741  decreased coverage  0.00000907942 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0554  Cytochrome b/b6 domain protein  48.36 
 
 		 551 aa  463  1e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1825  cytochrome b/b6 domain protein  50.79 
 
 		 522 aa  457  1e-127  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2489  cytochrome b/b6-like  51.52 
 
 		 535 aa  440  9.999999999999999e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.613935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1333  Cytochrome b/b6 domain protein  36.14 
 
 		 488 aa  268  2e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.706322 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0022  Cytochrome b/b6 domain protein  34.91 
 
 		 472 aa  239  8e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401541  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2472  Cytochrome b/b6 domain protein  34.94 
 
 		 464 aa  238  3e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0243  Cytochrome b/b6 domain-containing protein  36 
 
 		 429 aa  232  1e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0470  Cytochrome b/b6 domain protein  36.18 
 
 		 425 aa  227  6e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0319  cytochrome b/b6-like protein  34.45 
 
 		 437 aa  224  3e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0663276  decreased coverage  0.00372414 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0647  Cytochrome b/b6 domain protein  37.31 
 
 		 269 aa  133  7.999999999999999e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.334233  normal  0.148451 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21851  cytochrome b6  35.27 
 
 		 218 aa  129  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.396242 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03611  cytochrome b6  35.41 
 
 		 218 aa  129  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3097  Cytochrome b/b6 domain protein  36.36 
 
 		 267 aa  129  2.0000000000000002e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0485  cytochrome b6  33.64 
 
 		 218 aa  128  3e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.153664  normal  0.560509 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1702  cytochrome b6  32.73 
 
 		 218 aa  127  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04171  cytochrome b6  32.73 
 
 		 218 aa  127  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.576344 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0331  cytochrome b6  32.74 
 
 		 218 aa  127  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03511  cytochrome b6  32.74 
 
 		 218 aa  127  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2251  cytochrome b6  33.18 
 
 		 222 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00036602 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03491  cytochrome b6  32.74 
 
 		 218 aa  127  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.499188  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1849  cytochrome b6  33.64 
 
 		 218 aa  127  5e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.434753  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03571  cytochrome b6  32.29 
 
 		 218 aa  127  5e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.223543  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0578  Cytochrome b/b6 domain protein  34.74 
 
 		 267 aa  127  5e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.101746  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3544  cytochrome b/b6 domain-containing protein  30.22 
 
 		 488 aa  126  9e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.148449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5927  Cytochrome b/b6 domain protein  33.98 
 
 		 268 aa  126  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2331  cytochrome b6  32.73 
 
 		 215 aa  123  8e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.520251 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1703  cytochrome b/b6 domain-containing protein  35.29 
 
 		 215 aa  122  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3441  cytochrome b6  35.29 
 
 		 215 aa  122  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00977243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2347  cytochrome b6  32.17 
 
 		 222 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3538  cytochrome b6  31.36 
 
 		 222 aa  121  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2576  cytochrome b6  31.36 
 
 		 222 aa  121  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.953247 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2130  cytochrome b6  34.03 
 
 		 224 aa  118  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000123643  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1650  cytochrome b6  34.18 
 
 		 224 aa  118  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1579  cytochrome b6  34.18 
 
 		 224 aa  118  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1433  cytochrome b6  34.18 
 
 		 224 aa  118  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0673238  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1405  cytochrome b6  34.18 
 
 		 224 aa  118  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1405  cytochrome b6  34.18 
 
 		 224 aa  118  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00694033  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3766  cytochrome b6  34.18 
 
 		 224 aa  118  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1448  cytochrome b6  34.18 
 
 		 224 aa  118  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.227629  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1247  cytochrome b6  34.18 
 
 		 224 aa  118  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.363884  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1617  cytochrome b6  34.18 
 
 		 224 aa  118  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.11169 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1545  cytochrome b6  34.18 
 
 		 224 aa  118  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1686  cytochrome b6  34.18 
 
 		 224 aa  118  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0489  cytochrome b6  34.03 
 
 		 224 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1137  cytochrome b6  32.09 
 
 		 222 aa  117  6e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00720211 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1986  Cytochrome b/b6 domain  26.85 
 
 		 431 aa  114  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.282251  normal  0.259595 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1779  Cytochrome b/b6 domain  27.25 
 
 		 422 aa  114  6e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.484297  decreased coverage  0.00239788 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2119  cytochrome b/b6-like  37.57 
 
 		 247 aa  114  7.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.940192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4024  cytochrome b/b6 domain protein  32.86 
 
 		 206 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0430  cytochrome b/b6 domain-containing protein  27.35 
 
 		 431 aa  107  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00372181  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4115  Cytochrome b/b6 domain protein  32.38 
 
 		 206 aa  107  8e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.665119 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0395  cytochrome b-c complex, cytochrome b subunit  27.39 
 
 		 426 aa  105  3e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.488441  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1923  cytochrome b/b6-like  27.25 
 
 		 367 aa  104  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.08033  normal  0.565515 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0467  Cytochrome b/b6 domain  27.35 
 
 		 421 aa  104  4e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.776712  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2957  cytochrome b/b6-like protein  33.04 
 
 		 257 aa  104  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0445  cytochrome b/b6 domain-containing protein  28.08 
 
 		 358 aa  103  6e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3893  Cytochrome b/b6 domain protein  26.51 
 
 		 575 aa  103  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.290413  normal  0.541896 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1718  cytochrome b-c complex, cytochrome b subunit  28.27 
 
 		 429 aa  102  1e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000000282994  normal  0.360992 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4252  cytochrome b/b6 domain-containing protein  31.68 
 
 		 562 aa  101  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000252204  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2210  cytochrome b/b6  27.5 
 
 		 413 aa  100  5e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.226305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2711  cytochrome b/b6-like protein  32.5 
 
 		 249 aa  99.4  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2108  cytochrome b/b6 domain-containing protein  24.45 
 
 		 410 aa  99  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0919786  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>