281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0321 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0321  cytochrome b/b6 domain-containing protein  100 
 
 		 510 aa  1020    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0762  Cytochrome b/b6 domain protein  62.45 
 
 		 510 aa  631  1e-180  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.294721  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0291  cytochrome b/b6 domain-containing protein  30.26 
 
 		 562 aa  176  9.999999999999999e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0120651  normal  0.455263 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0621  Cytochrome b/b6 domain protein  30.92 
 
 		 536 aa  173  5.999999999999999e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0500  cytochrome b/b6 domain-containing protein  31.79 
 
 		 548 aa  169  1e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.847294  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0466  Cytochrome b/b6 domain protein  30.42 
 
 		 557 aa  142  9.999999999999999e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.312063  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1939  cytochrome b/b6 domain-containing protein  34.75 
 
 		 514 aa  142  1.9999999999999998e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0570321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1912  cytochrome b/b6 domain-containing protein  27.98 
 
 		 471 aa  137  4e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.541512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1923  cytochrome b/b6-like  31.65 
 
 		 367 aa  131  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.08033  normal  0.565515 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1779  Cytochrome b/b6 domain  31.14 
 
 		 422 aa  123  9.999999999999999e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.484297  decreased coverage  0.00239788 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5927  Cytochrome b/b6 domain protein  32.92 
 
 		 268 aa  122  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1649  cytochrome b/b6  30.08 
 
 		 367 aa  121  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2380  cytochrome b/b6 domain-containing protein  29.47 
 
 		 367 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00314618  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2472  Cytochrome b/b6 domain protein  26.61 
 
 		 464 aa  120  6e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3893  Cytochrome b/b6 domain protein  29.28 
 
 		 575 aa  119  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.290413  normal  0.541896 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3174  Cytochrome b/b6 domain protein  27.14 
 
 		 367 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0022  Cytochrome b/b6 domain protein  29.34 
 
 		 472 aa  118  3e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401541  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1986  Cytochrome b/b6 domain  30.59 
 
 		 431 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.282251  normal  0.259595 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3544  cytochrome b/b6 domain-containing protein  26.3 
 
 		 488 aa  111  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.148449  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0470  Cytochrome b/b6 domain protein  29.1 
 
 		 425 aa  110  4.0000000000000004e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0737  cytochrome b/b6  26.92 
 
 		 428 aa  111  4.0000000000000004e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.113656 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0243  Cytochrome b/b6 domain-containing protein  29.31 
 
 		 429 aa  110  5e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2616  cytochrome c1  27.42 
 
 		 687 aa  108  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.634521  normal  0.325896 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1333  Cytochrome b/b6 domain protein  27.76 
 
 		 488 aa  108  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.706322 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0822  cytochrome b/b6-like  27.74 
 
 		 466 aa  107  7e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.887909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1087  cytochrome b/b6 domain protein  27.99 
 
 		 367 aa  106  8e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2331  cytochrome b6  29.86 
 
 		 215 aa  106  9e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.520251 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0810  cytochrome b/b6, N-terminal:cytochrome b/b6, C-terminal  27.02 
 
 		 433 aa  106  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000295618  hitchhiker  0.00000153677 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1303  cytochrome c1  26.14 
 
 		 689 aa  106  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2243  cytochrome b/b6 domain-containing protein  26.29 
 
 		 425 aa  105  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0363232  normal  0.819807 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0430  cytochrome b/b6 domain-containing protein  29.97 
 
 		 431 aa  105  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00372181  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3934  cytochrome b/b6 domain-containing protein  28.53 
 
 		 470 aa  105  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.930793 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2347  cytochrome b6  28.31 
 
 		 222 aa  105  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1718  cytochrome b-c complex, cytochrome b subunit  28.28 
 
 		 429 aa  105  3e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000000282994  normal  0.360992 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1201  cytochrome c1  25.68 
 
 		 689 aa  104  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1385  cytochrome c1  25.12 
 
 		 688 aa  104  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0790  cytochrome b/b6 domain-containing protein  27.24 
 
 		 473 aa  104  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.209081 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0753  Cytochrome b/b6 domain protein  26.61 
 
 		 473 aa  103  6e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2873  fused ubiquinol-cytochrome c reductase and cytochrome b/b6  26.34 
 
 		 426 aa  103  6e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00318002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2958  cytochrome b/b6 domain-containing protein  25.12 
 
 		 424 aa  103  8e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.449932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0467  Cytochrome b/b6 domain  30.95 
 
 		 421 aa  102  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.776712  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0850  cytochrome B  28.24 
 
 		 466 aa  102  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.833768 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2471  Cytochrome b/b6 domain  27.37 
 
 		 430 aa  102  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0219916 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0714  cytochrome b/b6 domain-containing protein  28.53 
 
 		 469 aa  103  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.455479 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3695  cytochrome b/b6 domain-containing protein  27.86 
 
 		 472 aa  103  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.721065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0931  cytochrome b/b6 domain-containing protein  27.09 
 
 		 467 aa  101  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21851  cytochrome b6  29.36 
 
 		 218 aa  101  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.396242 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0395  cytochrome b-c complex, cytochrome b subunit  28.34 
 
 		 426 aa  101  3e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.488441  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1201  Cytochrome b/b6 domain protein  28.57 
 
 		 478 aa  101  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.690827  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0925  cytochrome c1  26.12 
 
 		 690 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2711  cytochrome b/b6-like protein  34.1 
 
 		 249 aa  101  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2301  cytochrome b/c1  26.4 
 
 		 688 aa  101  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0464  cytochrome b/b6 domain-containing protein  27.37 
 
 		 428 aa  100  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.524709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2251  cytochrome b6  27.73 
 
 		 222 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00036602 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3540  cytochrome b/b6-like  27.91 
 
 		 459 aa  100  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1403  Cytochrome b/b6 domain protein  31.53 
 
 		 422 aa  100  8e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3538  cytochrome b6  27.98 
 
 		 222 aa  99.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0136  Cytochrome b/b6 domain  28 
 
 		 466 aa  99.8  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.153935 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3240  cytochrome c1  25.94 
 
 		 688 aa  99.4  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2576  cytochrome b6  27.98 
 
 		 222 aa  99.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.953247 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1703  cytochrome b/b6 domain-containing protein  28.51 
 
 		 215 aa  99  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3277  cytochrome b  26.13 
 
 		 449 aa  98.6  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2543  cytochrome b/b6 domain-containing protein  26.54 
 
 		 430 aa  99  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.271762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1702  cytochrome b6  29.36 
 
 		 218 aa  98.6  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1832  cytochrome B subunit of cytochrome bc1  27.67 
 
 		 410 aa  99  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.255708  normal  0.197515 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15680  cytochrome b subunit of the bc complex  25.98 
 
 		 566 aa  98.6  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2766  Cytochrome b/b6 domain  26.54 
 
 		 430 aa  99  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.447139 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04171  cytochrome b6  29.36 
 
 		 218 aa  98.6  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.576344 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1825  cytochrome b/b6 domain protein  30.65 
 
 		 522 aa  99  2e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03511  cytochrome b6  29.82 
 
 		 218 aa  98.6  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3097  Cytochrome b/b6 domain protein  31.56 
 
 		 267 aa  98.2  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3441  cytochrome b6  28.05 
 
 		 215 aa  98.2  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00977243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03491  cytochrome b6  29.82 
 
 		 218 aa  98.6  3e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.499188  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0369  cytochrome b/b6 domain-containing protein  28.48 
 
 		 460 aa  98.2  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.723254 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5502  cytochrome b/b6 domain-containing protein  26.61 
 
 		 471 aa  98.6  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189406 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0360  cytochrome b/b6 domain-containing protein  28.48 
 
 		 460 aa  98.2  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0523678  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0485  cytochrome b6  28.44 
 
 		 218 aa  97.8  4e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.153664  normal  0.560509 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0362  Cytochrome b/b6 domain  29.12 
 
 		 429 aa  97.8  4e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000296669  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1849  cytochrome b6  28.44 
 
 		 218 aa  97.4  5e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.434753  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0331  cytochrome b6  29.82 
 
 		 218 aa  97.4  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0363  cytochrome b/b6-like  25.18 
 
 		 405 aa  97.4  5e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402097  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03571  cytochrome b6  29.36 
 
 		 218 aa  97.4  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.223543  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0345  cytochrome b/b6 domain-containing protein  27.86 
 
 		 459 aa  97.4  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03611  cytochrome b6  28.44 
 
 		 218 aa  97.1  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6797  cytochrome b/b6 domain-containing protein  25.7 
 
 		 420 aa  96.7  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0708619  normal  0.644393 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0647  Cytochrome b/b6 domain protein  32.24 
 
 		 269 aa  97.1  8e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.334233  normal  0.148451 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1395  cytochrome b  27.72 
 
 		 445 aa  96.7  8e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0062  cytochrome b/b6 domain-containing protein  27.72 
 
 		 445 aa  97.1  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.422457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2665  cytochrome b/b6-like  27.3 
 
 		 460 aa  96.7  9e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.628042  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1137  cytochrome b6  29.17 
 
 		 222 aa  96.7  9e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00720211 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0421  cytochrome b/b6 domain-containing protein  27.3 
 
 		 460 aa  96.3  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000270463 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16210  cytochrome b subunit of the bc complex  24.49 
 
 		 581 aa  95.9  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.180009  normal  0.762158 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0442  cytochrome b/b6 domain-containing protein  27.3 
 
 		 460 aa  96.3  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1433  cytochrome b6  26.78 
 
 		 224 aa  95.5  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0673238  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1686  cytochrome b6  26.78 
 
 		 224 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7536  Cytochrome b/b6 domain protein  26.54 
 
 		 428 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0448545  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1247  cytochrome b6  26.78 
 
 		 224 aa  95.5  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.363884  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3766  cytochrome b6  26.78 
 
 		 224 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2802  cytochrome b/b6 domain-containing protein  26.88 
 
 		 445 aa  95.5  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.387629  normal  0.411139 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0578  Cytochrome b/b6 domain protein  29.58 
 
 		 267 aa  95.9  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.101746  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>