293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0621 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_0621  Cytochrome b/b6 domain protein  100 
 
 		 536 aa  1063    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0500  cytochrome b/b6 domain-containing protein  68.88 
 
 		 548 aa  730    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.847294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0291  cytochrome b/b6 domain-containing protein  43.04 
 
 		 562 aa  425  1e-117  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0120651  normal  0.455263 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0466  Cytochrome b/b6 domain protein  44.14 
 
 		 557 aa  398  1e-109  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.312063  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1912  cytochrome b/b6 domain-containing protein  42.63 
 
 		 471 aa  326  5e-88  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.541512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1939  cytochrome b/b6 domain-containing protein  47.47 
 
 		 514 aa  300  4e-80  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0570321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0321  cytochrome b/b6 domain-containing protein  31.04 
 
 		 510 aa  181  2.9999999999999997e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0762  Cytochrome b/b6 domain protein  32.49 
 
 		 510 aa  178  2e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.294721  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3174  Cytochrome b/b6 domain protein  26.93 
 
 		 367 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1649  cytochrome b/b6  28.23 
 
 		 367 aa  114  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2958  cytochrome b/b6 domain-containing protein  28.53 
 
 		 424 aa  114  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.449932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1923  cytochrome b/b6-like  27.49 
 
 		 367 aa  113  9e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.08033  normal  0.565515 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2543  cytochrome b/b6 domain-containing protein  29.56 
 
 		 430 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.271762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2766  Cytochrome b/b6 domain  29.56 
 
 		 430 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.447139 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1201  cytochrome c1  28.49 
 
 		 689 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1986  Cytochrome b/b6 domain  28.18 
 
 		 431 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.282251  normal  0.259595 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0464  cytochrome b/b6 domain-containing protein  29.3 
 
 		 428 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.524709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1779  Cytochrome b/b6 domain  28.73 
 
 		 422 aa  111  4.0000000000000004e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.484297  decreased coverage  0.00239788 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2471  Cytochrome b/b6 domain  28.73 
 
 		 430 aa  110  8.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0219916 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1303  cytochrome c1  28.96 
 
 		 689 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0362  Cytochrome b/b6 domain  36 
 
 		 429 aa  108  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000296669  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6797  cytochrome b/b6 domain-containing protein  29.64 
 
 		 420 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0708619  normal  0.644393 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2301  cytochrome b/c1  29.94 
 
 		 688 aa  109  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0430  cytochrome b/b6 domain-containing protein  35.23 
 
 		 431 aa  108  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00372181  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7536  Cytochrome b/b6 domain protein  30.19 
 
 		 428 aa  108  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0448545  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1385  cytochrome c1  29.21 
 
 		 688 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2380  cytochrome b/b6 domain-containing protein  27.04 
 
 		 367 aa  107  7e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00314618  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0467  Cytochrome b/b6 domain  35.06 
 
 		 421 aa  107  7e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.776712  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1087  cytochrome b/b6 domain protein  27.2 
 
 		 367 aa  106  9e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0395  cytochrome b-c complex, cytochrome b subunit  34.22 
 
 		 426 aa  106  1e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.488441  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0925  cytochrome c1  29.14 
 
 		 690 aa  106  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3204  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome b subunit  28.08 
 
 		 422 aa  105  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.545864  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0677  cytochrome b/b6-like  27.44 
 
 		 429 aa  105  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.206684  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3240  cytochrome c1  29.05 
 
 		 688 aa  104  5e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2616  cytochrome c1  29.46 
 
 		 687 aa  103  6e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.634521  normal  0.325896 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0702  cytochrome b/b6 domain-containing protein  27.22 
 
 		 439 aa  103  8e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0895628  normal  0.934127 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1543  cytochrome b/b6 domain-containing protein  26.78 
 
 		 531 aa  103  1e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000370205 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2331  cytochrome b6  29.52 
 
 		 215 aa  102  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.520251 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2108  cytochrome b/b6 domain-containing protein  25.83 
 
 		 410 aa  102  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0919786  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1718  cytochrome b-c complex, cytochrome b subunit  33.91 
 
 		 429 aa  101  3e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000000282994  normal  0.360992 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0155  cytochrome b/b6 domain-containing protein  26.97 
 
 		 418 aa  101  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.252364 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1703  cytochrome b/b6 domain-containing protein  30 
 
 		 215 aa  100  6e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0357  cytochrome b/b6 domain-containing protein  28.34 
 
 		 401 aa  100  7e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000177804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2251  cytochrome b6  29.38 
 
 		 222 aa  100  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00036602 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1686  cytochrome b6  31.22 
 
 		 224 aa  100  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3766  cytochrome b6  31.22 
 
 		 224 aa  100  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2777  Cytochrome b/b6 domain  27.12 
 
 		 426 aa  99.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127052  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1650  cytochrome b6  31.22 
 
 		 224 aa  100  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1433  cytochrome b6  31.22 
 
 		 224 aa  100  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0673238  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1405  cytochrome b6  31.22 
 
 		 224 aa  100  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1405  cytochrome b6  31.22 
 
 		 224 aa  100  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00694033  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1617  cytochrome b6  31.22 
 
 		 224 aa  100  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.11169 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1579  cytochrome b6  31.22 
 
 		 224 aa  100  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1448  cytochrome b6  31.22 
 
 		 224 aa  100  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.227629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1545  cytochrome b6  31.22 
 
 		 224 aa  100  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1344  cytochrome b/b6-like protein  29.95 
 
 		 426 aa  99.8  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.179671  normal  0.0287438 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1247  cytochrome b6  31.22 
 
 		 224 aa  100  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.363884  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1702  cytochrome b6  28.91 
 
 		 218 aa  99  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3441  cytochrome b6  29.52 
 
 		 215 aa  99  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00977243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0331  cytochrome b6  28.91 
 
 		 218 aa  99  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2243  cytochrome b/b6 domain-containing protein  26.67 
 
 		 425 aa  99.4  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0363232  normal  0.819807 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03571  cytochrome b6  28.91 
 
 		 218 aa  99  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.223543  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2813  cytochrome b/b6-like  27.59 
 
 		 442 aa  99  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.668626  normal  0.273997 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04171  cytochrome b6  28.91 
 
 		 218 aa  99  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.576344 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3934  cytochrome b/b6 domain-containing protein  25.45 
 
 		 470 aa  97.8  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.930793 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3041  Cytochrome b/b6 domain protein  25.85 
 
 		 422 aa  97.8  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568197  normal  0.966888 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0126  cytochrome b/b6 domain-containing protein  27.51 
 
 		 466 aa  97.1  7e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.469556  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03511  cytochrome b6  28.44 
 
 		 218 aa  97.1  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0737  cytochrome b/b6  27 
 
 		 428 aa  97.1  7e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.113656 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03491  cytochrome b6  28.44 
 
 		 218 aa  97.1  7e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.499188  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03611  cytochrome b6  28.44 
 
 		 218 aa  96.7  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2347  cytochrome b6  28.3 
 
 		 222 aa  97.1  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3544  cytochrome b/b6 domain-containing protein  27.11 
 
 		 488 aa  97.1  8e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.148449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2873  fused ubiquinol-cytochrome c reductase and cytochrome b/b6  26.94 
 
 		 426 aa  96.3  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00318002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5502  cytochrome b/b6 domain-containing protein  29.84 
 
 		 471 aa  95.9  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189406 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0470  Cytochrome b/b6 domain protein  35.1 
 
 		 425 aa  96.3  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0625  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  28.75 
 
 		 410 aa  96.3  1e-18  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.393492  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21851  cytochrome b6  28.77 
 
 		 218 aa  96.3  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.396242 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3800  Cytochrome b/b6 domain protein  26.04 
 
 		 417 aa  96.7  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.306373 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0485  cytochrome b6  28.44 
 
 		 218 aa  95.9  2e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.153664  normal  0.560509 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0822  cytochrome b/b6-like  24.93 
 
 		 466 aa  95.5  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.887909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4252  cytochrome b/b6 domain-containing protein  26.28 
 
 		 562 aa  95.1  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000252204  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1961  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome B  25.33 
 
 		 459 aa  94.7  4e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1139  Cytochrome b/b6 domain protein  27.64 
 
 		 403 aa  94.4  4e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.222795  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1849  cytochrome b6  27.96 
 
 		 218 aa  94.4  5e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.434753  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5927  Cytochrome b/b6 domain protein  34.93 
 
 		 268 aa  94  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2130  cytochrome b6  30.32 
 
 		 224 aa  93.6  7e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000123643  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2306  cytochrome b/b6 domain-containing protein  25.27 
 
 		 440 aa  94  7e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226974  normal  0.0553063 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0136  Cytochrome b/b6 domain  28.05 
 
 		 466 aa  93.6  8e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.153935 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1395  cytochrome b/b6 domain-containing protein  25.27 
 
 		 421 aa  93.6  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.935928  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1454  Cytochrome b/b6 domain protein  25.59 
 
 		 394 aa  93.6  8e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000126052  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0489  cytochrome b6  29.86 
 
 		 224 aa  93.2  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0850  cytochrome B  26.15 
 
 		 466 aa  92.8  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.833768 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1540  cytochrome b/b6 domain-containing protein  26.07 
 
 		 426 aa  92.8  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal  0.652412 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1395  cytochrome b  27.36 
 
 		 445 aa  92.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0062  cytochrome b/b6 domain-containing protein  27.36 
 
 		 445 aa  92.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.422457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0326  cytochrome b/b6-like  27.45 
 
 		 451 aa  92.4  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.756049 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0345  cytochrome b/b6 domain-containing protein  23.82 
 
 		 459 aa  91.7  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0753  Cytochrome b/b6 domain protein  25.84 
 
 		 473 aa  92  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0369  cytochrome b/b6 domain-containing protein  23.82 
 
 		 460 aa  91.7  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.723254 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>