282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1543 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1543  cytochrome b/b6 domain-containing protein  100 
 
 		 531 aa  1072    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000370205 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1779  Cytochrome b/b6 domain  30.18 
 
 		 422 aa  124  5e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.484297  decreased coverage  0.00239788 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1986  Cytochrome b/b6 domain  30.49 
 
 		 431 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.282251  normal  0.259595 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4252  cytochrome b/b6 domain-containing protein  27.62 
 
 		 562 aa  116  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000252204  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1703  cytochrome b/b6 domain-containing protein  35.05 
 
 		 215 aa  114  5e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3441  cytochrome b6  35.05 
 
 		 215 aa  114  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00977243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2576  cytochrome b6  35.05 
 
 		 222 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.953247 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2331  cytochrome b6  34.02 
 
 		 215 aa  112  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.520251 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3538  cytochrome b6  35.05 
 
 		 222 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2108  cytochrome b/b6 domain-containing protein  37.36 
 
 		 410 aa  109  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0919786  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0430  cytochrome b/b6 domain-containing protein  28.62 
 
 		 431 aa  109  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00372181  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2347  cytochrome b6  32.99 
 
 		 222 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2251  cytochrome b6  34.48 
 
 		 222 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00036602 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0395  cytochrome b-c complex, cytochrome b subunit  28.92 
 
 		 426 aa  107  4e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.488441  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2130  cytochrome b6  35 
 
 		 224 aa  107  5e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000123643  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0489  cytochrome b6  35 
 
 		 224 aa  106  9e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21851  cytochrome b6  30.93 
 
 		 218 aa  106  9e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.396242 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1617  cytochrome b6  35.71 
 
 		 224 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.11169 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1650  cytochrome b6  35.71 
 
 		 224 aa  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1448  cytochrome b6  35.71 
 
 		 224 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.227629  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1433  cytochrome b6  35.71 
 
 		 224 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0673238  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1405  cytochrome b6  35.71 
 
 		 224 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1405  cytochrome b6  35.71 
 
 		 224 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00694033  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1247  cytochrome b6  35.71 
 
 		 224 aa  105  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.363884  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1545  cytochrome b6  35.71 
 
 		 224 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3766  cytochrome b6  35.71 
 
 		 224 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1579  cytochrome b6  35.71 
 
 		 224 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1686  cytochrome b6  35.71 
 
 		 224 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1137  cytochrome b6  35.06 
 
 		 222 aa  106  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00720211 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0331  cytochrome b6  32.76 
 
 		 218 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3893  Cytochrome b/b6 domain protein  28.16 
 
 		 575 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.290413  normal  0.541896 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03611  cytochrome b6  32.76 
 
 		 218 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04171  cytochrome b6  32.18 
 
 		 218 aa  105  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.576344 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1702  cytochrome b6  32.18 
 
 		 218 aa  105  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03491  cytochrome b6  32.76 
 
 		 218 aa  104  3e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.499188  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03571  cytochrome b6  32.18 
 
 		 218 aa  105  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.223543  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03511  cytochrome b6  32.76 
 
 		 218 aa  104  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1849  cytochrome b6  32.76 
 
 		 218 aa  104  4e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.434753  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1718  cytochrome b-c complex, cytochrome b subunit  27.83 
 
 		 429 aa  103  7e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000000282994  normal  0.360992 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2472  Cytochrome b/b6 domain protein  24.35 
 
 		 464 aa  103  7e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0485  cytochrome b6  32.18 
 
 		 218 aa  103  9e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.153664  normal  0.560509 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0467  Cytochrome b/b6 domain  28.05 
 
 		 421 aa  101  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.776712  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3544  cytochrome b/b6 domain-containing protein  36.16 
 
 		 488 aa  99.4  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.148449  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0621  Cytochrome b/b6 domain protein  24 
 
 		 536 aa  99.8  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2380  cytochrome b/b6 domain-containing protein  25.91 
 
 		 367 aa  99  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00314618  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2218  Cytochrome b/b6 domain protein  25.69 
 
 		 469 aa  99  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.905711  normal  0.211353 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2932  cytochrome b/b6  36.47 
 
 		 206 aa  98.2  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1923  cytochrome b/b6-like  26.97 
 
 		 367 aa  98.2  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.08033  normal  0.565515 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5927  Cytochrome b/b6 domain protein  33.93 
 
 		 268 aa  98.2  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0647  Cytochrome b/b6 domain protein  35.91 
 
 		 269 aa  98.2  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.334233  normal  0.148451 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0198  cytochrome b/b6 domain-containing protein  34.48 
 
 		 251 aa  97.8  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0362  Cytochrome b/b6 domain  28.13 
 
 		 429 aa  97.4  6e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000296669  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1534  Cytochrome b/b6 domain  29.08 
 
 		 400 aa  96.3  1e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000678475  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3097  Cytochrome b/b6 domain protein  35.2 
 
 		 267 aa  96.3  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3174  Cytochrome b/b6 domain protein  35.33 
 
 		 367 aa  95.1  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0578  Cytochrome b/b6 domain protein  35.75 
 
 		 267 aa  95.5  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.101746  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0925  cytochrome c1  25.29 
 
 		 690 aa  95.1  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0470  Cytochrome b/b6 domain protein  26.37 
 
 		 425 aa  94  6e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3253  Cytochrome b/b6 domain  31.35 
 
 		 557 aa  93.6  8e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.510531  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0511  cytochrome b/b6  24.93 
 
 		 408 aa  92.8  1e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000312335  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0500  cytochrome b/b6 domain-containing protein  26.44 
 
 		 548 aa  92.8  1e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.847294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1449  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  33.14 
 
 		 415 aa  93.2  1e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1303  cytochrome c1  26.56 
 
 		 689 aa  92  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0750  Cytochrome b/b6 domain protein  27.74 
 
 		 464 aa  91.3  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0241162  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1087  cytochrome b/b6 domain protein  34.81 
 
 		 367 aa  90.9  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2119  cytochrome b/b6-like  37.65 
 
 		 247 aa  90.1  8e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.940192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0904  cytochrome b/b6 domain-containing protein  30.61 
 
 		 403 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.168662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0243  Cytochrome b/b6 domain-containing protein  25.41 
 
 		 429 aa  89.7  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0445  cytochrome b/b6 domain-containing protein  25.16 
 
 		 358 aa  89.7  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1649  cytochrome b/b6  28.4 
 
 		 367 aa  89  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1385  cytochrome c1  26.87 
 
 		 688 aa  89  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2301  cytochrome b/c1  26.49 
 
 		 688 aa  88.6  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1832  Cytochrome b/b6 domain protein  31.79 
 
 		 418 aa  88.6  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.485298  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0741  Cytochrome b/b6 domain protein  31.79 
 
 		 418 aa  88.6  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13070  Cytochrome b/b6  30.61 
 
 		 403 aa  89.4  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4024  cytochrome b/b6 domain protein  31.76 
 
 		 206 aa  89  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0022  Cytochrome b/b6 domain protein  31.52 
 
 		 472 aa  88.6  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401541  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0298  cytochrome b/b6-like  32.56 
 
 		 408 aa  88.2  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.349609  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2469  cytochrome b/b6 domain-containing protein  31.69 
 
 		 410 aa  87.8  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00715647  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1333  Cytochrome b/b6 domain protein  30.81 
 
 		 488 aa  87.8  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.706322 
 
 
-
 
NC_002978  WD1071  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  24.06 
 
 		 409 aa  87.4  5e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4115  Cytochrome b/b6 domain protein  31.76 
 
 		 206 aa  87.8  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.665119 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4691  cytochrome b/b6-like  30.61 
 
 		 403 aa  87.4  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.49849  normal  0.0253809 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1096  ubiquinol cytochrome c oxidoreductase, cytochrome b subunit  35.5 
 
 		 414 aa  87.4  6e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2210  cytochrome b/b6  32.39 
 
 		 413 aa  87.4  6e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.226305  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1318  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b  31.76 
 
 		 403 aa  87  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.503431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4406  cytochrome b/b6 domain-containing protein  31.76 
 
 		 404 aa  87  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.232418 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57560  putative cytochrome b  32.35 
 
 		 403 aa  87  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.1208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4531  cytochrome b/b6 domain-containing protein  31.76 
 
 		 404 aa  87  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2873  fused ubiquinol-cytochrome c reductase and cytochrome b/b6  25.66 
 
 		 426 aa  87  7e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00318002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5002  putative cytochrome b  32.35 
 
 		 403 aa  87  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0257192  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0925  cytochrome b/b6 domain-containing protein  31.76 
 
 		 404 aa  87  8e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2243  cytochrome b/b6 domain-containing protein  29.14 
 
 		 425 aa  86.7  9e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0363232  normal  0.819807 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0822  cytochrome b/b6-like  32.37 
 
 		 466 aa  86.7  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.887909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1237  cytochrome B  35.9 
 
 		 419 aa  86.7  0.000000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1554  Cytochrome b/b6 domain protein  32.05 
 
 		 451 aa  85.9  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2616  cytochrome c1  26.69 
 
 		 687 aa  85.9  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.634521  normal  0.325896 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0363  cytochrome b/b6-like  27.3 
 
 		 405 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402097  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2404  cytochrome b/b6-like  32.05 
 
 		 451 aa  85.5  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0850  cytochrome B  28.98 
 
 		 466 aa  85.9  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.833768 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>