283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2674 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2674  Cytochrome b subunit of the bc complex-like protein  100 
 
 
545 aa  1103    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.896825 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3060  Cytochrome b/b6 domain protein  62.79 
 
 
553 aa  696    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00152334  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8374  Cytochrome b subunit of the bc complex-like protein  96.69 
 
 
545 aa  1034    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1293  cytochrome b/b6 domain-containing protein  74.37 
 
 
542 aa  776    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.327176 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1680  cytochrome b/b6 domain protein  54.03 
 
 
543 aa  589  1e-167  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.76361 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3132  Cytochrome b/b6 domain protein  53.99 
 
 
551 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2078  Cytochrome b/b6 domain protein  52.78 
 
 
583 aa  574  1.0000000000000001e-162  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2212  cytochrome b/b6-like protein  51.96 
 
 
561 aa  570  1e-161  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.184227  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1949  Cytochrome b/b6 domain protein  51.78 
 
 
556 aa  567  1e-160  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000732927 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1019  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  54.93 
 
 
548 aa  561  1.0000000000000001e-159  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.110557  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1812  cytochrome b/b6 domain-containing protein  51.49 
 
 
546 aa  557  1e-157  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.666264  normal  0.116322 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0554  Cytochrome b/b6 domain protein  54.69 
 
 
551 aa  557  1e-157  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0961  cytochrome b/b6 domain-containing protein  53.42 
 
 
568 aa  557  1e-157  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0908958  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15680  cytochrome b subunit of the bc complex  50.55 
 
 
566 aa  552  1e-156  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3253  Cytochrome b/b6 domain  50.55 
 
 
557 aa  549  1e-155  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.510531  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1889  Cytochrome b/b6 domain protein  51.97 
 
 
580 aa  550  1e-155  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.271737  hitchhiker  0.00145846 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3137  cytochrome b/b6 domain-containing protein  52.98 
 
 
582 aa  550  1e-155  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3105  cytochrome b/b6-like  55.77 
 
 
527 aa  547  1e-154  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.041819  normal  0.378798 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2011  Cytochrome b/b6 domain protein  50.91 
 
 
575 aa  544  1e-153  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.802913  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2953  cytochrome b/b6 domain-containing protein  50.93 
 
 
557 aa  526  1e-148  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3617  Cytochrome b/b6 domain protein  56.95 
 
 
537 aa  525  1e-148  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12150  cytochrome b subunit of the bc complex  47.03 
 
 
564 aa  528  1e-148  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145352  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1449  cytochrome b/b6 domain protein  50.46 
 
 
547 aa  526  1e-148  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0373061  normal  0.0523763 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3343  Cytochrome b/b6 domain protein  58.98 
 
 
553 aa  528  1e-148  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3560  cytochrome b/b6 domain-containing protein  56.44 
 
 
549 aa  526  1e-148  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.723274  normal  0.0825671 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3058  Cytochrome b/b6 domain protein  54.8 
 
 
539 aa  523  1e-147  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.489996  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3251  Cytochrome b/b6 domain protein  54.85 
 
 
542 aa  514  1e-144  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00015741  decreased coverage  0.00000907942 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16210  cytochrome b subunit of the bc complex  49.62 
 
 
581 aa  509  1e-143  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.180009  normal  0.762158 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1376  cytochrome b/b6 domain protein  53.45 
 
 
564 aa  508  1e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131077  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4117  Cytochrome b/b6 domain-containing protein  55.92 
 
 
532 aa  509  1e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.358172 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12224  ubiquinol-cytochrome C reductase qcrB (cytochrome B subunit)  55.03 
 
 
549 aa  510  1e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3305  cytochrome b/b6 domain-containing protein  56.11 
 
 
558 aa  507  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.216309  normal  0.394132 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2695  Cytochrome b/b6 domain protein  52.4 
 
 
541 aa  506  9.999999999999999e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.692335  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3294  cytochrome b/b6-like protein  56.11 
 
 
558 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.550671  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3356  cytochrome b/b6 domain-containing protein  56.11 
 
 
558 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.162526  normal  0.0239806 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3292  cytochrome b/b6 domain-containing protein  56.95 
 
 
536 aa  503  1e-141  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.632763 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3524  cytochrome b/b6 domain-containing protein  57.4 
 
 
536 aa  501  1e-141  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10700  cytochrome b subunit of the bc complex  54.41 
 
 
555 aa  499  1e-140  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.797183  normal  0.372195 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14160  cytochrome b subunit of the bc complex  48.5 
 
 
559 aa  491  1e-137  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.409631  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2489  cytochrome b/b6-like  54.22 
 
 
535 aa  468  9.999999999999999e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.613935  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1825  cytochrome b/b6 domain protein  49.57 
 
 
522 aa  463  1e-129  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2472  Cytochrome b/b6 domain protein  37.82 
 
 
464 aa  235  2.0000000000000002e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255761  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1333  Cytochrome b/b6 domain protein  35.71 
 
 
488 aa  234  4.0000000000000004e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.706322 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0319  cytochrome b/b6-like protein  35.75 
 
 
437 aa  224  4e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0663276  decreased coverage  0.00372414 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0243  Cytochrome b/b6 domain-containing protein  33.79 
 
 
429 aa  213  7e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0022  Cytochrome b/b6 domain protein  31.44 
 
 
472 aa  213  7e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401541  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0470  Cytochrome b/b6 domain protein  32.62 
 
 
425 aa  203  6e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0647  Cytochrome b/b6 domain protein  38.22 
 
 
269 aa  133  6.999999999999999e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.334233  normal  0.148451 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3544  cytochrome b/b6 domain-containing protein  28.33 
 
 
488 aa  132  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.148449  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0578  Cytochrome b/b6 domain protein  36.27 
 
 
267 aa  130  5.0000000000000004e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.101746  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3097  Cytochrome b/b6 domain protein  36.79 
 
 
267 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1702  cytochrome b6  31.65 
 
 
218 aa  129  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03611  cytochrome b6  32.11 
 
 
218 aa  129  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04171  cytochrome b6  31.65 
 
 
218 aa  129  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.576344 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03511  cytochrome b6  31.86 
 
 
218 aa  128  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1849  cytochrome b6  34.74 
 
 
218 aa  128  2.0000000000000002e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.434753  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03491  cytochrome b6  31.86 
 
 
218 aa  128  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.499188  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21851  cytochrome b6  34.74 
 
 
218 aa  129  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.396242 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2576  cytochrome b6  32.57 
 
 
222 aa  128  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.953247 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0485  cytochrome b6  34.74 
 
 
218 aa  128  3e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.153664  normal  0.560509 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3538  cytochrome b6  32.57 
 
 
222 aa  128  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0331  cytochrome b6  31.86 
 
 
218 aa  127  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03571  cytochrome b6  31.08 
 
 
218 aa  127  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.223543  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3441  cytochrome b6  31.84 
 
 
215 aa  126  9e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00977243  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1703  cytochrome b/b6 domain-containing protein  31.84 
 
 
215 aa  126  9e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2347  cytochrome b6  34.74 
 
 
222 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2251  cytochrome b6  30.18 
 
 
222 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00036602 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5927  Cytochrome b/b6 domain protein  33.94 
 
 
268 aa  125  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2331  cytochrome b6  30.94 
 
 
215 aa  124  5e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.520251 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1923  cytochrome b/b6-like  28.35 
 
 
367 aa  123  8e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.08033  normal  0.565515 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1137  cytochrome b6  31.65 
 
 
222 aa  123  8e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00720211 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1986  Cytochrome b/b6 domain  31.73 
 
 
431 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.282251  normal  0.259595 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1617  cytochrome b6  29.65 
 
 
224 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.11169 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1650  cytochrome b6  29.65 
 
 
224 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1433  cytochrome b6  29.65 
 
 
224 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0673238  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1405  cytochrome b6  29.65 
 
 
224 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1405  cytochrome b6  29.65 
 
 
224 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00694033  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1448  cytochrome b6  29.65 
 
 
224 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.227629  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1579  cytochrome b6  29.65 
 
 
224 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3766  cytochrome b6  29.65 
 
 
224 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1545  cytochrome b6  29.65 
 
 
224 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1686  cytochrome b6  29.65 
 
 
224 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1247  cytochrome b6  29.65 
 
 
224 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.363884  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0489  cytochrome b6  28.76 
 
 
224 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0810  cytochrome b/b6, N-terminal:cytochrome b/b6, C-terminal  28.05 
 
 
433 aa  114  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000295618  hitchhiker  0.00000153677 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2130  cytochrome b6  28.76 
 
 
224 aa  115  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000123643  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3893  Cytochrome b/b6 domain protein  27.42 
 
 
575 aa  114  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.290413  normal  0.541896 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1779  Cytochrome b/b6 domain  30.12 
 
 
422 aa  112  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.484297  decreased coverage  0.00239788 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0822  cytochrome b/b6-like  26.6 
 
 
466 aa  112  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.887909  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4024  cytochrome b/b6 domain protein  37.62 
 
 
206 aa  109  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2380  cytochrome b/b6 domain-containing protein  28.49 
 
 
367 aa  108  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00314618  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0850  cytochrome B  27.02 
 
 
466 aa  108  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.833768 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2210  cytochrome b/b6  25.66 
 
 
413 aa  107  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.226305  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4115  Cytochrome b/b6 domain protein  37.62 
 
 
206 aa  107  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.665119 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0750  Cytochrome b/b6 domain protein  27.86 
 
 
464 aa  107  8e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0241162  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0467  Cytochrome b/b6 domain  31.27 
 
 
421 aa  105  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.776712  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1139  Cytochrome b/b6 domain protein  27.39 
 
 
403 aa  106  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.222795  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3934  cytochrome b/b6 domain-containing protein  25.63 
 
 
470 aa  105  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.930793 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1649  cytochrome b/b6  28.88 
 
 
367 aa  105  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1832  cytochrome B subunit of cytochrome bc1  26.09 
 
 
410 aa  105  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.255708  normal  0.197515 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>