284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12224 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3617  Cytochrome b/b6 domain protein  68.09 
 
 
537 aa  759    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2953  cytochrome b/b6 domain-containing protein  80.55 
 
 
557 aa  894    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3305  cytochrome b/b6 domain-containing protein  81.14 
 
 
558 aa  852    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.216309  normal  0.394132 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1376  cytochrome b/b6 domain protein  67.74 
 
 
564 aa  713    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131077  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2695  Cytochrome b/b6 domain protein  69.17 
 
 
541 aa  803    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.692335  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3294  cytochrome b/b6-like protein  81.32 
 
 
558 aa  852    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.550671  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10700  cytochrome b subunit of the bc complex  67.57 
 
 
555 aa  728    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.797183  normal  0.372195 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3251  Cytochrome b/b6 domain protein  61.29 
 
 
542 aa  658    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00015741  decreased coverage  0.00000907942 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12224  ubiquinol-cytochrome C reductase qcrB (cytochrome B subunit)  100 
 
 
549 aa  1107    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3058  Cytochrome b/b6 domain protein  70 
 
 
539 aa  801    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.489996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3356  cytochrome b/b6 domain-containing protein  81.32 
 
 
558 aa  852    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.162526  normal  0.0239806 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3560  cytochrome b/b6 domain-containing protein  80.62 
 
 
549 aa  875    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.723274  normal  0.0825671 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3343  Cytochrome b/b6 domain protein  58.29 
 
 
553 aa  611  1e-173  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1812  cytochrome b/b6 domain-containing protein  56.05 
 
 
546 aa  599  1e-170  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.666264  normal  0.116322 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4117  Cytochrome b/b6 domain-containing protein  55.17 
 
 
532 aa  596  1e-169  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.358172 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3105  cytochrome b/b6-like  60.22 
 
 
527 aa  579  1e-164  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.041819  normal  0.378798 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3292  cytochrome b/b6 domain-containing protein  56.95 
 
 
536 aa  559  1e-158  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.632763 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3524  cytochrome b/b6 domain-containing protein  57.77 
 
 
536 aa  552  1e-156  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2674  Cytochrome b subunit of the bc complex-like protein  55.03 
 
 
545 aa  519  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.896825 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8374  Cytochrome b subunit of the bc complex-like protein  54.11 
 
 
545 aa  493  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3060  Cytochrome b/b6 domain protein  49.8 
 
 
553 aa  490  1e-137  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00152334  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0961  cytochrome b/b6 domain-containing protein  53.35 
 
 
568 aa  489  1e-137  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0908958  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3253  Cytochrome b/b6 domain  48.85 
 
 
557 aa  485  1e-136  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.510531  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1680  cytochrome b/b6 domain protein  49.4 
 
 
543 aa  482  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.76361 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2212  cytochrome b/b6-like protein  50.61 
 
 
561 aa  483  1e-135  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.184227  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1293  cytochrome b/b6 domain-containing protein  55.17 
 
 
542 aa  480  1e-134  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.327176 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3137  cytochrome b/b6 domain-containing protein  54.77 
 
 
582 aa  481  1e-134  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14160  cytochrome b subunit of the bc complex  48.34 
 
 
559 aa  477  1e-133  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.409631  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1889  Cytochrome b/b6 domain protein  51.99 
 
 
580 aa  476  1e-133  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.271737  hitchhiker  0.00145846 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15680  cytochrome b subunit of the bc complex  50 
 
 
566 aa  477  1e-133  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2078  Cytochrome b/b6 domain protein  49.08 
 
 
583 aa  472  1e-132  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2489  cytochrome b/b6-like  56.92 
 
 
535 aa  472  1e-132  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.613935  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1949  Cytochrome b/b6 domain protein  48.33 
 
 
556 aa  471  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000732927 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2011  Cytochrome b/b6 domain protein  52.48 
 
 
575 aa  470  1.0000000000000001e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.802913  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16210  cytochrome b subunit of the bc complex  49.34 
 
 
581 aa  457  1e-127  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.180009  normal  0.762158 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1019  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  54.07 
 
 
548 aa  455  1.0000000000000001e-126  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.110557  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1449  cytochrome b/b6 domain protein  50.87 
 
 
547 aa  451  1e-125  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0373061  normal  0.0523763 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3132  Cytochrome b/b6 domain protein  51.3 
 
 
551 aa  450  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12150  cytochrome b subunit of the bc complex  48.76 
 
 
564 aa  446  1.0000000000000001e-124  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145352  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1825  cytochrome b/b6 domain protein  52.61 
 
 
522 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0554  Cytochrome b/b6 domain protein  49.09 
 
 
551 aa  434  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1333  Cytochrome b/b6 domain protein  35.06 
 
 
488 aa  234  3e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.706322 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2472  Cytochrome b/b6 domain protein  35.18 
 
 
464 aa  234  4.0000000000000004e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255761  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0022  Cytochrome b/b6 domain protein  33.03 
 
 
472 aa  216  9e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401541  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0319  cytochrome b/b6-like protein  35.7 
 
 
437 aa  194  3e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0663276  decreased coverage  0.00372414 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0243  Cytochrome b/b6 domain-containing protein  35.11 
 
 
429 aa  187  4e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0470  Cytochrome b/b6 domain protein  32.3 
 
 
425 aa  185  2.0000000000000003e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5927  Cytochrome b/b6 domain protein  36.41 
 
 
268 aa  124  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0647  Cytochrome b/b6 domain protein  33.33 
 
 
269 aa  120  7.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.334233  normal  0.148451 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0578  Cytochrome b/b6 domain protein  32.51 
 
 
267 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.101746  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3097  Cytochrome b/b6 domain protein  35.35 
 
 
267 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3544  cytochrome b/b6 domain-containing protein  30.07 
 
 
488 aa  109  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.148449  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4115  Cytochrome b/b6 domain protein  35.43 
 
 
206 aa  106  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.665119 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4024  cytochrome b/b6 domain protein  34.98 
 
 
206 aa  105  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2331  cytochrome b6  28.9 
 
 
215 aa  100  6e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.520251 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2119  cytochrome b/b6-like  28.94 
 
 
247 aa  100  8e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.940192  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3538  cytochrome b6  27.27 
 
 
222 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2576  cytochrome b6  27.27 
 
 
222 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.953247 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21851  cytochrome b6  27.06 
 
 
218 aa  97.4  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.396242 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03611  cytochrome b6  26.61 
 
 
218 aa  97.1  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1849  cytochrome b6  27.06 
 
 
218 aa  97.1  8e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.434753  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3441  cytochrome b6  28.44 
 
 
215 aa  96.7  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00977243  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1703  cytochrome b/b6 domain-containing protein  28.44 
 
 
215 aa  96.3  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0485  cytochrome b6  26.61 
 
 
218 aa  96.3  1e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.153664  normal  0.560509 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2251  cytochrome b6  26.61 
 
 
222 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00036602 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04171  cytochrome b6  26.15 
 
 
218 aa  95.9  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.576344 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1702  cytochrome b6  26.15 
 
 
218 aa  95.9  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0331  cytochrome b6  28.22 
 
 
218 aa  95.5  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03511  cytochrome b6  28.22 
 
 
218 aa  95.1  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03491  cytochrome b6  28.22 
 
 
218 aa  95.1  3e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.499188  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03571  cytochrome b6  27.72 
 
 
218 aa  94.7  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.223543  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2130  cytochrome b6  27.6 
 
 
224 aa  94.4  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000123643  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0489  cytochrome b6  27.6 
 
 
224 aa  94  7e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1650  cytochrome b6  26.56 
 
 
224 aa  93.6  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1579  cytochrome b6  26.56 
 
 
224 aa  93.6  8e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1433  cytochrome b6  26.56 
 
 
224 aa  93.6  8e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0673238  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1405  cytochrome b6  26.56 
 
 
224 aa  93.6  8e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1405  cytochrome b6  26.56 
 
 
224 aa  93.6  8e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00694033  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1247  cytochrome b6  26.56 
 
 
224 aa  93.6  8e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.363884  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1686  cytochrome b6  26.56 
 
 
224 aa  93.6  8e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3766  cytochrome b6  26.56 
 
 
224 aa  93.6  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1545  cytochrome b6  26.56 
 
 
224 aa  93.6  8e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1617  cytochrome b6  26.56 
 
 
224 aa  93.6  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.11169 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1448  cytochrome b6  26.56 
 
 
224 aa  93.6  8e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.227629  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2347  cytochrome b6  27.52 
 
 
222 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3893  Cytochrome b/b6 domain protein  28.02 
 
 
575 aa  92.4  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.290413  normal  0.541896 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2957  cytochrome b/b6-like protein  32.2 
 
 
257 aa  92  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1912  cytochrome b/b6 domain-containing protein  28.92 
 
 
410 aa  91.3  4e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1196  Cytochrome b/b6 domain  38.67 
 
 
206 aa  90.9  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2932  cytochrome b/b6  31.19 
 
 
206 aa  90.1  9e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1137  cytochrome b6  27.06 
 
 
222 aa  90.1  9e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00720211 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1554  Cytochrome b/b6 domain protein  32.67 
 
 
451 aa  90.1  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1459  cytochrome b/b6 domain protein  32.67 
 
 
451 aa  90.1  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1986  Cytochrome b/b6 domain  28.5 
 
 
431 aa  89.7  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.282251  normal  0.259595 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2711  cytochrome b/b6-like protein  31.84 
 
 
249 aa  89  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2404  cytochrome b/b6-like  32 
 
 
451 aa  88.6  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1779  Cytochrome b/b6 domain  30.37 
 
 
422 aa  87.8  5e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.484297  decreased coverage  0.00239788 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0795  cytochrome b/b6 domain-containing protein  27.78 
 
 
410 aa  87.8  5e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000156903  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2210  cytochrome b/b6  28.84 
 
 
413 aa  87  8e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.226305  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0762  Cytochrome b/b6 domain protein  31.73 
 
 
510 aa  86.7  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.294721  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>