34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2710 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2710  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  310  3.9999999999999997e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2956  cytochrome b subunit of the bc complex-like protein  62.42 
 
 		 177 aa  196  9e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5926  Cytochrome b subunit of the bc complex-like protein  35.4 
 
 		 244 aa  76.3  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2129  cytochrome c class I  32.54 
 
 		 255 aa  68.2  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000120589  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0490  cytochrome c class I  32.54 
 
 		 254 aa  67.4  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1449  cytochrome c class I  30.71 
 
 		 255 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.150697  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1687  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b/c subunit  31.5 
 
 		 255 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.615326  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1248  cytochrome c class I  29.1 
 
 		 255 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.254815  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1434  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b/c subunit  31.5 
 
 		 255 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0832764  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1618  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b/c subunit  31.5 
 
 		 255 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.117912 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3765  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b/c subunit  30.71 
 
 		 255 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1580  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b/c subunit  30.71 
 
 		 255 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1651  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b/c subunit  30.71 
 
 		 255 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1546  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b/c subunit  31.5 
 
 		 255 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1406  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c subunit  31.5 
 
 		 255 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.118842  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1406  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c subunit  31.5 
 
 		 255 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0445  cytochrome b/b6 domain-containing protein  38.95 
 
 		 358 aa  62  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2404  cytochrome b/b6-like  32.76 
 
 		 451 aa  54.7  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1554  Cytochrome b/b6 domain protein  32.76 
 
 		 451 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1459  cytochrome b/b6 domain protein  31.9 
 
 		 451 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0648  menaquinol--cytochrome-c reductase (cytochrome bc complex) cytochrome b/c subunit  25.48 
 
 		 262 aa  50.4  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.143755 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0278  Cytochrome b/b6 domain  40.91 
 
 		 417 aa  49.3  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3174  Cytochrome b/b6 domain protein  30.88 
 
 		 367 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2120  hypothetical protein  26.06 
 
 		 173 aa  46.6  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.697537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0207  subunit IV of cytochrome bc complex petd  26.4 
 
 		 131 aa  46.2  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1087  cytochrome b/b6 domain protein  29.63 
 
 		 367 aa  45.1  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00440  ubiquinol cytochrome C oxidoreductase, cytochrome B subunit  28.93 
 
 		 419 aa  45.1  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.121242  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1395  cytochrome b/b6 domain-containing protein  26.92 
 
 		 421 aa  42.4  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.935928  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3893  Cytochrome b/b6 domain protein  36.99 
 
 		 575 aa  42.4  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.290413  normal  0.541896 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0424  Cytochrome b/b6 domain protein  33.33 
 
 		 610 aa  41.2  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.628358  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1944  ubiquinol cytochrome C oxidoreductase, cytochrome B subunit  35.44 
 
 		 430 aa  41.2  0.006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0553456  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0242  cytochrome b/b6 domain-containing protein  32.35 
 
 		 448 aa  41.2  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2165  cytochrome b/b6-like  27.48 
 
 		 428 aa  40.8  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2873  fused ubiquinol-cytochrome c reductase and cytochrome b/b6  28.32 
 
 		 426 aa  40.4  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00318002  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>