23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2573 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2573  hypothetical protein  100 
 
 		 593 aa  1226    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.122591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2213  cytochrome c, mono- and diheme variant  46 
 
 		 435 aa  84.7  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0408  hypothetical protein  41.96 
 
 		 149 aa  84.7  0.000000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0357243  normal  0.780002 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3477  cytochrome c class I  37.37 
 
 		 425 aa  69.7  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.333881  normal  0.501976 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0529  cytochrome c class I  33.05 
 
 		 400 aa  65.5  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2297  hypothetical protein  34.62 
 
 		 302 aa  63.2  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0292911 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2666  electron transport protein SCO1/SenC  30.77 
 
 		 327 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.239586  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3183  electron transport protein SCO1/SenC  29.06 
 
 		 327 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.106344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2533  electron transport protein SCO1/SenC  28.21 
 
 		 327 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1634  cytochrome c, class I  32.04 
 
 		 444 aa  57.8  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5664  cytochrome c class I  32.41 
 
 		 443 aa  55.5  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.239336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0650  electron transport protein SCO1/SenC  29.84 
 
 		 340 aa  55.5  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2620  hypothetical protein  37.14 
 
 		 112 aa  52.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.947567  normal  0.398796 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4298  electron transport protein SCO1/SenC  28.21 
 
 		 356 aa  52.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.576554  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1019  hypothetical protein  35.94 
 
 		 296 aa  51.2  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.166316 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0288  cytochrome c class I  32.35 
 
 		 416 aa  51.2  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.142751  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2002  electron transport protein SCO1/SenC  25 
 
 		 363 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0910  cytochrome c class I  47.17 
 
 		 117 aa  48.1  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.58157e-33 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3336  cytochrome c class I  28.43 
 
 		 117 aa  47.8  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0198059  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1966  multicopper oxidase domain-containing protein  31.75 
 
 		 535 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.328521  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2061  multicopper oxidase domain-containing protein  31.75 
 
 		 535 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.429703  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0944  mulitcopper oxidase domain-containing protein  33.33 
 
 		 487 aa  45.1  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1298  nitrous-oxide reductase  39.39 
 
 		 865 aa  43.9  0.009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000502464  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>