79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0340 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0340  cytochrome d1 heme region  100 
 
 		 557 aa  1142    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000596399  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0461  cytochrome d1 heme region  43.94 
 
 		 556 aa  461  9.999999999999999e-129  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00181768  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5018  nitrite reductase (NO-forming)  28.83 
 
 		 503 aa  217  4e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0610  putative c-type cytochrome  30.13 
 
 		 493 aa  210  5e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.221994  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3169  cytochrome d1, heme region  28.89 
 
 		 493 aa  209  8e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2495  cytochrome d1, heme region  29.83 
 
 		 484 aa  207  5e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.399935 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1710  cytochrome d1 heme region  28.25 
 
 		 566 aa  206  1e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.111193  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1905  cytochrome d1, heme region  28.25 
 
 		 542 aa  205  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.275872  normal  0.619697 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1450  cytochrome d1 heme region  28.87 
 
 		 525 aa  199  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.593871 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06650  putative c-type cytochrome  29.26 
 
 		 493 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0252622  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4229  heme-binding protein NirN  29.3 
 
 		 542 aa  197  4.0000000000000005e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3260  cytochrome d1, heme region  28.66 
 
 		 528 aa  191  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3172  nitrite reductase protein N  26.77 
 
 		 517 aa  190  5e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.854794 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0070  nitrite reductase (NO-forming)  28.72 
 
 		 517 aa  187  3e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.532245  normal  0.428629 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3132  hydroxylamine reductase  27.5 
 
 		 504 aa  186  7e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2608  cytochrome d1 heme region  27.25 
 
 		 547 aa  163  7e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.213874  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3029  cytochrome d1 heme subunit  24.95 
 
 		 527 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612791  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0339  Hydroxylamine reductase  24.55 
 
 		 548 aa  100  9e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000373839  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3331  cytochrome d1, heme region  22.65 
 
 		 519 aa  94.7  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4220  nitrite reductase  23.9 
 
 		 542 aa  93.2  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0434848  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3172  cytochrome d1, heme region  23.13 
 
 		 549 aa  88.2  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5010  hydroxylamine reductase  22.69 
 
 		 567 aa  87.8  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824886  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3430  hydroxylamine reductase  21.82 
 
 		 690 aa  87  9e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133713  decreased coverage  0.000818462 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3125  hydroxylamine reductase  20.48 
 
 		 574 aa  85.1  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.74527  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0620  nitrite reductase precursor  21.46 
 
 		 568 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06750  nitrite reductase precursor  21.66 
 
 		 568 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1912  nitrite reductase (NO-forming)  22.14 
 
 		 574 aa  84.7  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1717  Hydroxylamine reductase  22.14 
 
 		 574 aa  84.7  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1985  nitrite reductase NirS  22.48 
 
 		 546 aa  84.3  0.000000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000493691  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0462  Hydroxylamine reductase  22.85 
 
 		 553 aa  84  0.000000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000301578  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0652  Nitrite reductase (NO-forming)  22.94 
 
 		 565 aa  82  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3274  cytochrome d1, heme region  21.29 
 
 		 561 aa  79.7  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.825394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1442  hydroxylamine reductase  21.6 
 
 		 573 aa  76.3  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0077  nitrite reductase (NO-forming)  21.14 
 
 		 575 aa  73.6  0.000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.157876  normal  0.459085 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1986  cytochrome c, class I  41.89 
 
 		 101 aa  70.9  0.00000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0022172  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2618  Nitrite reductase (NO-forming)  20.5 
 
 		 560 aa  70.9  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0412143  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2487  hydroxylamine reductase  19.6 
 
 		 596 aa  69.3  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.756283 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3323  cytochrome c, class I:cytochrome d1, heme region  21.09 
 
 		 576 aa  67.8  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000018049 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5013  cytochrome d1, heme region  20.3 
 
 		 413 aa  63.5  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2545  putative cytochrome c  35.05 
 
 		 350 aa  63.2  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3392  glucose sorbosone dehydrogenase  43.04 
 
 		 476 aa  61.2  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.428431  normal  0.278741 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0617  heme d1 biosynthesis protein NirF  20.77 
 
 		 392 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1897  secretion protein HlyD  34.74 
 
 		 485 aa  58.2  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00218638  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4223  nirF protein  20.63 
 
 		 413 aa  57.4  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06720  heme d1 biosynthesis protein NirF  20.22 
 
 		 392 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.729227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3270  cytochrome d1, heme region  21.58 
 
 		 387 aa  55.5  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3180  nitrite reductase precursor  18.02 
 
 		 583 aa  53.1  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.795013  normal  0.689934 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0824  cytochrome c class I  27.12 
 
 		 296 aa  50.8  0.00007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000780419  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3123  cytochrome d1, heme region  20 
 
 		 400 aa  50.4  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.475371  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0076  hypothetical protein  36.99 
 
 		 98 aa  50.1  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3124  cytochrome c, mono- and diheme variants  40 
 
 		 121 aa  48.9  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.412627  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0263  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30 
 
 		 470 aa  48.1  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.473095  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5350  iron permease FTR1  32.71 
 
 		 640 aa  47.4  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.620494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0075  heme d1 biosynthesis protein NirF  20.47 
 
 		 391 aa  47  0.0008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.61983 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5945  Pb(II)-uptake protein PbrT  33.33 
 
 		 642 aa  47  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.925731 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1440  glucose sorbosone dehydrogenase  31.17 
 
 		 530 aa  46.6  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453751 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1817  iron permease FTR1  30 
 
 		 640 aa  47  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.214502 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1913  hypothetical protein  29.52 
 
 		 154 aa  46.6  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000530569  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1641  iron permease FTR1  32.71 
 
 		 642 aa  45.8  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0683  cytochrome c class I  34.52 
 
 		 381 aa  46.2  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0288  cytochrome c class I  32.95 
 
 		 416 aa  46.2  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.142751  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1444  cytochrome d1 heme region  19.94 
 
 		 397 aa  45.8  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1088  cytochrome c, class I  31.94 
 
 		 143 aa  46.2  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000582284  hitchhiker  0.0000137635 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2151  iron permease FTR1  30.86 
 
 		 643 aa  46.2  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.301053  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5282  iron permease FTR1  32.71 
 
 		 642 aa  45.8  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0759  cytochrome c, class I  37.66 
 
 		 100 aa  45.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.940622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1589  hypothetical protein  37.84 
 
 		 162 aa  45.4  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3236  hypothetical protein  33.33 
 
 		 182 aa  45.1  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0910  cytochrome c class I  31.76 
 
 		 117 aa  44.7  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.58157e-33 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1948  cytochrome cM  35.21 
 
 		 137 aa  44.7  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2714  cytochrome c, class I  35.29 
 
 		 101 aa  44.7  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.30061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2486  cytochrome c class I  35.21 
 
 		 266 aa  44.7  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.148102 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3336  cytochrome c class I  30.59 
 
 		 117 aa  44.7  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0198059  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0342  cytochrome d1 heme region  22.62 
 
 		 359 aa  44.3  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00493311  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3126  cytochrome c class I  24.74 
 
 		 109 aa  44.3  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0549907 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5100  cytochrome c class I  34.02 
 
 		 284 aa  44.3  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.449412  normal  0.538396 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0482  iron permease FTR1  32.05 
 
 		 649 aa  43.9  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2704  Quinoprotein glucose dehydrogenase  30.99 
 
 		 731 aa  43.9  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5322  cytochrome c class I  30.86 
 
 		 346 aa  43.5  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0021785  normal  0.0885214 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>