113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_06650 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_06650  putative c-type cytochrome  100 
 
 		 493 aa  998    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0252622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0610  putative c-type cytochrome  95.36 
 
 		 493 aa  921    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.221994  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3169  cytochrome d1, heme region  59.7 
 
 		 493 aa  589  1e-167  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3132  hydroxylamine reductase  57.61 
 
 		 504 aa  586  1e-166  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5018  nitrite reductase (NO-forming)  57.89 
 
 		 503 aa  579  1e-164  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4229  heme-binding protein NirN  50.84 
 
 		 542 aa  573  1.0000000000000001e-162  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3260  cytochrome d1, heme region  54.46 
 
 		 528 aa  566  1e-160  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0070  nitrite reductase (NO-forming)  54.16 
 
 		 517 aa  548  1e-155  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.532245  normal  0.428629 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1450  cytochrome d1 heme region  53.76 
 
 		 525 aa  528  1e-149  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.593871 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2608  cytochrome d1 heme region  54.49 
 
 		 547 aa  528  1e-149  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.213874  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1710  cytochrome d1 heme region  54.2 
 
 		 566 aa  528  1e-149  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.111193  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1905  cytochrome d1, heme region  53.92 
 
 		 542 aa  528  1e-148  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.275872  normal  0.619697 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2495  cytochrome d1, heme region  53.83 
 
 		 484 aa  514  1e-144  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.399935 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3172  nitrite reductase protein N  48.52 
 
 		 517 aa  499  1e-140  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.854794 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0461  cytochrome d1 heme region  30.54 
 
 		 556 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00181768  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4220  nitrite reductase  30.16 
 
 		 542 aa  222  9.999999999999999e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0434848  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0340  cytochrome d1 heme region  30.13 
 
 		 557 aa  209  9e-53  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000596399  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3029  cytochrome d1 heme subunit  30.35 
 
 		 527 aa  196  7e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612791  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3331  cytochrome d1, heme region  30.77 
 
 		 519 aa  182  9.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1985  nitrite reductase NirS  27.18 
 
 		 546 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000493691  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3430  hydroxylamine reductase  25.7 
 
 		 690 aa  151  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133713  decreased coverage  0.000818462 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0339  Hydroxylamine reductase  25.55 
 
 		 548 aa  145  2e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000373839  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3172  cytochrome d1, heme region  26.36 
 
 		 549 aa  144  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5010  hydroxylamine reductase  26.16 
 
 		 567 aa  144  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824886  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0652  Nitrite reductase (NO-forming)  26.92 
 
 		 565 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3323  cytochrome c, class I:cytochrome d1, heme region  25 
 
 		 576 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000018049 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0617  heme d1 biosynthesis protein NirF  32.25 
 
 		 392 aa  137  5e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06720  heme d1 biosynthesis protein NirF  32.42 
 
 		 392 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.729227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0462  Hydroxylamine reductase  25.36 
 
 		 553 aa  136  9.999999999999999e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000301578  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2487  hydroxylamine reductase  25.58 
 
 		 596 aa  130  6e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.756283 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3125  hydroxylamine reductase  22.59 
 
 		 574 aa  129  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.74527  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3123  cytochrome d1, heme region  29.59 
 
 		 400 aa  128  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.475371  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06750  nitrite reductase precursor  24.3 
 
 		 568 aa  128  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0620  nitrite reductase precursor  24.3 
 
 		 568 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1912  nitrite reductase (NO-forming)  23.68 
 
 		 574 aa  126  8.000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1717  Hydroxylamine reductase  23.68 
 
 		 574 aa  126  8.000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0077  nitrite reductase (NO-forming)  23.21 
 
 		 575 aa  125  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.157876  normal  0.459085 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3274  cytochrome d1, heme region  22.73 
 
 		 561 aa  122  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.825394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3270  cytochrome d1, heme region  26.78 
 
 		 387 aa  120  6e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1910  cytochrome d1, heme region  28.73 
 
 		 404 aa  119  9e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1442  hydroxylamine reductase  23.53 
 
 		 573 aa  119  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1715  cytochrome d1 heme region  28.73 
 
 		 404 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.792941  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2618  Nitrite reductase (NO-forming)  21.84 
 
 		 560 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0412143  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0075  heme d1 biosynthesis protein NirF  27.62 
 
 		 391 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.61983 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2080  cytochrome d1, heme region  27.62 
 
 		 390 aa  111  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.79845  normal  0.193812 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4223  nirF protein  25.67 
 
 		 413 aa  110  6e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3180  nitrite reductase precursor  22.48 
 
 		 583 aa  109  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.795013  normal  0.689934 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5013  cytochrome d1, heme region  26.7 
 
 		 413 aa  106  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1444  cytochrome d1 heme region  27.13 
 
 		 397 aa  100  7e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2613  cytochrome d1 heme region  27.35 
 
 		 402 aa  99  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.683986  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2490  cytochrome d1, heme region  26.45 
 
 		 384 aa  90.9  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.697669 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3177  cytochrome cd1  24.93 
 
 		 388 aa  81.6  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.976412 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1921  cytochrome d1, heme region  24.42 
 
 		 541 aa  75.9  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0591  cytochrome d1, heme region  22.64 
 
 		 538 aa  72  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0458  cytochrome d1 heme region  23.58 
 
 		 353 aa  57  0.0000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000480254  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2189  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.98 
 
 		 348 aa  56.6  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3892  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.56 
 
 		 660 aa  54.3  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0482  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  35.77 
 
 		 326 aa  53.9  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0076  hypothetical protein  43.84 
 
 		 98 aa  53.5  0.000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4139  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.94 
 
 		 314 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0325  cytochrome c oxidase subunit II  36.36 
 
 		 382 aa  52  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0125401 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5946  hypothetical protein  22.79 
 
 		 335 aa  51.2  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.413052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2474  serine/threonine protein kinase  23.53 
 
 		 776 aa  50.8  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000122678  hitchhiker  0.00951365 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4957  Pyrrolo-quinoline quinone  28.19 
 
 		 698 aa  50.1  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.897916 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2124  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.9 
 
 		 320 aa  50.1  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0490929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1589  hypothetical protein  35.44 
 
 		 162 aa  49.7  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3271  hypothetical protein  41.89 
 
 		 110 aa  48.9  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2545  putative cytochrome c  36.84 
 
 		 350 aa  49.3  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3042  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.52 
 
 		 1004 aa  48.9  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00005148 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4548  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.64 
 
 		 347 aa  48.5  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0577  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  34.52 
 
 		 652 aa  48.5  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4507  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  33.33 
 
 		 314 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.790571  normal  0.70615 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1253  hypothetical protein  30.59 
 
 		 679 aa  47.8  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.337339  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0125  cytochrome c oxidase, subunit II  32.88 
 
 		 521 aa  47.8  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2614  hypothetical protein  38.82 
 
 		 139 aa  48.1  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.537147  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1651  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.12 
 
 		 366 aa  47.4  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0495995  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3178  putative cytochrome c  38.3 
 
 		 103 aa  47  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.733909  normal  0.809001 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4384  hypothetical protein  23.19 
 
 		 314 aa  47  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.491749  normal  0.153461 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0258  cytochrome c oxidase, subunit II  35.14 
 
 		 528 aa  46.6  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1471  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  21.43 
 
 		 348 aa  46.6  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1302  hypothetical protein  21.85 
 
 		 364 aa  46.2  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.127226  normal  0.259109 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6227  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  26.97 
 
 		 943 aa  46.6  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.174955 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1378  Quinoprotein glucose dehydrogenase  30.09 
 
 		 769 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.618452 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3134  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.62 
 
 		 329 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2413  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.03 
 
 		 335 aa  45.8  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3392  glucose sorbosone dehydrogenase  27.47 
 
 		 476 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.428431  normal  0.278741 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3851  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.52 
 
 		 334 aa  45.8  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.31 
 
 		 1181 aa  45.8  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0843  TPR repeat-containing protein  38.57 
 
 		 330 aa  45.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2584  surface antigen gene  21.92 
 
 		 479 aa  45.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.223545  normal  0.185762 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3094  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.01 
 
 		 329 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001445  cytochrome c oxidase polypeptide II  31.51 
 
 		 356 aa  45.4  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.633895  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2496  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  21.9 
 
 		 357 aa  45.1  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.431237  normal  0.565249 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3145  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  21.75 
 
 		 327 aa  45.1  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3517  cytochrome c oxidase, subunit II  33.78 
 
 		 511 aa  44.7  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0104  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  27.88 
 
 		 353 aa  44.7  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0198  cytochrome-c oxidase  35.14 
 
 		 524 aa  44.7  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1443  hypothetical protein  33.78 
 
 		 109 aa  44.3  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1794  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.47 
 
 		 338 aa  44.7  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000588252 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06730  putative c-type cytochrome precursor  42.86 
 
 		 119 aa  44.3  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>