42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3124 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_3124  cytochrome c, mono- and diheme variants  100 
 
 		 121 aa  240  3.9999999999999997e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.412627  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4222  c-type cytochrome c55x  56.58 
 
 		 123 aa  93.6  7e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0076  hypothetical protein  51.9 
 
 		 98 aa  93.2  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3271  hypothetical protein  46.88 
 
 		 110 aa  89  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1716  hypothetical protein  49.37 
 
 		 114 aa  84.7  4e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1443  hypothetical protein  47.19 
 
 		 109 aa  84.3  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1911  hypothetical protein  48.1 
 
 		 114 aa  84.3  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.859056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3178  putative cytochrome c  44.76 
 
 		 103 aa  84  7e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.733909  normal  0.809001 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06730  putative c-type cytochrome precursor  39.83 
 
 		 119 aa  77  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0618  putative c-type cytochrome precursor  39.83 
 
 		 119 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2614  hypothetical protein  48.19 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.537147  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2489  cytochrome c (c55X)  44.58 
 
 		 103 aa  75.9  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.607101 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5012  c-type cytochrome precursor  40.51 
 
 		 109 aa  74.7  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.375656  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2079  hypothetical protein  40 
 
 		 129 aa  72  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.236411  normal  0.167695 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3132  hydroxylamine reductase  35.09 
 
 		 504 aa  64.3  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5018  nitrite reductase (NO-forming)  33.98 
 
 		 503 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3260  cytochrome d1, heme region  37.84 
 
 		 528 aa  53.5  0.0000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1450  cytochrome d1 heme region  35 
 
 		 525 aa  50.4  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.593871 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1710  cytochrome d1 heme region  31.25 
 
 		 566 aa  50.4  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.111193  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1905  cytochrome d1, heme region  31.25 
 
 		 542 aa  50.4  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.275872  normal  0.619697 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0340  cytochrome d1 heme region  40 
 
 		 557 aa  48.9  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000596399  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3169  cytochrome d1, heme region  32.98 
 
 		 493 aa  48.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0652  Nitrite reductase (NO-forming)  37.5 
 
 		 565 aa  48.5  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1897  secretion protein HlyD  39.66 
 
 		 485 aa  48.5  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00218638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3029  cytochrome d1 heme subunit  31.4 
 
 		 527 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612791  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0462  Hydroxylamine reductase  29.63 
 
 		 553 aa  47.8  0.00006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000301578  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4137  cytochrome c class I  30.11 
 
 		 320 aa  45.4  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3331  cytochrome d1, heme region  29.41 
 
 		 519 aa  44.7  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4229  heme-binding protein NirN  33.93 
 
 		 542 aa  44.7  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0620  nitrite reductase precursor  29.03 
 
 		 568 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2608  cytochrome d1 heme region  37.93 
 
 		 547 aa  43.5  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.213874  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06750  nitrite reductase precursor  29.03 
 
 		 568 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1985  nitrite reductase NirS  37.5 
 
 		 546 aa  42.4  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000493691  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3172  nitrite reductase protein N  30.99 
 
 		 517 aa  42.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.854794 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0077  nitrite reductase (NO-forming)  35.87 
 
 		 575 aa  42  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.157876  normal  0.459085 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5010  hydroxylamine reductase  28.87 
 
 		 567 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824886  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0339  Hydroxylamine reductase  32 
 
 		 548 aa  41.6  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000373839  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2545  putative cytochrome c  32.95 
 
 		 350 aa  41.6  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0461  cytochrome d1 heme region  32.47 
 
 		 556 aa  41.2  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00181768  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2618  Nitrite reductase (NO-forming)  27.13 
 
 		 560 aa  41.2  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0412143  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0070  nitrite reductase (NO-forming)  38.18 
 
 		 517 aa  40.8  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.532245  normal  0.428629 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1440  glucose sorbosone dehydrogenase  40.35 
 
 		 530 aa  40.8  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453751 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>