34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1911 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1911  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  229  8.000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.859056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1716  hypothetical protein  98.25 
 
 		 114 aa  227  4e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1443  hypothetical protein  67.78 
 
 		 109 aa  125  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3271  hypothetical protein  51.35 
 
 		 110 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0076  hypothetical protein  55.21 
 
 		 98 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2614  hypothetical protein  58.82 
 
 		 139 aa  102  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.537147  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06730  putative c-type cytochrome precursor  51.92 
 
 		 119 aa  100  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0618  putative c-type cytochrome precursor  51.92 
 
 		 119 aa  100  9e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4222  c-type cytochrome c55x  48.08 
 
 		 123 aa  94.7  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3124  cytochrome c, mono- and diheme variants  45.83 
 
 		 121 aa  87.8  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.412627  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2489  cytochrome c (c55X)  52.5 
 
 		 103 aa  87.4  7e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.607101 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3178  putative cytochrome c  50 
 
 		 103 aa  85.9  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.733909  normal  0.809001 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5012  c-type cytochrome precursor  51.85 
 
 		 109 aa  85.9  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.375656  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2079  hypothetical protein  50.65 
 
 		 129 aa  82  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.236411  normal  0.167695 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3190  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 111 aa  51.2  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1897  secretion protein HlyD  37.5 
 
 		 485 aa  48.5  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00218638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1710  cytochrome d1 heme region  40.3 
 
 		 566 aa  45.1  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.111193  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1905  cytochrome d1, heme region  40.3 
 
 		 542 aa  45.1  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.275872  normal  0.619697 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1450  cytochrome d1 heme region  37.65 
 
 		 525 aa  44.7  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.593871 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3029  cytochrome d1 heme subunit  36.67 
 
 		 527 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612791  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0462  Hydroxylamine reductase  29.46 
 
 		 553 aa  43.9  0.0008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000301578  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0610  putative c-type cytochrome  39.68 
 
 		 493 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.221994  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3169  cytochrome d1, heme region  35.06 
 
 		 493 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2419  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  40.68 
 
 		 298 aa  42.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.203271  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4229  heme-binding protein NirN  32.95 
 
 		 542 aa  42.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3172  nitrite reductase protein N  35.29 
 
 		 517 aa  41.6  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.854794 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1985  nitrite reductase NirS  31.4 
 
 		 546 aa  41.6  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000493691  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3260  cytochrome d1, heme region  36.92 
 
 		 528 aa  42  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4079  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  42.31 
 
 		 196 aa  41.6  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.254828  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1402  hypothetical protein  34.85 
 
 		 170 aa  40.8  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.781476  normal  0.402158 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06650  putative c-type cytochrome  43.75 
 
 		 493 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0252622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0340  cytochrome d1 heme region  35.19 
 
 		 557 aa  40.4  0.008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000596399  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5018  nitrite reductase (NO-forming)  35.82 
 
 		 503 aa  40.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3005  cytochrome c class I  34.78 
 
 		 110 aa  40  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000505825  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>