80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2608 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1905  cytochrome d1, heme region  62.08 
 
 		 542 aa  635    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.275872  normal  0.619697 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3260  cytochrome d1, heme region  67.83 
 
 		 528 aa  736    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1450  cytochrome d1 heme region  61.7 
 
 		 525 aa  640    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.593871 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2608  cytochrome d1 heme region  100 
 
 		 547 aa  1118    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.213874  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1710  cytochrome d1 heme region  62.08 
 
 		 566 aa  635    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.111193  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0070  nitrite reductase (NO-forming)  60.64 
 
 		 517 aa  586  1e-166  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.532245  normal  0.428629 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3169  cytochrome d1, heme region  56.81 
 
 		 493 aa  575  1.0000000000000001e-163  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3132  hydroxylamine reductase  53.68 
 
 		 504 aa  568  1e-161  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5018  nitrite reductase (NO-forming)  57.09 
 
 		 503 aa  557  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4229  heme-binding protein NirN  50.83 
 
 		 542 aa  533  1e-150  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0610  putative c-type cytochrome  54.49 
 
 		 493 aa  525  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.221994  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06650  putative c-type cytochrome  54.49 
 
 		 493 aa  520  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0252622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3172  nitrite reductase protein N  51.54 
 
 		 517 aa  511  1e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.854794 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2495  cytochrome d1, heme region  52.17 
 
 		 484 aa  506  9.999999999999999e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.399935 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0461  cytochrome d1 heme region  27.47 
 
 		 556 aa  200  5e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00181768  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4220  nitrite reductase  28.93 
 
 		 542 aa  197  5.000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0434848  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3331  cytochrome d1, heme region  30.31 
 
 		 519 aa  177  5e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3029  cytochrome d1 heme subunit  29.9 
 
 		 527 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612791  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0340  cytochrome d1 heme region  27.31 
 
 		 557 aa  164  5.0000000000000005e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000596399  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1985  nitrite reductase NirS  26.76 
 
 		 546 aa  143  7e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000493691  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3430  hydroxylamine reductase  25.09 
 
 		 690 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133713  decreased coverage  0.000818462 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06750  nitrite reductase precursor  25.94 
 
 		 568 aa  130  6e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0462  Hydroxylamine reductase  26.68 
 
 		 553 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000301578  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0620  nitrite reductase precursor  25.76 
 
 		 568 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0652  Nitrite reductase (NO-forming)  26.06 
 
 		 565 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0339  Hydroxylamine reductase  25.33 
 
 		 548 aa  128  3e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000373839  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3123  cytochrome d1, heme region  30.69 
 
 		 400 aa  124  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.475371  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3274  cytochrome d1, heme region  25.04 
 
 		 561 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.825394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2487  hydroxylamine reductase  24.4 
 
 		 596 aa  120  7.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.756283 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5010  hydroxylamine reductase  24.87 
 
 		 567 aa  120  9e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824886  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3323  cytochrome c, class I:cytochrome d1, heme region  26.23 
 
 		 576 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000018049 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0077  nitrite reductase (NO-forming)  25.57 
 
 		 575 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.157876  normal  0.459085 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3172  cytochrome d1, heme region  24.86 
 
 		 549 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3125  hydroxylamine reductase  24.06 
 
 		 574 aa  109  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.74527  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3270  cytochrome d1, heme region  26.84 
 
 		 387 aa  105  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0075  heme d1 biosynthesis protein NirF  26.57 
 
 		 391 aa  105  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.61983 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0617  heme d1 biosynthesis protein NirF  28.98 
 
 		 392 aa  101  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06720  heme d1 biosynthesis protein NirF  28.72 
 
 		 392 aa  100  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.729227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3180  nitrite reductase precursor  24.02 
 
 		 583 aa  97.8  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.795013  normal  0.689934 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2618  Nitrite reductase (NO-forming)  22.83 
 
 		 560 aa  97.1  8e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0412143  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4223  nirF protein  27.42 
 
 		 413 aa  95.1  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1910  cytochrome d1, heme region  26.93 
 
 		 404 aa  93.6  9e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1715  cytochrome d1 heme region  26.93 
 
 		 404 aa  92  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.792941  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1717  Hydroxylamine reductase  23.78 
 
 		 574 aa  91.3  5e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1912  nitrite reductase (NO-forming)  23.78 
 
 		 574 aa  91.3  5e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1444  cytochrome d1 heme region  27.37 
 
 		 397 aa  90.1  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2080  cytochrome d1, heme region  27.64 
 
 		 390 aa  89.7  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.79845  normal  0.193812 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1442  hydroxylamine reductase  22.03 
 
 		 573 aa  88.2  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5013  cytochrome d1, heme region  27.81 
 
 		 413 aa  80.5  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2613  cytochrome d1 heme region  25.97 
 
 		 402 aa  79  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.683986  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3177  cytochrome cd1  24.8 
 
 		 388 aa  76.3  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.976412 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2490  cytochrome d1, heme region  25.19 
 
 		 384 aa  73.6  0.000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.697669 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0591  cytochrome d1, heme region  21.46 
 
 		 538 aa  60.8  0.00000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0458  cytochrome d1 heme region  28.89 
 
 		 353 aa  60.8  0.00000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000480254  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1921  cytochrome d1, heme region  22.37 
 
 		 541 aa  55.8  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1988  nitrite reductase NirF  25 
 
 		 378 aa  53.5  0.000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.250805  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3041  hypothetical protein  33.01 
 
 		 134 aa  47.8  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457485  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1252  putative signal peptide protein  24.2 
 
 		 330 aa  47.8  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.603691  normal  0.989203 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3999  cytochrome c oxidase subunit II  40.3 
 
 		 524 aa  46.2  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0258  cytochrome c oxidase, subunit II  36.92 
 
 		 528 aa  47  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3517  cytochrome c oxidase, subunit II  32.35 
 
 		 511 aa  45.8  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3392  glucose sorbosone dehydrogenase  37.68 
 
 		 476 aa  45.8  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.428431  normal  0.278741 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0198  cytochrome-c oxidase  37.14 
 
 		 524 aa  45.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0342  cytochrome d1 heme region  20.98 
 
 		 359 aa  45.4  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00493311  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2717  cytochrome c oxidase, subunit II  37.31 
 
 		 523 aa  45.1  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.977219  normal  0.293993 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1172  cytochrome d1 heme region  31.69 
 
 		 331 aa  45.1  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.912749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1809  cytochrome c class I  33.66 
 
 		 153 aa  44.7  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001445  cytochrome c oxidase polypeptide II  37.68 
 
 		 356 aa  45.1  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.633895  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  31.25 
 
 		 810 aa  44.7  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0178  cytochrome c oxidase, subunit II  38.57 
 
 		 513 aa  44.3  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0781  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  34.44 
 
 		 382 aa  44.3  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.279912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4246  cytochrome c oxidase, subunit II  35.29 
 
 		 384 aa  43.9  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2545  putative cytochrome c  37.33 
 
 		 350 aa  43.9  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3124  cytochrome c, mono- and diheme variants  34.09 
 
 		 121 aa  43.9  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.412627  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0125  cytochrome c oxidase, subunit II  38.46 
 
 		 521 aa  43.9  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1882  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.97 
 
 		 383 aa  43.9  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4112  cytochrome c oxidase, subunit II  35.29 
 
 		 518 aa  43.5  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3043  cytochrome c class I  31.88 
 
 		 163 aa  43.5  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4139  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  36.19 
 
 		 314 aa  43.5  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3782  cytochrome c oxidase, subunit II  36.76 
 
 		 512 aa  43.5  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>