38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3271 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3271  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  228  3e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0076  hypothetical protein  70.33 
 
 		 98 aa  137  6e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2614  hypothetical protein  71.43 
 
 		 139 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.537147  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1443  hypothetical protein  59.52 
 
 		 109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06730  putative c-type cytochrome precursor  61.25 
 
 		 119 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0618  putative c-type cytochrome precursor  61.25 
 
 		 119 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4222  c-type cytochrome c55x  54.35 
 
 		 123 aa  108  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1716  hypothetical protein  58.33 
 
 		 114 aa  103  6e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1911  hypothetical protein  57.14 
 
 		 114 aa  103  9e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.859056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5012  c-type cytochrome precursor  55.56 
 
 		 109 aa  101  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.375656  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2079  hypothetical protein  57.89 
 
 		 129 aa  101  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.236411  normal  0.167695 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2489  cytochrome c (c55X)  49.41 
 
 		 103 aa  90.5  7e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.607101 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3124  cytochrome c, mono- and diheme variants  46.88 
 
 		 121 aa  89  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.412627  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3178  putative cytochrome c  48.57 
 
 		 103 aa  85.5  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.733909  normal  0.809001 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0462  Hydroxylamine reductase  38.37 
 
 		 553 aa  56.2  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000301578  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1710  cytochrome d1 heme region  47.06 
 
 		 566 aa  53.9  0.0000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.111193  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1905  cytochrome d1, heme region  47.06 
 
 		 542 aa  53.9  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.275872  normal  0.619697 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3132  hydroxylamine reductase  35 
 
 		 504 aa  53.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4229  heme-binding protein NirN  30 
 
 		 542 aa  53.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3172  nitrite reductase protein N  40.91 
 
 		 517 aa  52  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.854794 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1985  nitrite reductase NirS  40.32 
 
 		 546 aa  50.1  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000493691  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5018  nitrite reductase (NO-forming)  44.62 
 
 		 503 aa  49.7  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1450  cytochrome d1 heme region  44.12 
 
 		 525 aa  48.5  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.593871 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0610  putative c-type cytochrome  44.62 
 
 		 493 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.221994  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3260  cytochrome d1, heme region  33.77 
 
 		 528 aa  47.4  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06650  putative c-type cytochrome  53.06 
 
 		 493 aa  47  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0252622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3169  cytochrome d1, heme region  37.1 
 
 		 493 aa  45.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0652  Nitrite reductase (NO-forming)  34.74 
 
 		 565 aa  44.7  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1897  secretion protein HlyD  37.04 
 
 		 485 aa  43.9  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00218638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0339  Hydroxylamine reductase  30 
 
 		 548 aa  43.1  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000373839  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0340  cytochrome d1 heme region  38.89 
 
 		 557 aa  42.7  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000596399  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0070  nitrite reductase (NO-forming)  40.3 
 
 		 517 aa  42.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.532245  normal  0.428629 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5010  hydroxylamine reductase  37.5 
 
 		 567 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824886  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2545  putative cytochrome c  33.33 
 
 		 350 aa  42  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3172  cytochrome d1, heme region  36.92 
 
 		 549 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2608  cytochrome d1 heme region  33.33 
 
 		 547 aa  41.2  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.213874  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2487  hydroxylamine reductase  37.29 
 
 		 596 aa  41.2  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.756283 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2495  cytochrome d1, heme region  37.1 
 
 		 484 aa  40.8  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.399935 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>