56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0339 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0339  Hydroxylamine reductase  100 
 
 		 548 aa  1133    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000373839  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0462  Hydroxylamine reductase  52.91 
 
 		 553 aa  592  1e-168  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000301578  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5010  hydroxylamine reductase  52.77 
 
 		 567 aa  549  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824886  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3430  hydroxylamine reductase  50.65 
 
 		 690 aa  550  1e-155  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133713  decreased coverage  0.000818462 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3172  cytochrome d1, heme region  51.12 
 
 		 549 aa  546  1e-154  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0652  Nitrite reductase (NO-forming)  52.28 
 
 		 565 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3323  cytochrome c, class I:cytochrome d1, heme region  50.95 
 
 		 576 aa  540  9.999999999999999e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000018049 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0077  nitrite reductase (NO-forming)  51.54 
 
 		 575 aa  540  9.999999999999999e-153  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.157876  normal  0.459085 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0620  nitrite reductase precursor  49.81 
 
 		 568 aa  537  1e-151  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06750  nitrite reductase precursor  49.62 
 
 		 568 aa  537  1e-151  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3125  hydroxylamine reductase  49.23 
 
 		 574 aa  523  1e-147  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.74527  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1912  nitrite reductase (NO-forming)  44.83 
 
 		 574 aa  507  9.999999999999999e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1717  Hydroxylamine reductase  44.83 
 
 		 574 aa  507  9.999999999999999e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1442  hydroxylamine reductase  46.28 
 
 		 573 aa  503  1e-141  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2487  hydroxylamine reductase  46.86 
 
 		 596 aa  503  1e-141  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.756283 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3180  nitrite reductase precursor  47.42 
 
 		 583 aa  487  1e-136  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.795013  normal  0.689934 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2618  Nitrite reductase (NO-forming)  45.22 
 
 		 560 aa  480  1e-134  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0412143  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3274  cytochrome d1, heme region  43.33 
 
 		 561 aa  462  1e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.825394  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4220  nitrite reductase  39.63 
 
 		 542 aa  364  2e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0434848  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3132  hydroxylamine reductase  24.45 
 
 		 504 aa  155  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0070  nitrite reductase (NO-forming)  27.8 
 
 		 517 aa  153  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.532245  normal  0.428629 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4229  heme-binding protein NirN  23.59 
 
 		 542 aa  144  4e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3169  cytochrome d1, heme region  27.02 
 
 		 493 aa  144  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0610  putative c-type cytochrome  25.35 
 
 		 493 aa  141  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.221994  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06650  putative c-type cytochrome  25.55 
 
 		 493 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0252622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2495  cytochrome d1, heme region  26.27 
 
 		 484 aa  137  5e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.399935 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3029  cytochrome d1 heme subunit  26.38 
 
 		 527 aa  131  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612791  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2608  cytochrome d1 heme region  25.33 
 
 		 547 aa  128  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.213874  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5018  nitrite reductase (NO-forming)  24.75 
 
 		 503 aa  126  8.000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1905  cytochrome d1, heme region  24.95 
 
 		 542 aa  123  8e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.275872  normal  0.619697 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1710  cytochrome d1 heme region  24.95 
 
 		 566 aa  123  9e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.111193  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1985  nitrite reductase NirS  25.55 
 
 		 546 aa  120  7e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000493691  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1450  cytochrome d1 heme region  23.82 
 
 		 525 aa  115  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.593871 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3260  cytochrome d1, heme region  24.95 
 
 		 528 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3172  nitrite reductase protein N  22.22 
 
 		 517 aa  108  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.854794 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0461  cytochrome d1 heme region  24.46 
 
 		 556 aa  107  5e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00181768  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3331  cytochrome d1, heme region  26.05 
 
 		 519 aa  106  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0340  cytochrome d1 heme region  24.55 
 
 		 557 aa  100  8e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000596399  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0591  cytochrome d1, heme region  25.86 
 
 		 538 aa  69.7  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1921  cytochrome d1, heme region  24.51 
 
 		 541 aa  70.1  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3270  cytochrome d1, heme region  23.66 
 
 		 387 aa  62  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2080  cytochrome d1, heme region  22.22 
 
 		 390 aa  58.9  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.79845  normal  0.193812 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0075  heme d1 biosynthesis protein NirF  21.61 
 
 		 391 aa  53.5  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.61983 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0617  heme d1 biosynthesis protein NirF  21.98 
 
 		 392 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5013  cytochrome d1, heme region  21.6 
 
 		 413 aa  52.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06720  heme d1 biosynthesis protein NirF  21.5 
 
 		 392 aa  51.2  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.729227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1903  hypothetical protein  31.07 
 
 		 110 aa  49.7  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.172183  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5322  cytochrome c class I  36.71 
 
 		 346 aa  48.9  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0021785  normal  0.0885214 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1913  hypothetical protein  35.44 
 
 		 154 aa  47.4  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000530569  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2538  cytochrome c, class I  35.42 
 
 		 313 aa  47.4  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.663631  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1140  cytochrome c, mono- and diheme variant  33.7 
 
 		 269 aa  47  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000421025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2486  cytochrome c class I  41.43 
 
 		 266 aa  46.6  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.148102 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0012  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  31.62 
 
 		 293 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1088  cytochrome c, class I  38.46 
 
 		 143 aa  44.7  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000582284  hitchhiker  0.0000137635 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1809  cytochrome c class I  36.05 
 
 		 153 aa  44.7  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0683  cytochrome c class I  31.76 
 
 		 381 aa  44.3  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>