34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1443 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1443  hypothetical protein  100 
 
 		 109 aa  221  3e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1911  hypothetical protein  67.78 
 
 		 114 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.859056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1716  hypothetical protein  68.89 
 
 		 114 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0076  hypothetical protein  63.75 
 
 		 98 aa  117  6e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3271  hypothetical protein  52.53 
 
 		 110 aa  116  7.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2614  hypothetical protein  60 
 
 		 139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.537147  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06730  putative c-type cytochrome precursor  59.26 
 
 		 119 aa  101  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0618  putative c-type cytochrome precursor  58.02 
 
 		 119 aa  99  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2079  hypothetical protein  55.84 
 
 		 129 aa  95.9  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.236411  normal  0.167695 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5012  c-type cytochrome precursor  54.32 
 
 		 109 aa  95.1  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.375656  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4222  c-type cytochrome c55x  53.75 
 
 		 123 aa  94.4  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2489  cytochrome c (c55X)  55.7 
 
 		 103 aa  92.4  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.607101 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3124  cytochrome c, mono- and diheme variants  47.19 
 
 		 121 aa  85.1  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.412627  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3178  putative cytochrome c  56.94 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.733909  normal  0.809001 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1897  secretion protein HlyD  36.67 
 
 		 485 aa  51.6  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00218638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1710  cytochrome d1 heme region  37.84 
 
 		 566 aa  47  0.00008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.111193  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4229  heme-binding protein NirN  33.78 
 
 		 542 aa  47  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1905  cytochrome d1, heme region  34.38 
 
 		 542 aa  47  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.275872  normal  0.619697 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0610  putative c-type cytochrome  34.52 
 
 		 493 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.221994  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3190  cytochrome c class I  32.89 
 
 		 111 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3132  hydroxylamine reductase  32.39 
 
 		 504 aa  45.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2545  putative cytochrome c  39.13 
 
 		 350 aa  45.4  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3260  cytochrome d1, heme region  32.88 
 
 		 528 aa  45.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3005  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 110 aa  44.7  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000505825  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0339  Hydroxylamine reductase  32.1 
 
 		 548 aa  44.3  0.0006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000373839  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3029  cytochrome d1 heme subunit  37.31 
 
 		 527 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612791  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3172  nitrite reductase protein N  35.29 
 
 		 517 aa  42.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.854794 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06650  putative c-type cytochrome  41.67 
 
 		 493 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0252622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1903  hypothetical protein  39.39 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.172183  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1985  nitrite reductase NirS  28.92 
 
 		 546 aa  42.4  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000493691  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5018  nitrite reductase (NO-forming)  34.18 
 
 		 503 aa  40.8  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0159  cytochrome c class I  34.33 
 
 		 120 aa  40.4  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0936  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  35.21 
 
 		 321 aa  40.4  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2419  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  32.88 
 
 		 298 aa  40.4  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.203271  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>