89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3132 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_3132  hydroxylamine reductase  100 
 
 		 504 aa  1045    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4229  heme-binding protein NirN  56.8 
 
 		 542 aa  598  1e-170  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3260  cytochrome d1, heme region  56.1 
 
 		 528 aa  592  1e-168  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0610  putative c-type cytochrome  57.87 
 
 		 493 aa  579  1e-164  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.221994  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06650  putative c-type cytochrome  58.72 
 
 		 493 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0252622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0070  nitrite reductase (NO-forming)  56.85 
 
 		 517 aa  571  1e-161  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.532245  normal  0.428629 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2608  cytochrome d1 heme region  53.68 
 
 		 547 aa  568  1e-160  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.213874  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3172  nitrite reductase protein N  52.65 
 
 		 517 aa  554  1e-156  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.854794 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2495  cytochrome d1, heme region  56.87 
 
 		 484 aa  553  1e-156  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.399935 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3169  cytochrome d1, heme region  55.86 
 
 		 493 aa  553  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5018  nitrite reductase (NO-forming)  53.24 
 
 		 503 aa  549  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1450  cytochrome d1 heme region  52.98 
 
 		 525 aa  543  1e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.593871 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1905  cytochrome d1, heme region  51.67 
 
 		 542 aa  522  1e-147  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.275872  normal  0.619697 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1710  cytochrome d1 heme region  51.67 
 
 		 566 aa  522  1e-147  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.111193  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0461  cytochrome d1 heme region  31.97 
 
 		 556 aa  246  6.999999999999999e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00181768  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4220  nitrite reductase  31.13 
 
 		 542 aa  233  8.000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0434848  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0340  cytochrome d1 heme region  28.13 
 
 		 557 aa  185  1.0000000000000001e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000596399  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3029  cytochrome d1 heme subunit  28.69 
 
 		 527 aa  179  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612791  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1985  nitrite reductase NirS  26.21 
 
 		 546 aa  162  1e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000493691  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3331  cytochrome d1, heme region  26.35 
 
 		 519 aa  162  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3430  hydroxylamine reductase  25.7 
 
 		 690 aa  159  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133713  decreased coverage  0.000818462 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0339  Hydroxylamine reductase  24.45 
 
 		 548 aa  155  2e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000373839  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0462  Hydroxylamine reductase  26.55 
 
 		 553 aa  152  1e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000301578  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0077  nitrite reductase (NO-forming)  26.04 
 
 		 575 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.157876  normal  0.459085 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0652  Nitrite reductase (NO-forming)  27.34 
 
 		 565 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0620  nitrite reductase precursor  24.65 
 
 		 568 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06750  nitrite reductase precursor  24.85 
 
 		 568 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3323  cytochrome c, class I:cytochrome d1, heme region  25.73 
 
 		 576 aa  142  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000018049 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5010  hydroxylamine reductase  25.85 
 
 		 567 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824886  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2487  hydroxylamine reductase  26 
 
 		 596 aa  141  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.756283 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3172  cytochrome d1, heme region  26.05 
 
 		 549 aa  141  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3125  hydroxylamine reductase  24.31 
 
 		 574 aa  139  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.74527  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3274  cytochrome d1, heme region  23.73 
 
 		 561 aa  134  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.825394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3270  cytochrome d1, heme region  28.93 
 
 		 387 aa  131  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1910  cytochrome d1, heme region  28.88 
 
 		 404 aa  130  7.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2618  Nitrite reductase (NO-forming)  22.56 
 
 		 560 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0412143  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1715  cytochrome d1 heme region  28.88 
 
 		 404 aa  129  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.792941  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3180  nitrite reductase precursor  25.63 
 
 		 583 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.795013  normal  0.689934 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3123  cytochrome d1, heme region  29.86 
 
 		 400 aa  126  8.000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.475371  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0075  heme d1 biosynthesis protein NirF  29.4 
 
 		 391 aa  126  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.61983 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1717  Hydroxylamine reductase  23.97 
 
 		 574 aa  126  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1912  nitrite reductase (NO-forming)  23.97 
 
 		 574 aa  126  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1442  hydroxylamine reductase  23.29 
 
 		 573 aa  116  8.999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2080  cytochrome d1, heme region  30.09 
 
 		 390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.79845  normal  0.193812 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0617  heme d1 biosynthesis protein NirF  28.69 
 
 		 392 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06720  heme d1 biosynthesis protein NirF  28.57 
 
 		 392 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.729227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1444  cytochrome d1 heme region  29.34 
 
 		 397 aa  112  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5013  cytochrome d1, heme region  29.04 
 
 		 413 aa  110  9.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4223  nirF protein  27.06 
 
 		 413 aa  107  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2490  cytochrome d1, heme region  28.92 
 
 		 384 aa  99.8  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.697669 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2613  cytochrome d1 heme region  27.71 
 
 		 402 aa  97.8  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.683986  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3177  cytochrome cd1  26.14 
 
 		 388 aa  90.5  6e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.976412 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1921  cytochrome d1, heme region  23.92 
 
 		 541 aa  69.7  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0591  cytochrome d1, heme region  24.52 
 
 		 538 aa  66.2  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3124  cytochrome c, mono- and diheme variants  35.09 
 
 		 121 aa  64.3  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.412627  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3178  putative cytochrome c  32.35 
 
 		 103 aa  58.9  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.733909  normal  0.809001 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3392  glucose sorbosone dehydrogenase  31 
 
 		 476 aa  58.2  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.428431  normal  0.278741 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0458  cytochrome d1 heme region  24.76 
 
 		 353 aa  55.5  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000480254  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3271  hypothetical protein  35 
 
 		 110 aa  53.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4222  c-type cytochrome c55x  34.57 
 
 		 123 aa  52.4  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1988  nitrite reductase NirF  24.4 
 
 		 378 aa  52.4  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.250805  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0342  cytochrome d1 heme region  22.47 
 
 		 359 aa  50.8  0.00006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00493311  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0076  hypothetical protein  31.46 
 
 		 98 aa  50.8  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0814  glucose sorbosone dehydrogenase  30.12 
 
 		 462 aa  50.4  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00498666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3043  cytochrome c class I  37.31 
 
 		 163 aa  49.3  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1897  secretion protein HlyD  29.47 
 
 		 485 aa  47.8  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00218638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1443  hypothetical protein  32.39 
 
 		 109 aa  47.4  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0198  cytochrome-c oxidase  34.29 
 
 		 524 aa  46.2  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0759  WD-40 repeat-containing protein  26.57 
 
 		 307 aa  46.2  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06730  putative c-type cytochrome precursor  33.33 
 
 		 119 aa  46.6  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0618  putative c-type cytochrome precursor  33.33 
 
 		 119 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2412  cytochrome c class I  42.62 
 
 		 120 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000673714  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3517  cytochrome c oxidase, subunit II  31.43 
 
 		 511 aa  45.8  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0258  cytochrome c oxidase, subunit II  32.05 
 
 		 528 aa  45.8  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3620  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.82 
 
 		 324 aa  45.8  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.793181  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2413  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.28 
 
 		 335 aa  45.8  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3999  cytochrome c oxidase subunit II  32.86 
 
 		 524 aa  45.1  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1425  cytochrome c, class I  34.29 
 
 		 97 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1279  hypothetical protein  32.95 
 
 		 329 aa  45.1  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4621  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  30.36 
 
 		 318 aa  44.7  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.70566  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0942  cytochrome c class I  29.13 
 
 		 329 aa  44.3  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.240089 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4136  cytochrome c class I  28.74 
 
 		 286 aa  43.9  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.48 
 
 		 323 aa  44.3  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2142  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  21.74 
 
 		 943 aa  43.9  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.624762  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1234  cytochrome c class I  32.84 
 
 		 163 aa  43.9  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.5253  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2614  hypothetical protein  33.8 
 
 		 139 aa  43.9  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.537147  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  24.53 
 
 		 947 aa  43.9  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2474  serine/threonine protein kinase  24.07 
 
 		 776 aa  43.9  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000122678  hitchhiker  0.00951365 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5421  WD-40 repeat-containing protein  24.28 
 
 		 354 aa  43.5  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>