38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2614 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2614  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  277  3e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.537147  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3271  hypothetical protein  62.62 
 
 		 110 aa  127  6e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0076  hypothetical protein  60.61 
 
 		 98 aa  122  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1443  hypothetical protein  60 
 
 		 109 aa  110  8.000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1716  hypothetical protein  60 
 
 		 114 aa  102  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1911  hypothetical protein  58.82 
 
 		 114 aa  102  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.859056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5012  c-type cytochrome precursor  53.66 
 
 		 109 aa  99  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.375656  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06730  putative c-type cytochrome precursor  57.32 
 
 		 119 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0618  putative c-type cytochrome precursor  57.32 
 
 		 119 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2079  hypothetical protein  54.55 
 
 		 129 aa  94.7  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.236411  normal  0.167695 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4222  c-type cytochrome c55x  49.07 
 
 		 123 aa  93.6  8e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2489  cytochrome c (c55X)  51.25 
 
 		 103 aa  85.9  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.607101 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3178  putative cytochrome c  43.81 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.733909  normal  0.809001 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3124  cytochrome c, mono- and diheme variants  43.69 
 
 		 121 aa  77  0.00000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.412627  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4229  heme-binding protein NirN  32.04 
 
 		 542 aa  49.3  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3172  nitrite reductase protein N  39.71 
 
 		 517 aa  48.9  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.854794 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3169  cytochrome d1, heme region  30 
 
 		 493 aa  47.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1985  nitrite reductase NirS  32.84 
 
 		 546 aa  47.4  0.00006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000493691  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1710  cytochrome d1 heme region  39.71 
 
 		 566 aa  47.4  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.111193  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1905  cytochrome d1, heme region  39.71 
 
 		 542 aa  47.4  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.275872  normal  0.619697 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3132  hydroxylamine reductase  32.29 
 
 		 504 aa  46.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1450  cytochrome d1 heme region  35 
 
 		 525 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.593871 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0610  putative c-type cytochrome  40 
 
 		 493 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.221994  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3043  cytochrome c class I  36.36 
 
 		 163 aa  45.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5018  nitrite reductase (NO-forming)  39.71 
 
 		 503 aa  44.7  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1234  cytochrome c class I  36.36 
 
 		 163 aa  43.9  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.5253  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3260  cytochrome d1, heme region  35.14 
 
 		 528 aa  43.5  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0325  cytochrome c oxidase subunit II  29.76 
 
 		 382 aa  42.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0125401 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1913  hypothetical protein  27.68 
 
 		 154 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000530569  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09091  cytochrome cM  27.1 
 
 		 125 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.670452 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3331  cytochrome d1, heme region  38.81 
 
 		 519 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2140  cytochrome c class I  32.97 
 
 		 124 aa  41.2  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.986487  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1583  cytochrome c class I  33.8 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.889837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3190  cytochrome c class I  27.88 
 
 		 111 aa  40.8  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001445  cytochrome c oxidase polypeptide II  31.51 
 
 		 356 aa  40.4  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.633895  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0070  nitrite reductase (NO-forming)  35.62 
 
 		 517 aa  40.4  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.532245  normal  0.428629 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1809  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 153 aa  40  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2545  putative cytochrome c  42.42 
 
 		 350 aa  40  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>