35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0618 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0618  putative c-type cytochrome precursor  100 
 
 		 119 aa  234  3e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06730  putative c-type cytochrome precursor  99.16 
 
 		 119 aa  232  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3271  hypothetical protein  61.25 
 
 		 110 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0076  hypothetical protein  62.82 
 
 		 98 aa  107  7.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1443  hypothetical protein  58.02 
 
 		 109 aa  98.6  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1716  hypothetical protein  58.02 
 
 		 114 aa  95.1  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1911  hypothetical protein  58.02 
 
 		 114 aa  95.1  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.859056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5012  c-type cytochrome precursor  58.97 
 
 		 109 aa  94.4  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.375656  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2614  hypothetical protein  57.32 
 
 		 139 aa  93.6  8e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.537147  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2079  hypothetical protein  58.23 
 
 		 129 aa  93.6  9e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.236411  normal  0.167695 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2489  cytochrome c (c55X)  57.32 
 
 		 103 aa  92.8  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.607101 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4222  c-type cytochrome c55x  43.52 
 
 		 123 aa  90.9  6e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3124  cytochrome c, mono- and diheme variants  39.83 
 
 		 121 aa  76.3  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.412627  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3178  putative cytochrome c  46.46 
 
 		 103 aa  73.9  0.0000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.733909  normal  0.809001 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1903  hypothetical protein  33.33 
 
 		 110 aa  51.6  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.172183  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1985  nitrite reductase NirS  38.71 
 
 		 546 aa  48.9  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000493691  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0610  putative c-type cytochrome  44.29 
 
 		 493 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.221994  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1450  cytochrome d1 heme region  41.18 
 
 		 525 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.593871 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4229  heme-binding protein NirN  32.35 
 
 		 542 aa  45.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3132  hydroxylamine reductase  33.33 
 
 		 504 aa  46.2  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5018  nitrite reductase (NO-forming)  41.58 
 
 		 503 aa  46.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3392  glucose sorbosone dehydrogenase  32.86 
 
 		 476 aa  45.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.428431  normal  0.278741 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1358  cb-type cytochrome c oxidase subunit III  32.86 
 
 		 152 aa  44.7  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.112598  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1905  cytochrome d1, heme region  43.1 
 
 		 542 aa  43.9  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.275872  normal  0.619697 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1710  cytochrome d1 heme region  43.1 
 
 		 566 aa  43.9  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.111193  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3029  cytochrome d1 heme subunit  33.87 
 
 		 527 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612791  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3260  cytochrome d1, heme region  38.1 
 
 		 528 aa  42.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0339  Hydroxylamine reductase  26.51 
 
 		 548 aa  41.6  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000373839  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1140  cytochrome c, mono- and diheme variant  31.34 
 
 		 269 aa  41.6  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000421025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1809  cytochrome c class I  29.55 
 
 		 153 aa  41.6  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1440  glucose sorbosone dehydrogenase  32.39 
 
 		 530 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453751 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3172  nitrite reductase protein N  33.33 
 
 		 517 aa  41.2  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.854794 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1897  secretion protein HlyD  33.87 
 
 		 485 aa  40.8  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00218638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2608  cytochrome d1 heme region  37.88 
 
 		 547 aa  40.8  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.213874  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0340  cytochrome d1 heme region  35.29 
 
 		 557 aa  40.4  0.008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000596399  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>