110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1905 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3260  cytochrome d1, heme region  61.23 
 
 		 528 aa  672    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1905  cytochrome d1, heme region  100 
 
 		 542 aa  1109    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.275872  normal  0.619697 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1450  cytochrome d1 heme region  78.38 
 
 		 525 aa  830    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.593871 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2608  cytochrome d1 heme region  62.08 
 
 		 547 aa  635    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.213874  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1710  cytochrome d1 heme region  99.45 
 
 		 566 aa  1103    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.111193  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3169  cytochrome d1, heme region  60.04 
 
 		 493 aa  590  1e-167  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0070  nitrite reductase (NO-forming)  60.52 
 
 		 517 aa  588  1e-166  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.532245  normal  0.428629 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5018  nitrite reductase (NO-forming)  58.11 
 
 		 503 aa  578  1e-164  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3172  nitrite reductase protein N  53.02 
 
 		 517 aa  545  1e-153  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.854794 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0610  putative c-type cytochrome  55.07 
 
 		 493 aa  526  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.221994  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3132  hydroxylamine reductase  51.67 
 
 		 504 aa  522  1e-147  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06650  putative c-type cytochrome  55.02 
 
 		 493 aa  509  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0252622  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4229  heme-binding protein NirN  48.63 
 
 		 542 aa  505  9.999999999999999e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2495  cytochrome d1, heme region  50.6 
 
 		 484 aa  478  1e-134  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.399935 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0461  cytochrome d1 heme region  27.81 
 
 		 556 aa  224  4e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00181768  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0340  cytochrome d1 heme region  28.25 
 
 		 557 aa  205  2e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000596399  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4220  nitrite reductase  30.06 
 
 		 542 aa  201  3e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0434848  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3331  cytochrome d1, heme region  27.83 
 
 		 519 aa  173  5.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3029  cytochrome d1 heme subunit  28.69 
 
 		 527 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612791  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3430  hydroxylamine reductase  26.65 
 
 		 690 aa  147  6e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133713  decreased coverage  0.000818462 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3323  cytochrome c, class I:cytochrome d1, heme region  27.24 
 
 		 576 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000018049 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0077  nitrite reductase (NO-forming)  26.45 
 
 		 575 aa  137  5e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.157876  normal  0.459085 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5010  hydroxylamine reductase  27.67 
 
 		 567 aa  135  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824886  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3172  cytochrome d1, heme region  27.56 
 
 		 549 aa  134  6e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06750  nitrite reductase precursor  25.84 
 
 		 568 aa  134  6e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0620  nitrite reductase precursor  25.84 
 
 		 568 aa  134  6e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3125  hydroxylamine reductase  25.37 
 
 		 574 aa  130  4.0000000000000003e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.74527  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0652  Nitrite reductase (NO-forming)  25.87 
 
 		 565 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2487  hydroxylamine reductase  24.45 
 
 		 596 aa  126  8.000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.756283 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0339  Hydroxylamine reductase  24.95 
 
 		 548 aa  123  8e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000373839  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3274  cytochrome d1, heme region  26.49 
 
 		 561 aa  122  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.825394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0462  Hydroxylamine reductase  25.18 
 
 		 553 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000301578  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1985  nitrite reductase NirS  24.34 
 
 		 546 aa  111  3e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000493691  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3180  nitrite reductase precursor  24.26 
 
 		 583 aa  110  6e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.795013  normal  0.689934 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1717  Hydroxylamine reductase  25.46 
 
 		 574 aa  110  7.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1912  nitrite reductase (NO-forming)  25.46 
 
 		 574 aa  110  7.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1442  hydroxylamine reductase  24 
 
 		 573 aa  108  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06720  heme d1 biosynthesis protein NirF  28.57 
 
 		 392 aa  106  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.729227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3123  cytochrome d1, heme region  28.65 
 
 		 400 aa  105  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.475371  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0075  heme d1 biosynthesis protein NirF  27.2 
 
 		 391 aa  104  4e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.61983 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2618  Nitrite reductase (NO-forming)  24.61 
 
 		 560 aa  103  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0412143  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0617  heme d1 biosynthesis protein NirF  27.81 
 
 		 392 aa  103  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3270  cytochrome d1, heme region  26.56 
 
 		 387 aa  102  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1910  cytochrome d1, heme region  27.98 
 
 		 404 aa  97.4  6e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1715  cytochrome d1 heme region  27.72 
 
 		 404 aa  95.1  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.792941  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5013  cytochrome d1, heme region  27.89 
 
 		 413 aa  86.3  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4223  nirF protein  24.24 
 
 		 413 aa  82  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1444  cytochrome d1 heme region  26.15 
 
 		 397 aa  78.2  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2613  cytochrome d1 heme region  25.97 
 
 		 402 aa  78.2  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.683986  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2080  cytochrome d1, heme region  26 
 
 		 390 aa  77.4  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.79845  normal  0.193812 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2490  cytochrome d1, heme region  25.71 
 
 		 384 aa  75.5  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.697669 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3177  cytochrome cd1  26.42 
 
 		 388 aa  72.4  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.976412 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0591  cytochrome d1, heme region  22.31 
 
 		 538 aa  63.2  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1921  cytochrome d1, heme region  21.69 
 
 		 541 aa  58.9  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3271  hypothetical protein  47.06 
 
 		 110 aa  53.9  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001445  cytochrome c oxidase polypeptide II  35.48 
 
 		 356 aa  53.9  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.633895  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0342  cytochrome d1 heme region  21.2 
 
 		 359 aa  53.1  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00493311  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3392  glucose sorbosone dehydrogenase  32.47 
 
 		 476 aa  51.2  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.428431  normal  0.278741 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3124  cytochrome c, mono- and diheme variants  31.25 
 
 		 121 aa  50.4  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.412627  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2517  cytochrome c, class I  34.02 
 
 		 976 aa  49.7  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.931319  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0076  hypothetical protein  38.81 
 
 		 98 aa  50.1  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2545  putative cytochrome c  35.23 
 
 		 350 aa  49.7  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1440  glucose sorbosone dehydrogenase  31.67 
 
 		 530 aa  49.7  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453751 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4957  Pyrrolo-quinoline quinone  37.68 
 
 		 698 aa  50.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.897916 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0458  cytochrome d1 heme region  21.16 
 
 		 353 aa  50.1  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000480254  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1897  secretion protein HlyD  28.87 
 
 		 485 aa  49.3  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00218638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0325  cytochrome c oxidase subunit II  33.8 
 
 		 382 aa  48.1  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0125401 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06272  cytochrome c oxidase, subunit II  32.26 
 
 		 405 aa  48.5  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1589  hypothetical protein  31.71 
 
 		 162 aa  47.8  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1425  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 97 aa  47.8  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1781  cytochrome c, class I  34.88 
 
 		 451 aa  47.4  0.0006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0339245 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1824  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit III  30.53 
 
 		 317 aa  47.4  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4058  isoquinoline 1-oxidoreductase  37.5 
 
 		 1215 aa  47.4  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.222777 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1443  hypothetical protein  37.84 
 
 		 109 aa  47  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2614  hypothetical protein  39.71 
 
 		 139 aa  47  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.537147  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2435  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 97 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1151  cytochrome c alcohol dehydrogenase subunit  34.88 
 
 		 451 aa  45.8  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1976  hypothetical protein  26.17 
 
 		 640 aa  45.8  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4137  cytochrome c class I  40.26 
 
 		 320 aa  45.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1669  pyrroloquinoline-quinone aldehyde dehydrogenase  35.23 
 
 		 1183 aa  45.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.224955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2714  cytochrome c, class I  28.26 
 
 		 101 aa  45.4  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.30061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4973  putative methanol dehydrogenase-like protein, cytochrome cL (XoxG)  42.55 
 
 		 148 aa  45.1  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.437867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0986  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.27 
 
 		 430 aa  45.1  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4222  c-type cytochrome c55x  32.91 
 
 		 123 aa  45.1  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2356  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30.36 
 
 		 498 aa  44.7  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0966  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  26.27 
 
 		 430 aa  44.7  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3999  cytochrome c oxidase subunit II  29.03 
 
 		 524 aa  44.7  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1001  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  26.27 
 
 		 430 aa  45.1  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2986  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  37.8 
 
 		 447 aa  44.7  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.47949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1809  cytochrome c class I  35.71 
 
 		 153 aa  45.1  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2522  cytochrome c class I  33.8 
 
 		 97 aa  45.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0698  cytochrome c class I  42.42 
 
 		 189 aa  44.7  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01290  cytochrome c oxidase, subunit II  30.85 
 
 		 374 aa  44.7  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.46157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1911  hypothetical protein  40.3 
 
 		 114 aa  44.7  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.859056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3376  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  26.27 
 
 		 426 aa  44.7  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3178  putative cytochrome c  34.69 
 
 		 103 aa  44.7  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.733909  normal  0.809001 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1620  outer membrane nitrite reductase, putative  34.57 
 
 		 189 aa  44.3  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.704464  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06730  putative c-type cytochrome precursor  44.83 
 
 		 119 aa  44.3  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0119  cytochrome c oxidase, subunit II  29.27 
 
 		 375 aa  44.3  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1716  hypothetical protein  38.81 
 
 		 114 aa  44.3  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>