40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4222 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4222  c-type cytochrome c55x  100 
 
 		 123 aa  249  8.000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3271  hypothetical protein  54.35 
 
 		 110 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0076  hypothetical protein  56.32 
 
 		 98 aa  106  9.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3124  cytochrome c, mono- and diheme variants  56.58 
 
 		 121 aa  93.6  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.412627  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1443  hypothetical protein  53.75 
 
 		 109 aa  93.2  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5012  c-type cytochrome precursor  47.73 
 
 		 109 aa  91.3  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.375656  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06730  putative c-type cytochrome precursor  43.52 
 
 		 119 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0618  putative c-type cytochrome precursor  43.52 
 
 		 119 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2614  hypothetical protein  54.88 
 
 		 139 aa  90.9  6e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.537147  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1716  hypothetical protein  55.84 
 
 		 114 aa  89.7  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2489  cytochrome c (c55X)  53.33 
 
 		 103 aa  89.7  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.607101 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1911  hypothetical protein  54.55 
 
 		 114 aa  89.4  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.859056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2079  hypothetical protein  48.1 
 
 		 129 aa  85.5  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.236411  normal  0.167695 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3178  putative cytochrome c  55.56 
 
 		 103 aa  79.7  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.733909  normal  0.809001 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3172  nitrite reductase protein N  37.5 
 
 		 517 aa  53.9  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.854794 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4229  heme-binding protein NirN  35.71 
 
 		 542 aa  53.9  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1985  nitrite reductase NirS  30.56 
 
 		 546 aa  52.4  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000493691  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3132  hydroxylamine reductase  34.57 
 
 		 504 aa  52.4  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1450  cytochrome d1 heme region  40.62 
 
 		 525 aa  49.7  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.593871 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3260  cytochrome d1, heme region  42.11 
 
 		 528 aa  48.5  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0462  Hydroxylamine reductase  32.35 
 
 		 553 aa  47.4  0.00007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000301578  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0070  nitrite reductase (NO-forming)  40.68 
 
 		 517 aa  46.6  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.532245  normal  0.428629 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3323  cytochrome c, class I:cytochrome d1, heme region  36.84 
 
 		 576 aa  45.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000018049 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5018  nitrite reductase (NO-forming)  35.82 
 
 		 503 aa  45.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1905  cytochrome d1, heme region  32.91 
 
 		 542 aa  45.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.275872  normal  0.619697 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1710  cytochrome d1 heme region  32.91 
 
 		 566 aa  45.1  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.111193  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0652  Nitrite reductase (NO-forming)  30.43 
 
 		 565 aa  44.3  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1897  secretion protein HlyD  30.77 
 
 		 485 aa  44.3  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00218638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0610  putative c-type cytochrome  38.33 
 
 		 493 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.221994  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2545  putative cytochrome c  40.82 
 
 		 350 aa  43.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3043  cytochrome c class I  40.74 
 
 		 163 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06650  putative c-type cytochrome  41.67 
 
 		 493 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0252622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3125  hydroxylamine reductase  27.64 
 
 		 574 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.74527  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0936  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  38.6 
 
 		 321 aa  41.6  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2487  hydroxylamine reductase  35.48 
 
 		 596 aa  41.2  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.756283 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0340  cytochrome d1 heme region  39.66 
 
 		 557 aa  41.6  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000596399  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3169  cytochrome d1, heme region  37.31 
 
 		 493 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0620  nitrite reductase precursor  34.85 
 
 		 568 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06750  nitrite reductase precursor  34.18 
 
 		 568 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4220  nitrite reductase  28.97 
 
 		 542 aa  40.8  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0434848  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>