156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_09091 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_09091  cytochrome cM  100 
 
 		 125 aa  254  2e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.670452 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1948  cytochrome cM  58.41 
 
 		 137 aa  152  1e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0717  cytochrome cM  58.14 
 
 		 129 aa  138  1.9999999999999998e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11331  cytochrome cM  51.38 
 
 		 130 aa  126  8.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.969799 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0695  cytochrome c  48.04 
 
 		 129 aa  120  6e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15291  cytochrome cM  49.02 
 
 		 129 aa  120  6e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.427205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2103  cytochrome c class I  47.9 
 
 		 124 aa  117  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2147  cytochrome c class I  47.9 
 
 		 124 aa  117  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.620434 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2140  cytochrome c class I  51.22 
 
 		 124 aa  116  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.986487  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11621  hypothetical protein  49.5 
 
 		 100 aa  114  5e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11631  cytochrome cM  48.51 
 
 		 100 aa  112  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.362816  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1478  cytochrome CytM  50.48 
 
 		 145 aa  110  5e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.611234 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1068  cytochrome cM  47.52 
 
 		 128 aa  108  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3662  cytochrome c class I  56.47 
 
 		 124 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4020  cytochrome c, class I  49.55 
 
 		 124 aa  107  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.442148  normal  0.970341 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3942  cytochrome c class I  52.94 
 
 		 109 aa  106  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.914915 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2140  cytochrome c, class I  50.59 
 
 		 87 aa  95.5  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0189398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0656  cytochrome c, class I  40 
 
 		 283 aa  54.3  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.93712 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1374  cytochrome c class I  37.18 
 
 		 270 aa  51.6  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317055  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2102  cytochrome c, class I  38.46 
 
 		 268 aa  51.6  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.895116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2210  cytochrome c, class I  32.18 
 
 		 262 aa  50.8  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0119453  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3341  cytochrome c class I  35.71 
 
 		 295 aa  50.8  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0942  cytochrome c class I  33.75 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.312729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2879  cytochrome c class I  30.89 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10680  cytochrome c, mono- and diheme variants family  35.44 
 
 		 275 aa  49.3  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0523281  normal  0.768267 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0433  hypothetical protein  37.08 
 
 		 229 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0963  cytochrome c, class I  34.31 
 
 		 268 aa  48.9  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0745087 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2955  cytochrome c, class I  35.06 
 
 		 278 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3294  cytochrome c, class I  34.07 
 
 		 277 aa  47.8  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.79873  normal  0.176806 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6928  cytochrome c class I  35.06 
 
 		 112 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.405337 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16190  cytochrome c, mono- and diheme variants family  35.63 
 
 		 263 aa  47.4  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.188569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3558  cytochrome c, class I  35.06 
 
 		 273 aa  47  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0912153 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2486  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 266 aa  47  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.148102 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1358  cb-type cytochrome c oxidase subunit III  25.81 
 
 		 152 aa  46.2  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.112598  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1304  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286942  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3526  cytochrome c class I  31.87 
 
 		 277 aa  46.2  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021541 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1229  cytochrome c class I  39.47 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1301  cytochrome c class I  32.61 
 
 		 121 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.00128002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3249  cytochrome c class I  32.98 
 
 		 255 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00726195  hitchhiker  0.0000284914 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6158  cytochrome c class I  32.91 
 
 		 112 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0018  cytochrome c, class I  40.68 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6572  cytochrome c, monohaem  34.48 
 
 		 352 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.381109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1827  cytochrome c, class I  34.18 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0062  Pyrrolo-quinoline quinone  31.11 
 
 		 704 aa  45.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387664 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1045  cytochrome c class I  36.76 
 
 		 98 aa  45.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12130  cytochrome c, mono- and diheme variants family  31.71 
 
 		 256 aa  45.1  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.298886  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1556  cytochrome c class I  32.18 
 
 		 108 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0799874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2618  cytochrome c class I  31.25 
 
 		 110 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.235794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1925  hypothetical protein  29.13 
 
 		 108 aa  45.1  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.671288  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3292  cytochrome c, class I  32.89 
 
 		 272 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.250177  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3354  cytochrome c, class I  32.89 
 
 		 272 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0582943  normal  0.0591201 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3303  cytochrome c, class I  32.89 
 
 		 272 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2450  PQQ-dependent enzyme-like protein  35.62 
 
 		 718 aa  44.3  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1356  cytochrome c class I  32.18 
 
 		 111 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.361491 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1809  cytochrome c class I  33.77 
 
 		 153 aa  44.3  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0428  cytochrome c class I  31.25 
 
 		 111 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3273  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  33.02 
 
 		 293 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288519  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6146  cytochrome c oxidase, subunit II  34.09 
 
 		 353 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870856  normal  0.304247 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3134  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 311 aa  43.9  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3416  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit III  40 
 
 		 325 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0306402 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4119  cytochrome c class I  31.58 
 
 		 271 aa  43.9  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.83541 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1956  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  37.97 
 
 		 322 aa  43.9  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12222  ubiquinol-cytochrome C reductase qcrC (cytochrome C subunit)  33.33 
 
 		 280 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6286  cytochrome c oxidase, subunit II  34.48 
 
 		 352 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.257472  normal  0.0263748 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4253  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  37.66 
 
 		 313 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2361  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  36.71 
 
 		 322 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1292  cytochrome c oxidase, subunit II  34.09 
 
 		 354 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493898  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1903  hypothetical protein  28.7 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.172183  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6539  cytochrome c, monohaem  34.48 
 
 		 434 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.537411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1988  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  37.04 
 
 		 323 aa  43.5  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0201798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2602  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  55.26 
 
 		 308 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000191523  normal  0.411563 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2794  cytochrome-c oxidase fixP chain  32.05 
 
 		 290 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40028  normal  0.764362 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1615  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  37.66 
 
 		 313 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0748863  normal  0.0271548 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2009  cytochrome c class I  34.57 
 
 		 259 aa  43.5  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3572  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  37.33 
 
 		 313 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1678  cytochrome c class I  32.97 
 
 		 289 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2001  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  40 
 
 		 325 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659912  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1820  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit III  36 
 
 		 327 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.700431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1824  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit III  40.68 
 
 		 317 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0435  hypothetical protein  27.21 
 
 		 314 aa  42  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0471891 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1140  cytochrome c, mono- and diheme variant  30.38 
 
 		 269 aa  42.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000421025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2009  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  36.71 
 
 		 322 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0902386  hitchhiker  0.0000000272898 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1966  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  36.71 
 
 		 322 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00926304  hitchhiker  0.00889683 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2655  cytochrome c class I  32.38 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2110  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  36.71 
 
 		 322 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0408813  normal  0.504179 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1794  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  36.71 
 
 		 325 aa  42.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.448855  normal  0.0580758 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4490  hypothetical protein  36.71 
 
 		 322 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2204  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  36.71 
 
 		 322 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000397613  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0783  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 372 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2693  cytochrome c class I  27.27 
 
 		 306 aa  42.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4516  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 197 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0581555  normal  0.874562 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2167  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  36.71 
 
 		 322 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0262117  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2217  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  38.27 
 
 		 318 aa  42  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.04222  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2217  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  36.71 
 
 		 322 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106993  normal  0.268308 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4148  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 205 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.967829  normal  0.37393 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2217  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  36.71 
 
 		 322 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000127298  normal  0.441817 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0945  cytochrome oxidase subunit II  33.33 
 
 		 372 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.891376  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1948  hypothetical protein  32.99 
 
 		 484 aa  41.6  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0771  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 381 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0315373  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4959  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  29.52 
 
 		 287 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.21117  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>