51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6158 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6158  cytochrome c class I  100 
 
 		 112 aa  231  3e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6928  cytochrome c class I  82.14 
 
 		 112 aa  191  4e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.405337 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1304  cytochrome c class I  91.76 
 
 		 112 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286942  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0942  cytochrome c class I  82.95 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.312729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1356  cytochrome c class I  60.53 
 
 		 111 aa  135  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.361491 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2618  cytochrome c class I  60.75 
 
 		 110 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.235794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1556  cytochrome c class I  59.65 
 
 		 108 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0799874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0428  cytochrome c class I  56.88 
 
 		 111 aa  130  9e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1301  cytochrome c class I  57.02 
 
 		 121 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.00128002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4714  conserved hypothetical protein; putative cytochrome c  58.16 
 
 		 105 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.361108  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5747  hypothetical protein  54.9 
 
 		 105 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1356  putative cytochrome c, class I  56.99 
 
 		 94 aa  110  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1376  cytochrome c, class I  60.76 
 
 		 104 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1925  hypothetical protein  45.95 
 
 		 108 aa  106  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.671288  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2879  cytochrome c class I  51.49 
 
 		 111 aa  105  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4040  hypothetical protein  44.12 
 
 		 104 aa  94.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.421503  normal  0.992488 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2468  cytochrome c class I  51.65 
 
 		 126 aa  91.7  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2568  cytochrome c class I  51.76 
 
 		 108 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0421494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0396  cytochrome c class I  47.66 
 
 		 108 aa  89  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2237  cytochrome c, class I  53.42 
 
 		 109 aa  83.6  9e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.499312  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0509  hypothetical protein  43.75 
 
 		 119 aa  73.9  0.0000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.601915  normal  0.8342 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4769  hypothetical protein  40.7 
 
 		 116 aa  67  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1034  hypothetical protein  60.87 
 
 		 54 aa  64.7  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2628  putative cytochrome c552 precursor  33.33 
 
 		 124 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.82926 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2462  cytochrome c class I  37.5 
 
 		 134 aa  50.4  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.933396  normal  0.762184 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0768  putative cytochrome c552 precursor  32.41 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1273  cytochrome c class I  29.13 
 
 		 115 aa  47.8  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0348  putative cytochrome c precursor  32.35 
 
 		 123 aa  47.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.198393 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4698  putative cytochrome c552 precursor  29.89 
 
 		 119 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1945  hypothetical protein  33.77 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.585194  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09091  cytochrome cM  32.91 
 
 		 125 aa  45.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.670452 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0438  putative cytochrome c552 precursor  32.26 
 
 		 124 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3165  cytochrome c class I  28 
 
 		 115 aa  45.4  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1478  cytochrome CytM  28.32 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.611234 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4355  cytochrome c6  28.44 
 
 		 110 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3135  cytochrome c, class I  35.29 
 
 		 289 aa  44.7  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11631  cytochrome cM  26.25 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.362816  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2157  hypothetical protein  33.33 
 
 		 171 aa  43.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.580825  normal  0.120798 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2147  cytochrome c class I  27.52 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.620434 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2103  cytochrome c class I  27.52 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1637  cytochrome c class I  31.46 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.416025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0849  putative cytochrome c precursor (cytochrome c552)(CycB)  25.89 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4349  cytochrome c class I  28.71 
 
 		 166 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.701954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11331  cytochrome cM  23.75 
 
 		 130 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.969799 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11621  hypothetical protein  25.32 
 
 		 100 aa  41.2  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1200  cytochrome c6  33.33 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4640  putative cytochrome c552 precursor  31.43 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3953  Quinoprotein glucose dehydrogenase  34.12 
 
 		 747 aa  41.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1068  cytochrome cM  25.32 
 
 		 128 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1579  hypothetical protein  30.61 
 
 		 127 aa  40  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.275291 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2561  cytochrome c, class I  32.05 
 
 		 131 aa  40  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>