33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0348 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0348  putative cytochrome c precursor  100 
 
 		 123 aa  251  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.198393 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4640  putative cytochrome c552 precursor  48.65 
 
 		 115 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0768  putative cytochrome c552 precursor  50.49 
 
 		 115 aa  102  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4698  putative cytochrome c552 precursor  43.75 
 
 		 119 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0849  putative cytochrome c precursor (cytochrome c552)(CycB)  40.54 
 
 		 114 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1579  hypothetical protein  51.81 
 
 		 127 aa  89  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.275291 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1273  cytochrome c class I  44.66 
 
 		 115 aa  85.1  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2628  putative cytochrome c552 precursor  46.05 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.82926 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0438  putative cytochrome c552 precursor  46.05 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3207  putative cytochrome C precursor  36.46 
 
 		 104 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.681994 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1945  hypothetical protein  36.59 
 
 		 111 aa  60.5  0.000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.585194  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2428  cytochrome c class I  35.8 
 
 		 104 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.49473  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3165  cytochrome c class I  36.36 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2197  cytochrome c, class I  32.97 
 
 		 104 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5816  cytochrome c-552 precursor  32.89 
 
 		 103 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.591248  normal  0.174311 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0679  putative cytochrome c  43.75 
 
 		 102 aa  50.8  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.440902 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6158  cytochrome c class I  32.35 
 
 		 112 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6928  cytochrome c class I  27.68 
 
 		 112 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.405337 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1637  cytochrome c class I  36.9 
 
 		 111 aa  46.2  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.416025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1449  cytochrome c oxidase, subunit II  36.36 
 
 		 346 aa  46.2  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.015711 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1304  cytochrome c class I  32.1 
 
 		 112 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286942  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3268  cytochrome C precursor  29.87 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1925  hypothetical protein  29.57 
 
 		 108 aa  45.1  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.671288  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4714  conserved hypothetical protein; putative cytochrome c  32.38 
 
 		 105 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.361108  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0396  cytochrome c class I  32.38 
 
 		 108 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0428  cytochrome c class I  27.83 
 
 		 111 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2568  cytochrome c class I  33.73 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0421494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1556  cytochrome c class I  33.73 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0799874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2618  cytochrome c class I  32.11 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.235794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0942  cytochrome c class I  32.05 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.312729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2879  cytochrome c class I  31.71 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5747  hypothetical protein  32.14 
 
 		 105 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1356  cytochrome c class I  32.53 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.361491 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>