21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2197 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2197  cytochrome c, class I  100 
 
 		 104 aa  215  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3268  cytochrome C precursor  76.7 
 
 		 104 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3207  putative cytochrome C precursor  67.31 
 
 		 104 aa  143  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.681994 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2428  cytochrome c class I  73.53 
 
 		 104 aa  138  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.49473  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1945  hypothetical protein  56.96 
 
 		 111 aa  97.8  4e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.585194  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3165  cytochrome c class I  45.36 
 
 		 115 aa  90.1  8e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5816  cytochrome c-552 precursor  48.75 
 
 		 103 aa  86.3  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.591248  normal  0.174311 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1637  cytochrome c class I  37.89 
 
 		 111 aa  67.4  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.416025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0679  putative cytochrome c  42.86 
 
 		 102 aa  65.1  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.440902 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4698  putative cytochrome c552 precursor  35.8 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1273  cytochrome c class I  35.64 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0348  putative cytochrome c precursor  32.97 
 
 		 123 aa  53.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.198393 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0768  putative cytochrome c552 precursor  31.58 
 
 		 115 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4640  putative cytochrome c552 precursor  32.89 
 
 		 115 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1579  hypothetical protein  34.09 
 
 		 127 aa  47  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.275291 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2628  putative cytochrome c552 precursor  30.77 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.82926 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0849  putative cytochrome c precursor (cytochrome c552)(CycB)  31.17 
 
 		 114 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1529  cytochrome c6  30.21 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.389738  normal  0.935702 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0438  putative cytochrome c552 precursor  30.26 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3552  cytochrome c, class I  35.29 
 
 		 128 aa  41.6  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2424  cytochrome c class I  28.7 
 
 		 132 aa  40  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.385069 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>