30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2628 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2628  putative cytochrome c552 precursor  100 
 
 		 124 aa  252  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.82926 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0438  putative cytochrome c552 precursor  85.48 
 
 		 124 aa  194  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1579  hypothetical protein  47.52 
 
 		 127 aa  92  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.275291 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4640  putative cytochrome c552 precursor  48 
 
 		 115 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1273  cytochrome c class I  39.18 
 
 		 115 aa  68.9  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0768  putative cytochrome c552 precursor  45.33 
 
 		 115 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0849  putative cytochrome c precursor (cytochrome c552)(CycB)  36.7 
 
 		 114 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0348  putative cytochrome c precursor  46.05 
 
 		 123 aa  62.8  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.198393 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4698  putative cytochrome c552 precursor  38.96 
 
 		 119 aa  60.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6158  cytochrome c class I  33.04 
 
 		 112 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1945  hypothetical protein  30.49 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.585194  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1376  cytochrome c, class I  32.04 
 
 		 104 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1556  cytochrome c class I  35.64 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0799874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1356  putative cytochrome c, class I  29.21 
 
 		 94 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1301  cytochrome c class I  34.83 
 
 		 121 aa  47  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.00128002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4714  conserved hypothetical protein; putative cytochrome c  30.77 
 
 		 105 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.361108  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3165  cytochrome c class I  31.96 
 
 		 115 aa  46.2  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1356  cytochrome c class I  34.65 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.361491 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2618  cytochrome c class I  33.02 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.235794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2197  cytochrome c, class I  30.77 
 
 		 104 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6928  cytochrome c class I  30.36 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.405337 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3207  putative cytochrome C precursor  33.33 
 
 		 104 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.681994 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3268  cytochrome C precursor  29.87 
 
 		 104 aa  43.5  0.0009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1304  cytochrome c class I  32.14 
 
 		 112 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286942  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4769  hypothetical protein  27.17 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0942  cytochrome c class I  29.55 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.312729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0428  cytochrome c class I  31.43 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1637  cytochrome c class I  32.08 
 
 		 111 aa  41.6  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.416025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2428  cytochrome c class I  27.63 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.49473  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5816  cytochrome c-552 precursor  29.27 
 
 		 103 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.591248  normal  0.174311 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>