34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1376 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1376  cytochrome c, class I  100 
 
 		 104 aa  214  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1356  putative cytochrome c, class I  79.79 
 
 		 94 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4714  conserved hypothetical protein; putative cytochrome c  73.08 
 
 		 105 aa  161  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.361108  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4040  hypothetical protein  64.42 
 
 		 104 aa  143  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.421503  normal  0.992488 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5747  hypothetical protein  61.32 
 
 		 105 aa  135  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2618  cytochrome c class I  54.81 
 
 		 110 aa  120  5e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.235794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0428  cytochrome c class I  55.56 
 
 		 111 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1356  cytochrome c class I  56.19 
 
 		 111 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.361491 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1301  cytochrome c class I  52.34 
 
 		 121 aa  114  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.00128002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1304  cytochrome c class I  64.56 
 
 		 112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286942  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1556  cytochrome c class I  55.24 
 
 		 108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0799874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6158  cytochrome c class I  60.76 
 
 		 112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0942  cytochrome c class I  60.26 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.312729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6928  cytochrome c class I  60.26 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.405337 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1925  hypothetical protein  47.22 
 
 		 108 aa  102  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.671288  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2879  cytochrome c class I  50 
 
 		 111 aa  97.8  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2468  cytochrome c class I  55.84 
 
 		 126 aa  92.8  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2237  cytochrome c, class I  51.11 
 
 		 109 aa  90.9  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.499312  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0509  hypothetical protein  45.19 
 
 		 119 aa  85.1  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.601915  normal  0.8342 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2568  cytochrome c class I  50 
 
 		 108 aa  81.6  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0421494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0396  cytochrome c class I  48.72 
 
 		 108 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1034  hypothetical protein  56.52 
 
 		 54 aa  62  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4769  hypothetical protein  38.27 
 
 		 116 aa  60.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2462  cytochrome c class I  36.26 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.933396  normal  0.762184 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2628  putative cytochrome c552 precursor  31.96 
 
 		 124 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.82926 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3135  cytochrome c, class I  36.84 
 
 		 289 aa  43.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0760  cytochrome c, class I  29.17 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.957716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09091  cytochrome cM  30.28 
 
 		 125 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.670452 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0438  putative cytochrome c552 precursor  32.05 
 
 		 124 aa  40.8  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11331  cytochrome cM  27.17 
 
 		 130 aa  40.4  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.969799 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3165  cytochrome c class I  30 
 
 		 115 aa  40.4  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1068  cytochrome cM  31.65 
 
 		 128 aa  40.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14180  cytochrome c, mono- and diheme variants family  31.87 
 
 		 266 aa  40  0.01  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.616928  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1200  cytochrome c6  35.29 
 
 		 111 aa  40  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>