35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2568 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2568  cytochrome c class I  100 
 
 		 108 aa  211  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0421494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0396  cytochrome c class I  75 
 
 		 108 aa  146  7e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2879  cytochrome c class I  60.61 
 
 		 111 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5747  hypothetical protein  56.12 
 
 		 105 aa  106  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2618  cytochrome c class I  49.09 
 
 		 110 aa  100  8e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.235794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6158  cytochrome c class I  48.6 
 
 		 112 aa  94.4  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0428  cytochrome c class I  43.24 
 
 		 111 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1356  cytochrome c class I  50 
 
 		 111 aa  93.6  9e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.361491 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1301  cytochrome c class I  45.13 
 
 		 121 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.00128002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4714  conserved hypothetical protein; putative cytochrome c  49.02 
 
 		 105 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.361108  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1556  cytochrome c class I  48.98 
 
 		 108 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0799874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1304  cytochrome c class I  50.59 
 
 		 112 aa  90.1  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286942  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1376  cytochrome c, class I  47.87 
 
 		 104 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6928  cytochrome c class I  46.23 
 
 		 112 aa  89  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.405337 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1356  putative cytochrome c, class I  44.68 
 
 		 94 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0942  cytochrome c class I  47.67 
 
 		 112 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.312729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1925  hypothetical protein  38.61 
 
 		 108 aa  80.1  0.000000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.671288  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4040  hypothetical protein  42.16 
 
 		 104 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.421503  normal  0.992488 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0509  hypothetical protein  41.35 
 
 		 119 aa  67.8  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.601915  normal  0.8342 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2237  cytochrome c, class I  41.94 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.499312  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4769  hypothetical protein  40.91 
 
 		 116 aa  63.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2468  cytochrome c class I  40.95 
 
 		 126 aa  62  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1637  cytochrome c class I  40 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.416025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2462  cytochrome c class I  36.78 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.933396  normal  0.762184 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1945  hypothetical protein  37.5 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.585194  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0768  putative cytochrome c552 precursor  34.62 
 
 		 115 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1579  hypothetical protein  34.58 
 
 		 127 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.275291 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0849  putative cytochrome c precursor (cytochrome c552)(CycB)  37.08 
 
 		 114 aa  43.5  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4698  putative cytochrome c552 precursor  31.73 
 
 		 119 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0348  putative cytochrome c precursor  33.73 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.198393 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3165  cytochrome c class I  29.81 
 
 		 115 aa  42  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09091  cytochrome cM  33.33 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.670452 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5816  cytochrome c-552 precursor  33.73 
 
 		 103 aa  40.8  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.591248  normal  0.174311 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2702  cytochrome c, class I  39.09 
 
 		 108 aa  40.4  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.482609  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1034  hypothetical protein  34.78 
 
 		 54 aa  40  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>