34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2879 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2879  cytochrome c class I  100 
 
 		 111 aa  216  6e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2618  cytochrome c class I  52.73 
 
 		 110 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.235794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2568  cytochrome c class I  63.53 
 
 		 108 aa  108  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0421494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1356  cytochrome c class I  51.4 
 
 		 111 aa  106  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.361491 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6158  cytochrome c class I  51.49 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1301  cytochrome c class I  55.21 
 
 		 121 aa  105  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.00128002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0428  cytochrome c class I  55.06 
 
 		 111 aa  105  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4714  conserved hypothetical protein; putative cytochrome c  52.04 
 
 		 105 aa  104  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.361108  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1356  putative cytochrome c, class I  55.17 
 
 		 94 aa  102  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1556  cytochrome c class I  50.47 
 
 		 108 aa  102  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0799874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0396  cytochrome c class I  62.03 
 
 		 108 aa  100  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1304  cytochrome c class I  55.95 
 
 		 112 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286942  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1376  cytochrome c, class I  50 
 
 		 104 aa  97.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6928  cytochrome c class I  46.23 
 
 		 112 aa  97.8  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.405337 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1925  hypothetical protein  43.14 
 
 		 108 aa  92.8  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.671288  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5747  hypothetical protein  48.1 
 
 		 105 aa  90.9  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0942  cytochrome c class I  51.72 
 
 		 112 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.312729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4040  hypothetical protein  43.16 
 
 		 104 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.421503  normal  0.992488 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0509  hypothetical protein  40.57 
 
 		 119 aa  69.3  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.601915  normal  0.8342 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2468  cytochrome c class I  46.75 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2237  cytochrome c, class I  37.63 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.499312  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4769  hypothetical protein  35.23 
 
 		 116 aa  52  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09091  cytochrome cM  30.89 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.670452 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1034  hypothetical protein  43.48 
 
 		 54 aa  48.9  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2462  cytochrome c class I  40.23 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.933396  normal  0.762184 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1637  cytochrome c class I  39.36 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.416025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5816  cytochrome c-552 precursor  35.29 
 
 		 103 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.591248  normal  0.174311 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1945  hypothetical protein  36.62 
 
 		 111 aa  44.7  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.585194  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3165  cytochrome c class I  34.29 
 
 		 115 aa  43.9  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11331  cytochrome cM  22.89 
 
 		 130 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.969799 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3207  putative cytochrome C precursor  35.29 
 
 		 104 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.681994 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0348  putative cytochrome c precursor  31.71 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.198393 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4698  putative cytochrome c552 precursor  30.63 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1478  cytochrome CytM  29.63 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.611234 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>