20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1034 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1034  hypothetical protein  100 
 
 		 54 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1925  hypothetical protein  86.05 
 
 		 108 aa  81.3  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.671288  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2618  cytochrome c class I  63.04 
 
 		 110 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.235794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5747  hypothetical protein  58.7 
 
 		 105 aa  65.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0428  cytochrome c class I  62.79 
 
 		 111 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1304  cytochrome c class I  63.04 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286942  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0942  cytochrome c class I  60.87 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.312729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6158  cytochrome c class I  60.87 
 
 		 112 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1356  putative cytochrome c, class I  62.79 
 
 		 94 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6928  cytochrome c class I  56.52 
 
 		 112 aa  62  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.405337 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4714  conserved hypothetical protein; putative cytochrome c  54.35 
 
 		 105 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.361108  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1376  cytochrome c, class I  56.52 
 
 		 104 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4040  hypothetical protein  54.35 
 
 		 104 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.421503  normal  0.992488 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1356  cytochrome c class I  53.49 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.361491 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1301  cytochrome c class I  51.16 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.00128002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1556  cytochrome c class I  51.16 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0799874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0509  hypothetical protein  51.11 
 
 		 119 aa  52.4  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.601915  normal  0.8342 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2468  cytochrome c class I  51.16 
 
 		 126 aa  51.2  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2879  cytochrome c class I  43.48 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2237  cytochrome c, class I  54.84 
 
 		 109 aa  43.9  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.499312  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>