29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2468 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2468  cytochrome c class I  100 
 
 		 126 aa  248  2e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0942  cytochrome c class I  57.5 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.312729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1301  cytochrome c class I  59.74 
 
 		 121 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.00128002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6928  cytochrome c class I  53.26 
 
 		 112 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.405337 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0428  cytochrome c class I  52.75 
 
 		 111 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1356  cytochrome c class I  58.44 
 
 		 111 aa  97.1  7e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.361491 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1556  cytochrome c class I  57.14 
 
 		 108 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0799874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2618  cytochrome c class I  58.44 
 
 		 110 aa  93.6  8e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.235794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1376  cytochrome c, class I  55.84 
 
 		 104 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1925  hypothetical protein  40.52 
 
 		 108 aa  92  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.671288  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6158  cytochrome c class I  51.65 
 
 		 112 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1356  putative cytochrome c, class I  54.55 
 
 		 94 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5747  hypothetical protein  55.84 
 
 		 105 aa  90.1  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4714  conserved hypothetical protein; putative cytochrome c  48.08 
 
 		 105 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.361108  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1304  cytochrome c class I  55.84 
 
 		 112 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286942  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4040  hypothetical protein  51.95 
 
 		 104 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.421503  normal  0.992488 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0509  hypothetical protein  46.9 
 
 		 119 aa  82  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.601915  normal  0.8342 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2237  cytochrome c, class I  50.77 
 
 		 109 aa  69.7  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.499312  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2879  cytochrome c class I  46.75 
 
 		 111 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2568  cytochrome c class I  40.74 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0421494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2462  cytochrome c class I  41.11 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.933396  normal  0.762184 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0396  cytochrome c class I  36.36 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1034  hypothetical protein  51.16 
 
 		 54 aa  51.2  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4769  hypothetical protein  34.62 
 
 		 116 aa  50.4  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2466  cytochrome c class I  36.78 
 
 		 138 aa  47  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1273  cytochrome c class I  30.58 
 
 		 115 aa  46.2  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1088  cytochrome c, class I  35.29 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000582284  hitchhiker  0.0000137635 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3190  cytochrome c class I  25.66 
 
 		 111 aa  40.4  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09091  cytochrome cM  33.33 
 
 		 125 aa  40  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.670452 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>