48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6928 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6928  cytochrome c class I  100 
 
 		 112 aa  226  7e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.405337 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6158  cytochrome c class I  82.14 
 
 		 112 aa  191  4e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0942  cytochrome c class I  81.82 
 
 		 112 aa  153  6e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.312729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1304  cytochrome c class I  83.53 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286942  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1356  cytochrome c class I  60.38 
 
 		 111 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.361491 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2618  cytochrome c class I  59.63 
 
 		 110 aa  128  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.235794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1556  cytochrome c class I  59.43 
 
 		 108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0799874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1301  cytochrome c class I  53.72 
 
 		 121 aa  124  6e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.00128002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0428  cytochrome c class I  53.57 
 
 		 111 aa  122  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4714  conserved hypothetical protein; putative cytochrome c  58.16 
 
 		 105 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.361108  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1925  hypothetical protein  49.55 
 
 		 108 aa  110  7.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.671288  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5747  hypothetical protein  51.96 
 
 		 105 aa  108  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1356  putative cytochrome c, class I  60.26 
 
 		 94 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1376  cytochrome c, class I  60.26 
 
 		 104 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2468  cytochrome c class I  53.26 
 
 		 126 aa  98.2  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2879  cytochrome c class I  46.23 
 
 		 111 aa  97.8  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4040  hypothetical protein  50.59 
 
 		 104 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.421503  normal  0.992488 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2568  cytochrome c class I  47.06 
 
 		 108 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0421494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0396  cytochrome c class I  46.84 
 
 		 108 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2237  cytochrome c, class I  43.43 
 
 		 109 aa  79.7  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.499312  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0509  hypothetical protein  42.34 
 
 		 119 aa  75.5  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.601915  normal  0.8342 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1034  hypothetical protein  56.52 
 
 		 54 aa  62  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4769  hypothetical protein  36.05 
 
 		 116 aa  60.5  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0768  putative cytochrome c552 precursor  31.48 
 
 		 115 aa  50.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4640  putative cytochrome c552 precursor  30.97 
 
 		 115 aa  50.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1273  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 115 aa  50.1  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0849  putative cytochrome c precursor (cytochrome c552)(CycB)  27.68 
 
 		 114 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09091  cytochrome cM  35.06 
 
 		 125 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.670452 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2462  cytochrome c class I  32.8 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.933396  normal  0.762184 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1478  cytochrome CytM  30.25 
 
 		 145 aa  47  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.611234 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0348  putative cytochrome c precursor  27.68 
 
 		 123 aa  46.2  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.198393 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15291  cytochrome cM  26.09 
 
 		 129 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.427205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2628  putative cytochrome c552 precursor  30.68 
 
 		 124 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.82926 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4698  putative cytochrome c552 precursor  27.59 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1945  hypothetical protein  32.47 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.585194  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2147  cytochrome c class I  28.7 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.620434 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2103  cytochrome c class I  28.7 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11631  cytochrome cM  27.71 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.362816  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11331  cytochrome cM  25 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.969799 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0695  cytochrome c  24.74 
 
 		 129 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3942  cytochrome c class I  27.03 
 
 		 109 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.914915 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1579  hypothetical protein  31.63 
 
 		 127 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.275291 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1068  cytochrome cM  27.16 
 
 		 128 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11621  hypothetical protein  27.16 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3135  cytochrome c, class I  34.12 
 
 		 289 aa  40.8  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1827  cytochrome c class I  33.73 
 
 		 280 aa  40.4  0.009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12130  cytochrome c, mono- and diheme variants family  27.78 
 
 		 256 aa  40  0.01  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.298886  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2140  cytochrome c class I  29.59 
 
 		 124 aa  40  0.01  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.986487  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>