26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2466 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2466  cytochrome c class I  100 
 
 		 138 aa  274  3e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1637  cytochrome c class I  41.03 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.416025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2468  cytochrome c class I  36.78 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1945  hypothetical protein  35.65 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.585194  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1301  cytochrome c class I  37.66 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.00128002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0396  cytochrome c class I  40.79 
 
 		 108 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1556  cytochrome c class I  34.15 
 
 		 108 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0799874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0348  putative cytochrome c precursor  36.75 
 
 		 123 aa  51.2  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.198393 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5747  hypothetical protein  34.95 
 
 		 105 aa  50.8  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1356  cytochrome c class I  34.15 
 
 		 111 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.361491 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4714  conserved hypothetical protein; putative cytochrome c  35.37 
 
 		 105 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.361108  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6158  cytochrome c class I  32.93 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0509  hypothetical protein  35.23 
 
 		 119 aa  48.9  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.601915  normal  0.8342 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2568  cytochrome c class I  39.47 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0421494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0942  cytochrome c class I  31.71 
 
 		 112 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.312729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2618  cytochrome c class I  33.75 
 
 		 110 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.235794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6928  cytochrome c class I  31.78 
 
 		 112 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.405337 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1376  cytochrome c, class I  36.36 
 
 		 104 aa  47.4  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1304  cytochrome c class I  32.5 
 
 		 112 aa  47  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286942  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2462  cytochrome c class I  34.69 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.933396  normal  0.762184 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0428  cytochrome c class I  32.5 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1356  putative cytochrome c, class I  32.47 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1925  hypothetical protein  30.38 
 
 		 108 aa  44.7  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.671288  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3165  cytochrome c class I  31.19 
 
 		 115 aa  42  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4769  hypothetical protein  32.05 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2237  cytochrome c, class I  40.35 
 
 		 109 aa  40  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.499312  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>