34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3165 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3165  cytochrome c class I  100 
 
 		 115 aa  233  5.0000000000000005e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2197  cytochrome c, class I  46.51 
 
 		 104 aa  88.2  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3207  putative cytochrome C precursor  43.69 
 
 		 104 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.681994 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2428  cytochrome c class I  45.24 
 
 		 104 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.49473  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3268  cytochrome C precursor  43.53 
 
 		 104 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1945  hypothetical protein  41.77 
 
 		 111 aa  75.5  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.585194  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5816  cytochrome c-552 precursor  43.75 
 
 		 103 aa  74.3  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.591248  normal  0.174311 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1637  cytochrome c class I  42.57 
 
 		 111 aa  72  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.416025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4698  putative cytochrome c552 precursor  33.94 
 
 		 119 aa  60.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0348  putative cytochrome c precursor  36.36 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.198393 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1273  cytochrome c class I  39.58 
 
 		 115 aa  55.8  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4640  putative cytochrome c552 precursor  34.44 
 
 		 115 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0849  putative cytochrome c precursor (cytochrome c552)(CycB)  35.53 
 
 		 114 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0768  putative cytochrome c552 precursor  30.25 
 
 		 115 aa  50.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1304  cytochrome c class I  32.89 
 
 		 112 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286942  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2628  putative cytochrome c552 precursor  31.25 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.82926 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1579  hypothetical protein  31.19 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.275291 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4714  conserved hypothetical protein; putative cytochrome c  32.89 
 
 		 105 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.361108  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6158  cytochrome c class I  28 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1301  cytochrome c class I  33.73 
 
 		 121 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.00128002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2879  cytochrome c class I  34.29 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2462  cytochrome c class I  32.18 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.933396  normal  0.762184 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2466  cytochrome c class I  31.19 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2618  cytochrome c class I  31.07 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.235794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1356  putative cytochrome c, class I  30.26 
 
 		 94 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1484  hypothetical protein  31.33 
 
 		 87 aa  42  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.267728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0438  putative cytochrome c552 precursor  31.17 
 
 		 124 aa  41.2  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0679  putative cytochrome c  33.68 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.440902 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0942  cytochrome c class I  28.95 
 
 		 112 aa  40.8  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.312729  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1581  PA14 domain protein  32.35 
 
 		 969 aa  40.4  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1376  cytochrome c, class I  30 
 
 		 104 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1630  cytochrome c6  31.03 
 
 		 111 aa  40.4  0.009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0702858 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1556  cytochrome c class I  30.77 
 
 		 108 aa  40  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0799874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1356  cytochrome c class I  30.77 
 
 		 111 aa  40  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.361491 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>