32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0768 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0768  putative cytochrome c552 precursor  100 
 
 		 115 aa  237  5e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4640  putative cytochrome c552 precursor  76.52 
 
 		 115 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0849  putative cytochrome c precursor (cytochrome c552)(CycB)  65.79 
 
 		 114 aa  154  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4698  putative cytochrome c552 precursor  56.36 
 
 		 119 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0348  putative cytochrome c precursor  50.49 
 
 		 123 aa  102  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.198393 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1273  cytochrome c class I  46.15 
 
 		 115 aa  73.9  0.0000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0438  putative cytochrome c552 precursor  48 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2628  putative cytochrome c552 precursor  45.33 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.82926 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1579  hypothetical protein  36.54 
 
 		 127 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.275291 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5816  cytochrome c-552 precursor  38.16 
 
 		 103 aa  51.2  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.591248  normal  0.174311 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6928  cytochrome c class I  31.48 
 
 		 112 aa  50.8  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.405337 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3165  cytochrome c class I  30.25 
 
 		 115 aa  50.8  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2428  cytochrome c class I  31.76 
 
 		 104 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.49473  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6158  cytochrome c class I  32.41 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2618  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 110 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.235794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3207  putative cytochrome C precursor  33.71 
 
 		 104 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.681994 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1301  cytochrome c class I  32.23 
 
 		 121 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.00128002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2197  cytochrome c, class I  31.58 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1945  hypothetical protein  33.33 
 
 		 111 aa  45.4  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.585194  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1304  cytochrome c class I  30.86 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286942  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0428  cytochrome c class I  30.63 
 
 		 111 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3268  cytochrome C precursor  32.91 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2568  cytochrome c class I  34.62 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0421494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1637  cytochrome c class I  33.03 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.416025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6572  cytochrome c, monohaem  32.94 
 
 		 352 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.381109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4040  hypothetical protein  25.93 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.421503  normal  0.992488 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6539  cytochrome c, monohaem  32.94 
 
 		 434 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.537411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1292  cytochrome c oxidase, subunit II  32.94 
 
 		 354 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493898  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6146  cytochrome c oxidase, subunit II  32.94 
 
 		 353 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870856  normal  0.304247 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0942  cytochrome c class I  30 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.312729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5502  cytochrome c oxidase, subunit II  33.77 
 
 		 370 aa  40.4  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.535121  normal  0.0572426 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0396  cytochrome c class I  32.05 
 
 		 108 aa  40  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22488  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>