38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0396 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0396  cytochrome c class I  100 
 
 		 108 aa  208  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2568  cytochrome c class I  80 
 
 		 108 aa  142  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0421494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2879  cytochrome c class I  60.23 
 
 		 111 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1356  cytochrome c class I  51.52 
 
 		 111 aa  100  9e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.361491 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2618  cytochrome c class I  50.54 
 
 		 110 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.235794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0428  cytochrome c class I  45.1 
 
 		 111 aa  97.4  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6158  cytochrome c class I  48.6 
 
 		 112 aa  97.1  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1556  cytochrome c class I  50.51 
 
 		 108 aa  96.7  8e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0799874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1301  cytochrome c class I  50 
 
 		 121 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.00128002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4714  conserved hypothetical protein; putative cytochrome c  48.57 
 
 		 105 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.361108  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1304  cytochrome c class I  48.24 
 
 		 112 aa  90.1  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286942  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5747  hypothetical protein  48.86 
 
 		 105 aa  89.7  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6928  cytochrome c class I  45.1 
 
 		 112 aa  88.6  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.405337 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0942  cytochrome c class I  47.06 
 
 		 112 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.312729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1376  cytochrome c, class I  44.33 
 
 		 104 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1925  hypothetical protein  39.81 
 
 		 108 aa  80.5  0.000000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.671288  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1356  putative cytochrome c, class I  40.66 
 
 		 94 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2237  cytochrome c, class I  43.82 
 
 		 109 aa  74.7  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.499312  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4040  hypothetical protein  41.67 
 
 		 104 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.421503  normal  0.992488 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0509  hypothetical protein  40.91 
 
 		 119 aa  68.6  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.601915  normal  0.8342 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4769  hypothetical protein  38.89 
 
 		 116 aa  67.8  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1637  cytochrome c class I  40 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.416025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2468  cytochrome c class I  36.05 
 
 		 126 aa  57  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2462  cytochrome c class I  35.63 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.933396  normal  0.762184 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1945  hypothetical protein  30.43 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.585194  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0945  cytochrome oxidase subunit II  37.37 
 
 		 372 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.891376  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0783  cytochrome c oxidase, subunit II  37.37 
 
 		 372 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0771  cytochrome c oxidase, subunit II  37.37 
 
 		 381 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0315373  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0348  putative cytochrome c precursor  32.38 
 
 		 123 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.198393 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0849  putative cytochrome c precursor (cytochrome c552)(CycB)  30.1 
 
 		 114 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4698  putative cytochrome c552 precursor  32.69 
 
 		 119 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2466  cytochrome c class I  40.79 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09091  cytochrome cM  31.33 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.670452 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3165  cytochrome c class I  31.33 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0768  putative cytochrome c552 precursor  34.07 
 
 		 115 aa  42  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5816  cytochrome c-552 precursor  34.12 
 
 		 103 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.591248  normal  0.174311 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11621  hypothetical protein  27.71 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1068  cytochrome cM  27.71 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>