47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1304 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1304  cytochrome c class I  100 
 
 		 112 aa  222  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286942  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6158  cytochrome c class I  81.65 
 
 		 112 aa  174  5e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6928  cytochrome c class I  72.64 
 
 		 112 aa  159  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.405337 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0942  cytochrome c class I  81.4 
 
 		 112 aa  148  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.312729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2618  cytochrome c class I  66.35 
 
 		 110 aa  136  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.235794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1356  cytochrome c class I  66 
 
 		 111 aa  134  5e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.361491 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1556  cytochrome c class I  65 
 
 		 108 aa  130  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0799874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1301  cytochrome c class I  58.77 
 
 		 121 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.00128002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0428  cytochrome c class I  58.82 
 
 		 111 aa  125  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1356  putative cytochrome c, class I  60.22 
 
 		 94 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4714  conserved hypothetical protein; putative cytochrome c  57.69 
 
 		 105 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.361108  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1376  cytochrome c, class I  60.92 
 
 		 104 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5747  hypothetical protein  55.1 
 
 		 105 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1925  hypothetical protein  55.95 
 
 		 108 aa  107  6e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.671288  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2879  cytochrome c class I  56.04 
 
 		 111 aa  103  7e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4040  hypothetical protein  47.12 
 
 		 104 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.421503  normal  0.992488 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0396  cytochrome c class I  50 
 
 		 108 aa  93.6  8e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2468  cytochrome c class I  55.84 
 
 		 126 aa  89.4  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2568  cytochrome c class I  50.59 
 
 		 108 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0421494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2237  cytochrome c, class I  51.76 
 
 		 109 aa  85.1  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.499312  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0509  hypothetical protein  46.88 
 
 		 119 aa  78.2  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.601915  normal  0.8342 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4769  hypothetical protein  40.45 
 
 		 116 aa  71.2  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1034  hypothetical protein  63.04 
 
 		 54 aa  65.9  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1945  hypothetical protein  30.69 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.585194  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2462  cytochrome c class I  37.5 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.933396  normal  0.762184 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3165  cytochrome c class I  34.19 
 
 		 115 aa  48.9  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2628  putative cytochrome c552 precursor  31.96 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.82926 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0348  putative cytochrome c precursor  31.13 
 
 		 123 aa  47  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.198393 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1273  cytochrome c class I  27.72 
 
 		 115 aa  47  0.00009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09091  cytochrome cM  33.33 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.670452 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0768  putative cytochrome c552 precursor  29.82 
 
 		 115 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4355  cytochrome c6  32.38 
 
 		 110 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4698  putative cytochrome c552 precursor  31.33 
 
 		 119 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1478  cytochrome CytM  32.95 
 
 		 145 aa  44.3  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.611234 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3135  cytochrome c, class I  39.02 
 
 		 289 aa  44.3  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1637  cytochrome c class I  32.38 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.416025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0438  putative cytochrome c552 precursor  32.18 
 
 		 124 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11631  cytochrome cM  26.51 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.362816  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1200  cytochrome c6  34.86 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11331  cytochrome cM  24.1 
 
 		 130 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.969799 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2561  cytochrome c, class I  31.87 
 
 		 131 aa  42  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1068  cytochrome cM  26.58 
 
 		 128 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4640  putative cytochrome c552 precursor  30.43 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1827  cytochrome c class I  33.71 
 
 		 280 aa  41.2  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2992  cytochrome c class I  30.95 
 
 		 187 aa  40.8  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.169382  normal  0.0463014 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11621  hypothetical protein  26.58 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2157  hypothetical protein  29.37 
 
 		 171 aa  40  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.580825  normal  0.120798 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>