57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_11631 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_11631  cytochrome cM  100 
 
 
100 aa  206  9e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.362816  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11621  hypothetical protein  94 
 
 
100 aa  198  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1068  cytochrome cM  91 
 
 
128 aa  196  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11331  cytochrome cM  58.59 
 
 
130 aa  128  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.969799 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15291  cytochrome cM  59.38 
 
 
129 aa  121  3e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.427205  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0695  cytochrome c  61.63 
 
 
129 aa  120  7e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09091  cytochrome cM  48.51 
 
 
125 aa  112  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.670452 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1948  cytochrome cM  42.42 
 
 
137 aa  105  1e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1478  cytochrome CytM  44.44 
 
 
145 aa  103  8e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.611234 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0717  cytochrome cM  47.67 
 
 
129 aa  99  2e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2147  cytochrome c class I  44.94 
 
 
124 aa  90.1  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.620434 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2103  cytochrome c class I  44.94 
 
 
124 aa  90.1  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2140  cytochrome c class I  40.2 
 
 
124 aa  88.6  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.986487  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3942  cytochrome c class I  41.86 
 
 
109 aa  87  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.914915 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3662  cytochrome c class I  44.19 
 
 
124 aa  84  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4020  cytochrome c, class I  39.58 
 
 
124 aa  80.9  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.442148  normal  0.970341 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2140  cytochrome c, class I  39.53 
 
 
87 aa  73.9  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0189398  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1556  cytochrome c class I  29.89 
 
 
108 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0799874  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1356  cytochrome c class I  29.89 
 
 
111 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.361491 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1814  hypothetical protein  35.71 
 
 
151 aa  47.4  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5653  cytochrome c-551  27.17 
 
 
107 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.432356 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5303  cytochrome c-551  27.17 
 
 
107 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2618  cytochrome c class I  28.57 
 
 
110 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.235794  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1301  cytochrome c class I  28.74 
 
 
121 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.00128002  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0428  cytochrome c class I  30.12 
 
 
111 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3273  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  32.5 
 
 
293 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288519  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1358  cb-type cytochrome c oxidase subunit III  29.49 
 
 
152 aa  44.3  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.112598  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5100  cytochrome c class I  34.88 
 
 
284 aa  43.9  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.449412  normal  0.538396 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2575  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  36.59 
 
 
307 aa  43.9  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.991261  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5233  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  33.75 
 
 
293 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.558245  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2114  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  33.75 
 
 
293 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0018  cytochrome c, class I  40.68 
 
 
138 aa  43.9  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4979  cytochrome c-551  26.32 
 
 
107 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1304  cytochrome c class I  26.51 
 
 
112 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286942  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6158  cytochrome c class I  26.25 
 
 
112 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1913  hypothetical protein  41.18 
 
 
154 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000530569  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5348  cytochrome c-551  26.92 
 
 
107 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0942  cytochrome c class I  28.21 
 
 
112 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.312729  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1903  hypothetical protein  32.61 
 
 
110 aa  42  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.172183  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0062  Pyrrolo-quinoline quinone  29.49 
 
 
704 aa  42.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.387664 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6928  cytochrome c class I  27.71 
 
 
112 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.405337 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5291  cytochrome c-551  26.92 
 
 
107 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2794  cytochrome-c oxidase fixP chain  29.11 
 
 
290 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40028  normal  0.764362 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2773  hypothetical protein  36.47 
 
 
151 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000119865  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4880  cytochrome c-551  25 
 
 
107 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5035  cytochrome c-551  25 
 
 
107 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4865  cytochrome c-551  25 
 
 
107 aa  42  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5273  cytochrome c-551  25 
 
 
107 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.717075 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5417  cytochrome c-551  25 
 
 
107 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0656  cytochrome c, class I  33.33 
 
 
283 aa  42  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.93712 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0017  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  34.21 
 
 
293 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2412  cytochrome c class I  30.43 
 
 
120 aa  40.8  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000673714  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2730  cytochrome c550, putative  32.79 
 
 
148 aa  40.4  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0787829  normal  0.668449 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1229  cytochrome c class I  30.38 
 
 
98 aa  40.4  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3331  cytochrome d1, heme region  32.47 
 
 
519 aa  40.4  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5664  cytochrome c class I  44.74 
 
 
443 aa  40.4  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.239336  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5747  hypothetical protein  29.11 
 
 
105 aa  40.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>