45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0695 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0695  cytochrome c  100 
 
 		 129 aa  266  7e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15291  cytochrome cM  95.35 
 
 		 129 aa  257  4e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.427205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11331  cytochrome cM  57.8 
 
 		 130 aa  135  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.969799 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1948  cytochrome cM  48.15 
 
 		 137 aa  130  5e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1068  cytochrome cM  56 
 
 		 128 aa  124  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11621  hypothetical protein  58.33 
 
 		 100 aa  124  6e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09091  cytochrome cM  48.04 
 
 		 125 aa  120  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.670452 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11631  cytochrome cM  61.63 
 
 		 100 aa  120  7e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.362816  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0717  cytochrome cM  48.94 
 
 		 129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2147  cytochrome c class I  45.45 
 
 		 124 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.620434 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2103  cytochrome c class I  45.45 
 
 		 124 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2140  cytochrome c class I  49.41 
 
 		 124 aa  98.6  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.986487  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1478  cytochrome CytM  37.3 
 
 		 145 aa  97.4  6e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.611234 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3662  cytochrome c class I  49.41 
 
 		 124 aa  96.7  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4020  cytochrome c, class I  42.24 
 
 		 124 aa  95.1  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.442148  normal  0.970341 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2140  cytochrome c, class I  45.88 
 
 		 87 aa  86.7  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0189398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3942  cytochrome c class I  40 
 
 		 109 aa  82.8  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.914915 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0656  cytochrome c, class I  38.82 
 
 		 283 aa  54.3  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.93712 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0018  cytochrome c, class I  40.98 
 
 		 138 aa  47.4  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3795  cytochrome c oxidase subunit II  27.55 
 
 		 382 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4872  cytochrome c oxidase subunit II  27.55 
 
 		 382 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.780427  normal  0.052805 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0555  cytochrome c, class I  32.56 
 
 		 407 aa  44.3  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.474157  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2794  cytochrome-c oxidase fixP chain  29.63 
 
 		 290 aa  44.3  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40028  normal  0.764362 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1913  hypothetical protein  24.11 
 
 		 154 aa  43.9  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000530569  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5130  cytochrome c oxidase subunit II  28.72 
 
 		 384 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1903  hypothetical protein  34.72 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.172183  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0683  cytochrome c class I  34.18 
 
 		 381 aa  42.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2009  cytochrome c class I  28.97 
 
 		 259 aa  42.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5936  cytochrome c oxidase subunit II  28.26 
 
 		 382 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2776  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  30.34 
 
 		 310 aa  42.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000169467 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6209  cytochrome c oxidase, subunit II  28.26 
 
 		 382 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6928  cytochrome c class I  24.74 
 
 		 112 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.405337 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3273  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.57 
 
 		 293 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288519  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0726  cytochrome c oxidase, subunit II  29.03 
 
 		 388 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.631169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2102  cytochrome c, class I  35.06 
 
 		 268 aa  42  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.895116  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0942  cytochrome c class I  22.5 
 
 		 329 aa  41.2  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.240089 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1045  cytochrome c class I  29.73 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4302  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  32.58 
 
 		 305 aa  41.2  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0300725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1229  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 98 aa  40.4  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7362  cytochrome c oxidase, subunit II  25.27 
 
 		 394 aa  40.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3331  cytochrome d1, heme region  33.33 
 
 		 519 aa  40.4  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0843  TPR repeat-containing protein  28.99 
 
 		 330 aa  40  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1564  cytochrome C oxidase polypeptide II  26.09 
 
 		 384 aa  40.4  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1779  cytochrome c, class I  32.47 
 
 		 214 aa  40  0.01  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0282319 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3190  cytochrome c class I  29.73 
 
 		 111 aa  40  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>