288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0062 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_4957  Pyrrolo-quinoline quinone  49.58 
 
 
698 aa  729    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.897916 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1014  Quinoprotein glucose dehydrogenase  49.01 
 
 
732 aa  655    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.101534  normal  0.630139 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1900  quinoprotein glucose dehydrogenase  51.8 
 
 
720 aa  660    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0062  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 
704 aa  1422    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.387664 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2450  PQQ-dependent enzyme-like protein  52.95 
 
 
718 aa  701    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264561  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1378  Quinoprotein glucose dehydrogenase  49.59 
 
 
769 aa  696    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.618452 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1132  PQQ-dependent enzyme-like protein  49.78 
 
 
701 aa  691    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0946665  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3953  Quinoprotein glucose dehydrogenase  50.42 
 
 
747 aa  691    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2704  Quinoprotein glucose dehydrogenase  49.44 
 
 
731 aa  692    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0311  Pyrrolo-quinoline quinone  53 
 
 
705 aa  707    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.394174 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1611  Glycerol dehydrogenase (acceptor)  45.34 
 
 
722 aa  599  1e-170  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1054  quinoprotein glucose dehydrogenase  33.99 
 
 
669 aa  333  5e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.236917 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1594  glucose dehydrogenase  39.17 
 
 
651 aa  324  4e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5932  quinate/shikimate dehydrogenase, putative  38.85 
 
 
671 aa  318  2e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0107565 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1469  membrane-bound PQQ-dependent dehydrogenase, glucose/quinate/shikimate family  32.69 
 
 
818 aa  305  2.0000000000000002e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.128704  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2593  quinoprotein glucose dehydrogenase  35.37 
 
 
639 aa  300  6e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.238471  normal  0.0735284 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2382  membrane-bound PQQ-dependent dehydrogenase, glucose/quinate/shikimate family  33.24 
 
 
807 aa  299  1e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.220002  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3055  Pyrrolo-quinoline quinone  32.81 
 
 
853 aa  294  4e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000520854  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3825  membrane-bound PQQ-dependent dehydrogenase, glucose/quinate/shikimate family  32.52 
 
 
800 aa  291  3e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5965  membrane-bound PQQ-dependent dehydrogenase, glucose/quinate/shikimate family  31.47 
 
 
798 aa  288  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.558391 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2577  membrane-bound PQQ-dependent dehydrogenase, glucose/quinate/shikimate family  32.11 
 
 
840 aa  287  4e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.135772  normal  0.263585 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1505  quinoprotein glucose dehydrogenase  31.91 
 
 
809 aa  283  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.900806  normal  0.427809 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3100  quinoprotein glucose dehydrogenase  32.48 
 
 
791 aa  281  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.236384 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4849  Pyrrolo-quinoline quinone  32.07 
 
 
803 aa  275  2.0000000000000002e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.97652  hitchhiker  0.0000763384 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3539  quinoprotein glucose dehydrogenase  32.53 
 
 
724 aa  273  6e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.331402  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3478  membrane-bound PQQ-dependent dehydrogenase, glucose/quinate/shikimate family  30.28 
 
 
796 aa  268  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0134  quinoprotein glucose dehydrogenase  30.28 
 
 
796 aa  268  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00123  glucose dehydrogenase  30.28 
 
 
796 aa  267  4e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.833605  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0126  glucose dehydrogenase  30.28 
 
 
796 aa  267  4e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00122  hypothetical protein  30.28 
 
 
796 aa  267  4e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.793225  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3535  PQQ-dependent dehydrogenase glucose/quinate/shikimate family protein  30.28 
 
 
796 aa  267  4e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0132  quinoprotein glucose dehydrogenase  30.28 
 
 
796 aa  267  4e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.556262  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2112  Pyrrolo-quinoline quinone  30.04 
 
 
814 aa  266  1e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2831  quinoprotein glucose dehydrogenase  30.62 
 
 
828 aa  262  1e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.871062  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5248  pyrroloquinoline-quinone-dependent quinate dehydrogenase  28.97 
 
 
809 aa  259  1e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.685305  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2415  Pyrrolo-quinoline quinone  28.85 
 
 
811 aa  244  3e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00299347  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2024  quinoprotein glucose dehydrogenase  30.69 
 
 
784 aa  236  9e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.963256  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3930  quinoprotein  36.08 
 
 
807 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000484282 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1963  quinate dehydrogenase (pyrroloquinoline-quinone)  32.44 
 
 
794 aa  236  1.0000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7581  quinoprotein glucose dehydrogenase  34.68 
 
 
799 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232583  normal  0.85577 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5562  PQQ-dependent dehydrogenase glucose/quinate/shikimate family protein  35.97 
 
 
800 aa  234  5e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2843  glucose dehydrogenase  34.38 
 
 
777 aa  234  6e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.48538  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4196  glucose dehydrogenase  34.73 
 
 
747 aa  232  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0672  quinoprotein glucose dehydrogenase  31.87 
 
 
796 aa  233  1e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.570981  normal  0.18059 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0201  quinoprotein glucose dehydrogenase  33.26 
 
 
747 aa  231  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0184  quinoprotein glucose dehydrogenase  33.05 
 
 
747 aa  231  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.23859  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0185  quinoprotein glucose dehydrogenase  33.05 
 
 
747 aa  230  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.266992  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0193  quinoprotein glucose dehydrogenase  33.05 
 
 
747 aa  230  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52734  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0188  quinoprotein glucose dehydrogenase  33.05 
 
 
796 aa  230  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.683326 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2568  glucose dehydrogenase  34.43 
 
 
788 aa  228  3e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0173  quinoprotein glucose dehydrogenase  35.79 
 
 
799 aa  228  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4577  quinoprotein glucose dehydrogenase  34.38 
 
 
803 aa  225  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40050  Quinoprotein glucose dehydrogenase  33.86 
 
 
801 aa  224  3e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0128  glucose dehydrogenase  31.03 
 
 
796 aa  224  3e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.126967  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3089  membrane-bound PQQ-dependent dehydrogenase, glucose/quinate/shikimate family  35.18 
 
 
800 aa  224  3e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.17686  normal  0.0332501 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0294  Pyrrolo-quinoline quinone  34.63 
 
 
776 aa  223  7e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2956  PQQ-dependent dehydrogenase glucose/quinate/shikimate family protein  33.26 
 
 
805 aa  223  7e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0315407  normal  0.148249 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2712  Pyrrolo-quinoline quinone  32.55 
 
 
801 aa  223  7e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142999  normal  0.96435 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3569  quinate dehydrogenase (pyrroloquinoline-quinone), putative  33.47 
 
 
805 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3111  quinoprotein glucose dehydrogenase  32.68 
 
 
752 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.243036  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2205  Pyrrolo-quinoline quinone  33.47 
 
 
805 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.596534  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2673  quinoprotein glucose dehydrogenase  33.04 
 
 
781 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0856  membrane-bound PQQ-dependent dehydrogenase, glucose/quinate/shikimate family  34.23 
 
 
779 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337612  normal  0.561586 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0595  quinoprotein glucose dehydrogenase  33.84 
 
 
776 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0791  quinoprotein glucose dehydrogenase  32.85 
 
 
806 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1444  glucose dehydrogenase (pyrroloquinoline-quinone)  33.27 
 
 
803 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.244266  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0980  membrane-bound PQQ-dependent dehydrogenase, glucose/quinate/shikimate family  34.91 
 
 
779 aa  221  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.804184  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3339  GntR domain-containing protein  34.66 
 
 
854 aa  221  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.466737  normal  0.260715 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1330  quinoprotein glucose dehydrogenase  33.19 
 
 
781 aa  221  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.352303 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4277  Pyrrolo-quinoline quinone  33.06 
 
 
803 aa  221  5e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.561877  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34970  glucose dehydrogenase  32.86 
 
 
803 aa  221  5e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00222942  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1211  quinoprotein glucose dehydrogenase  32.45 
 
 
777 aa  221  5e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.471268  normal  0.152671 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2951  glucose dehydrogenase  32.53 
 
 
803 aa  220  7e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.734246  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4361  PQQ-dependent dehydrogenase glucose/quinate/shikimate family protein  32.86 
 
 
803 aa  219  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.691425  normal  0.131148 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2352  PQQ-dependent dehydrogenase glucose/quinate/shikimate family protein  33.26 
 
 
805 aa  219  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.140873  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2294  PQQ dehydrogenase family protein  33.26 
 
 
769 aa  217  5e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0342  PQQ-dependent dehydrogenase glucose/quinate/shikimate family protein  32.88 
 
 
868 aa  216  9e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1081  PQQ-dependent dehydrogenase glucose/quinate/shikimate family protein  32.32 
 
 
803 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5020  membrane-bound PQQ-dependent dehydrogenase, glucose/quinate/shikimate family  35.03 
 
 
812 aa  214  5.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0170  quinoprotein glucose dehydrogenase  33.18 
 
 
680 aa  213  7e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.810213  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1775  Pyrrolo-quinoline quinone  32.56 
 
 
854 aa  212  2e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2746  membrane-bound PQQ-dependent dehydrogenase, glucose/quinate/shikimate family  32.02 
 
 
809 aa  211  5e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.113463  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2574  quinoprotein  29.2 
 
 
791 aa  209  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2610  Pyrrolo-quinoline quinone  31.96 
 
 
676 aa  207  5e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.453201 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3417  membrane-bound PQQ-dependent dehydrogenase, glucose/quinate/shikimate family  33.41 
 
 
772 aa  205  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3145  membrane-bound PQQ-dependent dehydrogenase, glucose/quinate/shikimate family  33.19 
 
 
772 aa  204  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3086  glucose dehydrogenase  29.8 
 
 
775 aa  202  1.9999999999999998e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.596873  normal  0.134716 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1237  quinoprotein glucose dehydrogenase  30.83 
 
 
844 aa  197  4.0000000000000005e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0992  Pyrrolo-quinoline quinone  28.51 
 
 
779 aa  194  3e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00168374  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3211  Pyrrolo-quinoline quinone  31.84 
 
 
837 aa  193  8e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156633  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1527  PQQ-dependent dehydrogenase glucose/quinate/shikimate family protein  34.27 
 
 
809 aa  193  9e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0260789 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1961  Pyrrolo-quinoline quinone  32.33 
 
 
783 aa  180  8e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.567557  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3525  quinoprotein glucose dehydrogenase  37.5 
 
 
852 aa  180  9e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1682  membrane-bound PQQ-dependent dehydrogenase, glucose/quinate/shikimate family  36.36 
 
 
837 aa  179  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404284  normal  0.183517 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0411  quinoprotein glucose dehydrogenase  36.71 
 
 
856 aa  164  4.0000000000000004e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2451  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  35.29 
 
 
576 aa  158  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0363  putative alcohol dehydrogenase precursor  32.46 
 
 
572 aa  156  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1149  Pyrrolo-quinoline quinone  31.24 
 
 
678 aa  154  5.9999999999999996e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.261687  normal  0.842615 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3937  putative alcohol dehydrogenase (acceptor)  32.93 
 
 
580 aa  153  8e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.79845 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0969  Pyrrolo-quinoline quinone  32 
 
 
541 aa  152  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  0.326123 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>