291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0969 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_0969  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 
541 aa  1112    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  0.326123 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1201  Pyrrolo-quinoline quinone  41.86 
 
 
545 aa  459  9.999999999999999e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.817213  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1149  Pyrrolo-quinoline quinone  42.91 
 
 
678 aa  402  9.999999999999999e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.261687  normal  0.842615 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2326  putative quinoprotein  41.32 
 
 
525 aa  395  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.55919  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0849  Pyrrolo-quinoline quinone  38.95 
 
 
528 aa  371  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5964  putative quinoprotein ethanol dehydrogenase  33.81 
 
 
554 aa  289  7e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.206262  normal  0.383589 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5419  Pyrrolo-quinoline quinone  35.96 
 
 
576 aa  281  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2451  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  34.04 
 
 
576 aa  276  5e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2415  putative quinoprotein alcohol dehydrogenase  34 
 
 
577 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168343  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5155  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  34.25 
 
 
573 aa  266  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.843195 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3242  Pyrrolo-quinoline quinone  34.25 
 
 
573 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00434002  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5126  Pyrrolo-quinoline quinone  34.25 
 
 
573 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.281211  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2797  Pyrrolo-quinoline quinone  32.14 
 
 
557 aa  265  2e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1570  Pyrrolo-quinoline quinone  32.66 
 
 
568 aa  261  3e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0635613  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0306  putative alcohol dehydrogenase  33.86 
 
 
575 aa  259  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.100044  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1595  putative alcohol dehydrogenase  33.96 
 
 
561 aa  258  2e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5972  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  33.82 
 
 
575 aa  258  3e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0151209 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3007  Pyrrolo-quinoline quinone  31.84 
 
 
573 aa  257  3e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5895  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  33.64 
 
 
575 aa  254  3e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.136104  normal  0.867214 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1741  Pyrrolo-quinoline quinone  33.91 
 
 
570 aa  253  6e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6162  Pyrrolo-quinoline quinone  33.46 
 
 
575 aa  253  6e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114811  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0851  Pyrrolo-quinoline quinone  32.2 
 
 
558 aa  251  3e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7192  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  33.2 
 
 
575 aa  246  8e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.426546  normal  0.582027 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2017  putative quinoprotein ethanol dehydrogenase  29.49 
 
 
592 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.115973  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3660  putative alcohol dehydrogenase  32.42 
 
 
555 aa  240  4e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1306  Pyrrolo-quinoline quinone  30.3 
 
 
738 aa  231  2e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0575142 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3937  putative alcohol dehydrogenase (acceptor)  32.6 
 
 
580 aa  231  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.79845 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0808  Pyrrolo-quinoline quinone  30.78 
 
 
585 aa  227  4e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.260733 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0693  Pyrrolo-quinoline quinone  33.21 
 
 
579 aa  226  6e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.804984  normal  0.410128 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3639  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  31.53 
 
 
566 aa  226  1e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.347084  normal  0.430241 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5302  Pyrrolo-quinoline quinone  30.46 
 
 
721 aa  219  7e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.178096  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2729  Pyrrolo-quinoline quinone  31.13 
 
 
602 aa  219  1e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556411  normal  0.602163 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1855  Pyrrolo-quinoline quinone  29.93 
 
 
587 aa  218  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.668201  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0700  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  30.62 
 
 
613 aa  217  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1811  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  33.09 
 
 
582 aa  217  4e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177841 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4160  Pyrrolo-quinoline quinone:cytochrome c, class I  31 
 
 
718 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.110436  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1451  Pyrrolo-quinoline quinone  30.73 
 
 
616 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.924401  normal  0.0179554 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3733  Pyrrolo-quinoline quinone  29.55 
 
 
562 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1461  Pyrrolo-quinoline quinone  31.42 
 
 
718 aa  216  8e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153207  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4524  Pyrrolo-quinoline quinone  30.62 
 
 
612 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.223128 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4984  Pyrrolo-quinoline quinone  30.11 
 
 
612 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.257884 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2605  Pyrrolo-quinoline quinone  31.73 
 
 
563 aa  215  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308464  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2890  Pyrrolo-quinoline quinone  29.67 
 
 
583 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.612512  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3352  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  29.79 
 
 
707 aa  214  2.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.32899  normal  0.291074 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5502  putative alcohol dehydrogenase  30.29 
 
 
712 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.210225  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5037  Pyrrolo-quinoline quinone  30.62 
 
 
613 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0363  putative alcohol dehydrogenase precursor  31.65 
 
 
572 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3387  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  29.26 
 
 
601 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1001  Pyrrolo-quinoline quinone  30.25 
 
 
698 aa  213  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.132908 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3124  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  31.41 
 
 
595 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0497789  normal  0.831174 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2679  quinoprotein ethanol dehydrogenase, putative  31.23 
 
 
595 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3624  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  30.25 
 
 
579 aa  211  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214303  hitchhiker  0.00920421 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6242  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  32.11 
 
 
597 aa  212  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5136  Pyrrolo-quinoline quinone  30.75 
 
 
709 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.388908  normal  0.506379 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0341  putative quinoprotein ethanol dehydrogenase precursor  30.42 
 
 
562 aa  211  2e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.409253  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0262  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  30.3 
 
 
737 aa  211  3e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0206165  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3084  Pyrrolo-quinoline quinone  31.23 
 
 
595 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1591  putative quinoprotein ethanol dehydrogenase precursor  30.74 
 
 
583 aa  210  6e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.890828  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2255  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  28.99 
 
 
588 aa  209  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.217629  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1887  quinoprotein alcohol dehydrogenase  29.71 
 
 
587 aa  208  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186722  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0905  alcohol dehydrogenase  28.52 
 
 
711 aa  208  2e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.879569  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2870  Pyrrolo-quinoline quinone  29.81 
 
 
705 aa  207  3e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.489222  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5018  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  29.95 
 
 
697 aa  207  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.729726  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2355  Pyrrolo-quinoline quinone  30.67 
 
 
730 aa  207  5e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0680369  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3601  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  31.15 
 
 
724 aa  207  5e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0427  Pyrrolo-quinoline quinone  30.04 
 
 
706 aa  207  5e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.196079 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1829  Pyrrolo-quinoline quinone  30.48 
 
 
620 aa  207  5e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1963  Pyrrolo-quinoline quinone  30.54 
 
 
591 aa  206  8e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0160229  normal  0.256272 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1587  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  29.24 
 
 
601 aa  206  1e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.174692 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2867  Pyrrolo-quinoline quinone  29 
 
 
614 aa  204  3e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0638606 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0476  quinoprotein glucose dehydrogenase  30.28 
 
 
600 aa  204  3e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0877  alcohol dehydrogenase large subunit  29.66 
 
 
720 aa  203  5e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3110  Pyrrolo-quinoline quinone  30.13 
 
 
726 aa  203  7e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.125237 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0473  quinoprotein ethanol dehydrogenase, putative  30.44 
 
 
580 aa  203  7e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0101481 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1339  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  29.48 
 
 
587 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.38566  normal  0.435914 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1784  Pyrrolo-quinoline quinone  31.29 
 
 
580 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0099  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  27.71 
 
 
605 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.850532  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2817  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  30.92 
 
 
602 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1540  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  29.48 
 
 
587 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6351  Pyrrolo-quinoline quinone  28.97 
 
 
604 aa  201  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.346402  normal  0.871662 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2494  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  31.91 
 
 
584 aa  200  5e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.295659  normal  0.19306 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4951  Pyrrolo-quinoline quinone  30.84 
 
 
577 aa  200  5e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.97328 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0020  Pyrrolo-quinoline quinone  28.65 
 
 
600 aa  200  6e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4873  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  29.48 
 
 
587 aa  200  6e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.518263  normal  0.0810929 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1945  Pyrrolo-quinoline quinone  27.76 
 
 
600 aa  200  7e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.188003  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2100  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  31.72 
 
 
584 aa  199  7e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0299  methanol dehydrogenase protein, large subunit, putative  29.48 
 
 
619 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0065801  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2994  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  27.41 
 
 
613 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0170734 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0726  Pyrrolo-quinoline quinone  32.82 
 
 
549 aa  197  5.000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0623502 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2344  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  26.58 
 
 
611 aa  196  9e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0903405  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2696  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  29.91 
 
 
726 aa  195  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2578  putative PQQ dehydrogenase protein  27.41 
 
 
600 aa  194  3e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1236  Pyrrolo-quinoline quinone  27.41 
 
 
600 aa  194  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.278366 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4972  Pyrrolo-quinoline quinone  28.9 
 
 
608 aa  192  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.779778  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2260  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  29.48 
 
 
601 aa  192  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5444  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  29.08 
 
 
599 aa  192  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3943  Pyrrolo-quinoline quinone  27.85 
 
 
601 aa  192  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.237421  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2427  methanol dehydrogenase-like protein (xoxF)  28.98 
 
 
605 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0410852  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1957  Pyrrolo-quinoline quinone  30.04 
 
 
620 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0809644  normal  0.548455 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2409  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  29.34 
 
 
589 aa  190  5e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13814  normal  0.848808 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>