248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1527 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1527  PQQ-dependent dehydrogenase glucose/quinate/shikimate family protein  100 
 
 
809 aa  1615    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0260789 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2574  quinoprotein  49.45 
 
 
791 aa  744    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3930  quinoprotein  45.58 
 
 
807 aa  650    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000484282 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4577  quinoprotein glucose dehydrogenase  44.14 
 
 
803 aa  659    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0411  quinoprotein glucose dehydrogenase  44.08 
 
 
856 aa  633  1e-180  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4196  glucose dehydrogenase  46.8 
 
 
747 aa  624  1e-177  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2951  glucose dehydrogenase  44.76 
 
 
803 aa  623  1e-177  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.734246  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0791  quinoprotein glucose dehydrogenase  45.62 
 
 
806 aa  623  1e-177  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0294  Pyrrolo-quinoline quinone  43.91 
 
 
776 aa  620  1e-176  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2843  glucose dehydrogenase  44.36 
 
 
777 aa  613  9.999999999999999e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.48538  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5020  membrane-bound PQQ-dependent dehydrogenase, glucose/quinate/shikimate family  45.73 
 
 
812 aa  613  9.999999999999999e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0980  membrane-bound PQQ-dependent dehydrogenase, glucose/quinate/shikimate family  43.41 
 
 
779 aa  612  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.804184  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34970  glucose dehydrogenase  44.51 
 
 
803 aa  610  1e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00222942  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3086  glucose dehydrogenase  42.93 
 
 
775 aa  609  1e-173  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.596873  normal  0.134716 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1237  quinoprotein glucose dehydrogenase  39.86 
 
 
844 aa  600  1e-170  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1081  PQQ-dependent dehydrogenase glucose/quinate/shikimate family protein  42.98 
 
 
803 aa  601  1e-170  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1211  quinoprotein glucose dehydrogenase  42.98 
 
 
777 aa  600  1e-170  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.471268  normal  0.152671 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1444  glucose dehydrogenase (pyrroloquinoline-quinone)  42.53 
 
 
803 aa  596  1e-169  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.244266  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0856  membrane-bound PQQ-dependent dehydrogenase, glucose/quinate/shikimate family  43.72 
 
 
779 aa  597  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337612  normal  0.561586 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4361  PQQ-dependent dehydrogenase glucose/quinate/shikimate family protein  42.41 
 
 
803 aa  598  1e-169  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.691425  normal  0.131148 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2673  quinoprotein glucose dehydrogenase  42.82 
 
 
781 aa  593  1e-168  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4277  Pyrrolo-quinoline quinone  42.21 
 
 
803 aa  595  1e-168  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.561877  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3089  membrane-bound PQQ-dependent dehydrogenase, glucose/quinate/shikimate family  43.44 
 
 
800 aa  591  1e-167  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.17686  normal  0.0332501 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3525  quinoprotein glucose dehydrogenase  42.16 
 
 
852 aa  590  1e-167  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1330  quinoprotein glucose dehydrogenase  42.96 
 
 
781 aa  591  1e-167  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.352303 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0595  quinoprotein glucose dehydrogenase  43.72 
 
 
776 aa  590  1e-167  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0992  Pyrrolo-quinoline quinone  41.51 
 
 
779 aa  586  1e-166  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00168374  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1775  Pyrrolo-quinoline quinone  39.76 
 
 
854 aa  582  1.0000000000000001e-165  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7581  quinoprotein glucose dehydrogenase  42.77 
 
 
799 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232583  normal  0.85577 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0672  quinoprotein glucose dehydrogenase  42.36 
 
 
796 aa  566  1e-160  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.570981  normal  0.18059 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0173  quinoprotein glucose dehydrogenase  42.56 
 
 
799 aa  560  1e-158  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0342  PQQ-dependent dehydrogenase glucose/quinate/shikimate family protein  42.04 
 
 
868 aa  557  1e-157  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1505  quinoprotein glucose dehydrogenase  42.87 
 
 
809 aa  551  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.900806  normal  0.427809 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40050  Quinoprotein glucose dehydrogenase  43.47 
 
 
801 aa  550  1e-155  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3100  quinoprotein glucose dehydrogenase  41.26 
 
 
791 aa  547  1e-154  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.236384 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0188  quinoprotein glucose dehydrogenase  41.58 
 
 
796 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.683326 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5562  PQQ-dependent dehydrogenase glucose/quinate/shikimate family protein  42.31 
 
 
800 aa  545  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00123  glucose dehydrogenase  41.39 
 
 
796 aa  536  1e-151  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.833605  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3478  membrane-bound PQQ-dependent dehydrogenase, glucose/quinate/shikimate family  40.77 
 
 
796 aa  537  1e-151  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00122  hypothetical protein  41.39 
 
 
796 aa  536  1e-151  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.793225  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0132  quinoprotein glucose dehydrogenase  41.39 
 
 
796 aa  536  1e-151  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.556262  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0128  glucose dehydrogenase  40.77 
 
 
796 aa  537  1e-151  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.126967  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3535  PQQ-dependent dehydrogenase glucose/quinate/shikimate family protein  41.39 
 
 
796 aa  536  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0134  quinoprotein glucose dehydrogenase  40.77 
 
 
796 aa  537  1e-151  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0126  glucose dehydrogenase  41.39 
 
 
796 aa  536  1e-151  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1682  membrane-bound PQQ-dependent dehydrogenase, glucose/quinate/shikimate family  39.53 
 
 
837 aa  530  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404284  normal  0.183517 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0201  quinoprotein glucose dehydrogenase  41.9 
 
 
747 aa  524  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0193  quinoprotein glucose dehydrogenase  41.77 
 
 
747 aa  521  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52734  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0185  quinoprotein glucose dehydrogenase  41.77 
 
 
747 aa  521  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.266992  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0184  quinoprotein glucose dehydrogenase  41.77 
 
 
747 aa  521  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.23859  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3111  quinoprotein glucose dehydrogenase  41.55 
 
 
752 aa  511  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.243036  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4849  Pyrrolo-quinoline quinone  38.49 
 
 
803 aa  503  1e-141  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.97652  hitchhiker  0.0000763384 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1469  membrane-bound PQQ-dependent dehydrogenase, glucose/quinate/shikimate family  38.7 
 
 
818 aa  483  1e-135  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.128704  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2382  membrane-bound PQQ-dependent dehydrogenase, glucose/quinate/shikimate family  37.46 
 
 
807 aa  469  1.0000000000000001e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.220002  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2712  Pyrrolo-quinoline quinone  37.25 
 
 
801 aa  465  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142999  normal  0.96435 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3825  membrane-bound PQQ-dependent dehydrogenase, glucose/quinate/shikimate family  37.29 
 
 
800 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2205  Pyrrolo-quinoline quinone  36.27 
 
 
805 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.596534  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2415  Pyrrolo-quinoline quinone  35.81 
 
 
811 aa  459  9.999999999999999e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00299347  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2352  PQQ-dependent dehydrogenase glucose/quinate/shikimate family protein  35.78 
 
 
805 aa  459  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.140873  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3569  quinate dehydrogenase (pyrroloquinoline-quinone), putative  36.43 
 
 
805 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5965  membrane-bound PQQ-dependent dehydrogenase, glucose/quinate/shikimate family  37.38 
 
 
798 aa  455  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.558391 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2568  glucose dehydrogenase  36.65 
 
 
788 aa  450  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2956  PQQ-dependent dehydrogenase glucose/quinate/shikimate family protein  35.86 
 
 
805 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0315407  normal  0.148249 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2024  quinoprotein glucose dehydrogenase  37.42 
 
 
784 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.963256  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5248  pyrroloquinoline-quinone-dependent quinate dehydrogenase  36.91 
 
 
809 aa  445  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.685305  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1963  quinate dehydrogenase (pyrroloquinoline-quinone)  35.4 
 
 
794 aa  445  1e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3055  Pyrrolo-quinoline quinone  37.19 
 
 
853 aa  439  9.999999999999999e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000520854  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1961  Pyrrolo-quinoline quinone  35.77 
 
 
783 aa  436  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.567557  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3417  membrane-bound PQQ-dependent dehydrogenase, glucose/quinate/shikimate family  36.62 
 
 
772 aa  439  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2112  Pyrrolo-quinoline quinone  34.35 
 
 
814 aa  436  1e-120  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2577  membrane-bound PQQ-dependent dehydrogenase, glucose/quinate/shikimate family  36.44 
 
 
840 aa  429  1e-119  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.135772  normal  0.263585 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3211  Pyrrolo-quinoline quinone  36.35 
 
 
837 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156633  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2294  PQQ dehydrogenase family protein  36.56 
 
 
769 aa  429  1e-118  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3145  membrane-bound PQQ-dependent dehydrogenase, glucose/quinate/shikimate family  37.61 
 
 
772 aa  429  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2746  membrane-bound PQQ-dependent dehydrogenase, glucose/quinate/shikimate family  35.52 
 
 
809 aa  427  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.113463  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2831  quinoprotein glucose dehydrogenase  36.01 
 
 
828 aa  425  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.871062  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3339  GntR domain-containing protein  39.81 
 
 
854 aa  411  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.466737  normal  0.260715 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3539  quinoprotein glucose dehydrogenase  38.77 
 
 
724 aa  388  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.331402  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2593  quinoprotein glucose dehydrogenase  40.18 
 
 
639 aa  384  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.238471  normal  0.0735284 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2610  Pyrrolo-quinoline quinone  35.78 
 
 
676 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.453201 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1054  quinoprotein glucose dehydrogenase  38.04 
 
 
669 aa  361  3e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.236917 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0170  quinoprotein glucose dehydrogenase  30.22 
 
 
680 aa  278  3e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.810213  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1900  quinoprotein glucose dehydrogenase  31.45 
 
 
720 aa  208  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3953  Quinoprotein glucose dehydrogenase  34.2 
 
 
747 aa  204  8e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2704  Quinoprotein glucose dehydrogenase  31.85 
 
 
731 aa  194  6e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1014  Quinoprotein glucose dehydrogenase  32.58 
 
 
732 aa  193  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.101534  normal  0.630139 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0062  Pyrrolo-quinoline quinone  34.92 
 
 
704 aa  187  6e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.387664 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2450  PQQ-dependent enzyme-like protein  31.91 
 
 
718 aa  184  7e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264561  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1594  glucose dehydrogenase  27.06 
 
 
651 aa  178  4e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1378  Quinoprotein glucose dehydrogenase  31.22 
 
 
769 aa  177  6e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.618452 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5932  quinate/shikimate dehydrogenase, putative  27.11 
 
 
671 aa  170  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0107565 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1611  Glycerol dehydrogenase (acceptor)  29.74 
 
 
722 aa  169  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0311  Pyrrolo-quinoline quinone  30.77 
 
 
705 aa  167  6.9999999999999995e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.394174 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1132  PQQ-dependent enzyme-like protein  30.79 
 
 
701 aa  164  4.0000000000000004e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0946665  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2867  Pyrrolo-quinoline quinone  26.43 
 
 
614 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0638606 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4957  Pyrrolo-quinoline quinone  29.69 
 
 
698 aa  159  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.897916 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5419  Pyrrolo-quinoline quinone  25.9 
 
 
576 aa  144  8e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4524  Pyrrolo-quinoline quinone  25.36 
 
 
612 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.223128 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2415  putative quinoprotein alcohol dehydrogenase  25.19 
 
 
577 aa  141  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168343  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5502  putative alcohol dehydrogenase  26.12 
 
 
712 aa  137  7.000000000000001e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.210225  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>