More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2867 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_2867  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 
614 aa  1231    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0638606 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4984  Pyrrolo-quinoline quinone  50.44 
 
 
612 aa  551  1e-156  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.257884 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4524  Pyrrolo-quinoline quinone  50.44 
 
 
612 aa  550  1e-155  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.223128 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5037  Pyrrolo-quinoline quinone  49.65 
 
 
613 aa  528  1e-149  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0808  Pyrrolo-quinoline quinone  49.49 
 
 
585 aa  521  1e-146  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.260733 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2415  putative quinoprotein alcohol dehydrogenase  41.45 
 
 
577 aa  438  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168343  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1570  Pyrrolo-quinoline quinone  41.48 
 
 
568 aa  435  1e-121  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0635613  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3007  Pyrrolo-quinoline quinone  40.24 
 
 
573 aa  434  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5419  Pyrrolo-quinoline quinone  40.28 
 
 
576 aa  429  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2451  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  33.17 
 
 
576 aa  295  1e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1741  Pyrrolo-quinoline quinone  32.4 
 
 
570 aa  286  5.999999999999999e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1963  Pyrrolo-quinoline quinone  32.67 
 
 
591 aa  283  8.000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0160229  normal  0.256272 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0693  Pyrrolo-quinoline quinone  34.81 
 
 
579 aa  282  1e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.804984  normal  0.410128 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3084  Pyrrolo-quinoline quinone  32.03 
 
 
595 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2679  quinoprotein ethanol dehydrogenase, putative  31.87 
 
 
595 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3124  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  31.87 
 
 
595 aa  277  4e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0497789  normal  0.831174 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1461  Pyrrolo-quinoline quinone  33.44 
 
 
718 aa  276  9e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153207  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5964  putative quinoprotein ethanol dehydrogenase  31.83 
 
 
554 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.206262  normal  0.383589 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1540  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  31.94 
 
 
587 aa  274  3e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5136  Pyrrolo-quinoline quinone  32.81 
 
 
709 aa  274  3e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.388908  normal  0.506379 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1339  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  31.94 
 
 
587 aa  274  3e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.38566  normal  0.435914 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1855  Pyrrolo-quinoline quinone  31.62 
 
 
587 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.668201  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2255  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  30.68 
 
 
588 aa  271  2e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.217629  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5302  Pyrrolo-quinoline quinone  32.01 
 
 
721 aa  270  5.9999999999999995e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.178096  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4873  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  31.48 
 
 
587 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.518263  normal  0.0810929 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0427  Pyrrolo-quinoline quinone  32.3 
 
 
706 aa  266  5.999999999999999e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.196079 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5502  putative alcohol dehydrogenase  32.89 
 
 
712 aa  266  7e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.210225  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2870  Pyrrolo-quinoline quinone  33.72 
 
 
705 aa  265  1e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.489222  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3352  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  31.84 
 
 
707 aa  265  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.32899  normal  0.291074 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4160  Pyrrolo-quinoline quinone:cytochrome c, class I  33.05 
 
 
718 aa  264  4.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.110436  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5018  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  33.39 
 
 
697 aa  263  6.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.729726  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1306  Pyrrolo-quinoline quinone  30.65 
 
 
738 aa  262  1e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0575142 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3601  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  33.11 
 
 
724 aa  261  3e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2355  Pyrrolo-quinoline quinone  31.37 
 
 
730 aa  260  6e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0680369  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1887  quinoprotein alcohol dehydrogenase  29.94 
 
 
587 aa  259  1e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186722  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1784  Pyrrolo-quinoline quinone  33.33 
 
 
580 aa  258  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7192  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  31.18 
 
 
575 aa  257  4e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.426546  normal  0.582027 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0721  Pyrrolo-quinoline quinone  33.39 
 
 
702 aa  256  6e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00760072 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2817  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  31.74 
 
 
602 aa  256  1.0000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3110  Pyrrolo-quinoline quinone  31.23 
 
 
726 aa  254  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.125237 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2409  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  31.02 
 
 
589 aa  251  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13814  normal  0.848808 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1023  Pyrrolo-quinoline quinone  32.42 
 
 
593 aa  251  3e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6242  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  31.53 
 
 
597 aa  250  5e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3312  quinoprotein alcohol dehydrogenase  31.14 
 
 
623 aa  249  8e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2100  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  31.72 
 
 
584 aa  248  2e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2260  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  32.77 
 
 
601 aa  248  2e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3129  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  30.83 
 
 
631 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.957958  normal  0.28425 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2674  quinoprotein ethanol dehydrogenase  30.67 
 
 
631 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3089  Pyrrolo-quinoline quinone  30.67 
 
 
631 aa  248  3e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.326291  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0262  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  31.85 
 
 
737 aa  247  3e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0206165  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2729  Pyrrolo-quinoline quinone  30.76 
 
 
602 aa  247  4e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556411  normal  0.602163 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5155  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  30.41 
 
 
573 aa  247  4e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.843195 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2494  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  32.05 
 
 
584 aa  247  4e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.295659  normal  0.19306 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3242  Pyrrolo-quinoline quinone  30.41 
 
 
573 aa  247  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00434002  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1001  Pyrrolo-quinoline quinone  33.5 
 
 
698 aa  247  4.9999999999999997e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.132908 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5126  Pyrrolo-quinoline quinone  30.41 
 
 
573 aa  247  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.281211  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1149  Pyrrolo-quinoline quinone  30.8 
 
 
678 aa  246  8e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.261687  normal  0.842615 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38860  quinoprotein alcohol dehydrogenase  30.97 
 
 
623 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0473  quinoprotein ethanol dehydrogenase, putative  32.05 
 
 
580 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0101481 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3624  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  30.76 
 
 
579 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214303  hitchhiker  0.00920421 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5895  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  31.32 
 
 
575 aa  241  4e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.136104  normal  0.867214 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1811  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  31.91 
 
 
582 aa  240  5e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177841 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0306  putative alcohol dehydrogenase  31.32 
 
 
575 aa  240  6.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.100044  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1591  putative quinoprotein ethanol dehydrogenase precursor  29.73 
 
 
583 aa  239  1e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.890828  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5972  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  30.81 
 
 
575 aa  238  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0151209 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6162  Pyrrolo-quinoline quinone  30.99 
 
 
575 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114811  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0363  putative alcohol dehydrogenase precursor  29.94 
 
 
572 aa  238  2e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0476  quinoprotein alcohol dehydrogenase  29.27 
 
 
618 aa  238  3e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0260666 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1957  Pyrrolo-quinoline quinone  30.21 
 
 
620 aa  237  4e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0809644  normal  0.548455 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1945  Pyrrolo-quinoline quinone  30.2 
 
 
600 aa  237  4e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.188003  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2696  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  31.49 
 
 
726 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3937  putative alcohol dehydrogenase (acceptor)  29.26 
 
 
580 aa  233  6e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.79845 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2673  quinoprotein ethanol dehydrogenase precursor  29.94 
 
 
588 aa  232  2e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0513715  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2605  Pyrrolo-quinoline quinone  30 
 
 
563 aa  231  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308464  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1236  Pyrrolo-quinoline quinone  29.4 
 
 
600 aa  229  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.278366 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2578  putative PQQ dehydrogenase protein  29.4 
 
 
600 aa  229  1e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2797  Pyrrolo-quinoline quinone  28.33 
 
 
557 aa  229  1e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2017  putative quinoprotein ethanol dehydrogenase  29.18 
 
 
592 aa  229  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.115973  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1587  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  29.75 
 
 
601 aa  229  1e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.174692 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2593  quinoprotein glucose dehydrogenase  30.6 
 
 
639 aa  228  3e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.238471  normal  0.0735284 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5968  methanol dehydrogenase large subunit  29.64 
 
 
601 aa  228  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.366255  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1595  putative alcohol dehydrogenase  32.27 
 
 
561 aa  224  3e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0700  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  31.6 
 
 
613 aa  224  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0851  Pyrrolo-quinoline quinone  31.82 
 
 
558 aa  224  4.9999999999999996e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6478  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  29.07 
 
 
606 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.975384  normal  0.155074 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0341  putative quinoprotein ethanol dehydrogenase precursor  29.58 
 
 
562 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.409253  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0379  Pyrrolo-quinoline quinone  30.02 
 
 
727 aa  221  3e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3733  Pyrrolo-quinoline quinone  30.77 
 
 
562 aa  220  6e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2427  methanol dehydrogenase-like protein (xoxF)  30.15 
 
 
605 aa  220  6e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0410852  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1829  Pyrrolo-quinoline quinone  28.4 
 
 
620 aa  218  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1054  quinoprotein glucose dehydrogenase  28.63 
 
 
669 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.236917 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4972  Pyrrolo-quinoline quinone  28.39 
 
 
608 aa  218  2.9999999999999998e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.779778  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2673  quinoprotein glucose dehydrogenase  29.05 
 
 
781 aa  216  9e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1330  quinoprotein glucose dehydrogenase  29.05 
 
 
781 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.352303 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0673  PQQ-dependent enzyme-like protein  27.58 
 
 
569 aa  216  9.999999999999999e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0726  Pyrrolo-quinoline quinone  30.34 
 
 
549 aa  216  9.999999999999999e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0623502 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3106  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  28.43 
 
 
606 aa  215  1.9999999999999998e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3943  Pyrrolo-quinoline quinone  28.06 
 
 
601 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.237421  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6351  Pyrrolo-quinoline quinone  29.02 
 
 
604 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.346402  normal  0.871662 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2843  glucose dehydrogenase  27.97 
 
 
777 aa  215  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.48538  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>