266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2017 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_2017  putative quinoprotein ethanol dehydrogenase  100 
 
 
592 aa  1209    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.115973  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5964  putative quinoprotein ethanol dehydrogenase  39.15 
 
 
554 aa  376  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.206262  normal  0.383589 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2451  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  38.39 
 
 
576 aa  367  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2679  quinoprotein ethanol dehydrogenase, putative  37.89 
 
 
595 aa  361  2e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3084  Pyrrolo-quinoline quinone  37.89 
 
 
595 aa  361  2e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1963  Pyrrolo-quinoline quinone  38.25 
 
 
591 aa  360  4e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0160229  normal  0.256272 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3124  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  37.73 
 
 
595 aa  360  5e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0497789  normal  0.831174 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0693  Pyrrolo-quinoline quinone  40.62 
 
 
579 aa  358  9.999999999999999e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.804984  normal  0.410128 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1591  putative quinoprotein ethanol dehydrogenase precursor  39.32 
 
 
583 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.890828  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5155  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  39.54 
 
 
573 aa  355  2e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.843195 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3242  Pyrrolo-quinoline quinone  39.54 
 
 
573 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00434002  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5126  Pyrrolo-quinoline quinone  39.54 
 
 
573 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.281211  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1855  Pyrrolo-quinoline quinone  37.09 
 
 
587 aa  353  5e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.668201  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2255  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  37.19 
 
 
588 aa  352  1e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.217629  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1887  quinoprotein alcohol dehydrogenase  36.77 
 
 
587 aa  351  2e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186722  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2409  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  38.37 
 
 
589 aa  347  3e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13814  normal  0.848808 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1784  Pyrrolo-quinoline quinone  37.23 
 
 
580 aa  346  5e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4873  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  36.48 
 
 
587 aa  346  6e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.518263  normal  0.0810929 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2817  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  37.41 
 
 
602 aa  345  2e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1339  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  36.3 
 
 
587 aa  344  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.38566  normal  0.435914 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1741  Pyrrolo-quinoline quinone  38.38 
 
 
570 aa  344  2.9999999999999997e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1540  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  36.3 
 
 
587 aa  344  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0306  putative alcohol dehydrogenase  38.27 
 
 
575 aa  343  5.999999999999999e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.100044  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7192  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  37.1 
 
 
575 aa  339  7e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.426546  normal  0.582027 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2100  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  37.35 
 
 
584 aa  338  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2494  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  37.18 
 
 
584 aa  337  3.9999999999999995e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.295659  normal  0.19306 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0473  quinoprotein ethanol dehydrogenase, putative  36.6 
 
 
580 aa  335  1e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0101481 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6242  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  36.43 
 
 
597 aa  333  7.000000000000001e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3639  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  38.7 
 
 
566 aa  333  7.000000000000001e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.347084  normal  0.430241 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5895  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  37.94 
 
 
575 aa  332  1e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.136104  normal  0.867214 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6162  Pyrrolo-quinoline quinone  37.94 
 
 
575 aa  332  2e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114811  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1023  Pyrrolo-quinoline quinone  36.63 
 
 
593 aa  330  3e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5972  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  37.77 
 
 
575 aa  329  9e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0151209 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3624  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  35.13 
 
 
579 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214303  hitchhiker  0.00920421 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1811  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  36.36 
 
 
582 aa  327  3e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177841 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2729  Pyrrolo-quinoline quinone  35.08 
 
 
602 aa  327  5e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556411  normal  0.602163 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3312  quinoprotein alcohol dehydrogenase  33.44 
 
 
623 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0341  putative quinoprotein ethanol dehydrogenase precursor  36.94 
 
 
562 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.409253  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38860  quinoprotein alcohol dehydrogenase  33.6 
 
 
623 aa  321  3e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1306  Pyrrolo-quinoline quinone  35.85 
 
 
738 aa  320  6e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0575142 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2870  Pyrrolo-quinoline quinone  36.79 
 
 
705 aa  318  2e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.489222  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2673  quinoprotein ethanol dehydrogenase precursor  36.6 
 
 
588 aa  316  6e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0513715  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2674  quinoprotein ethanol dehydrogenase  33.81 
 
 
631 aa  316  9e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3129  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  33.6 
 
 
631 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.957958  normal  0.28425 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3089  Pyrrolo-quinoline quinone  33.6 
 
 
631 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.326291  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1957  Pyrrolo-quinoline quinone  33.76 
 
 
620 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0809644  normal  0.548455 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3601  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  39.24 
 
 
724 aa  314  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2696  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  36.05 
 
 
726 aa  313  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0721  Pyrrolo-quinoline quinone  37.04 
 
 
702 aa  312  1e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00760072 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2355  Pyrrolo-quinoline quinone  38.19 
 
 
730 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0680369  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0726  Pyrrolo-quinoline quinone  37.16 
 
 
549 aa  307  3e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0623502 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4160  Pyrrolo-quinoline quinone:cytochrome c, class I  37.56 
 
 
718 aa  306  6e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.110436  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5136  Pyrrolo-quinoline quinone  36.99 
 
 
709 aa  306  1.0000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.388908  normal  0.506379 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5302  Pyrrolo-quinoline quinone  39.03 
 
 
721 aa  304  2.0000000000000002e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.178096  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3937  putative alcohol dehydrogenase (acceptor)  35.73 
 
 
580 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.79845 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3110  Pyrrolo-quinoline quinone  37.78 
 
 
726 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.125237 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2606  Pyrrolo-quinoline quinone  34.51 
 
 
558 aa  302  1e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0427  Pyrrolo-quinoline quinone  36.06 
 
 
706 aa  302  1e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.196079 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1461  Pyrrolo-quinoline quinone  37.76 
 
 
718 aa  301  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153207  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0379  Pyrrolo-quinoline quinone  36.57 
 
 
727 aa  301  2e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5502  putative alcohol dehydrogenase  36.82 
 
 
712 aa  300  4e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.210225  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2605  Pyrrolo-quinoline quinone  36.14 
 
 
563 aa  297  3e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308464  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3387  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  34.07 
 
 
601 aa  296  9e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5018  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  37.43 
 
 
697 aa  295  1e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.729726  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2415  putative quinoprotein alcohol dehydrogenase  34.43 
 
 
577 aa  295  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168343  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2790  Pyrrolo-quinoline quinone  35.84 
 
 
615 aa  294  3e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0363  putative alcohol dehydrogenase precursor  36.28 
 
 
572 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3352  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  35.45 
 
 
707 aa  290  6e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.32899  normal  0.291074 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0851  Pyrrolo-quinoline quinone  35.02 
 
 
558 aa  290  7e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6351  Pyrrolo-quinoline quinone  32.81 
 
 
604 aa  288  2e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.346402  normal  0.871662 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1570  Pyrrolo-quinoline quinone  36.43 
 
 
568 aa  288  2e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0635613  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0905  alcohol dehydrogenase  34.99 
 
 
711 aa  287  4e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.879569  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0476  quinoprotein alcohol dehydrogenase  33.44 
 
 
618 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0260666 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5419  Pyrrolo-quinoline quinone  33.75 
 
 
576 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1595  putative alcohol dehydrogenase  34.77 
 
 
561 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3007  Pyrrolo-quinoline quinone  32.83 
 
 
573 aa  283  8.000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0299  methanol dehydrogenase protein, large subunit, putative  33.83 
 
 
619 aa  283  9e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0065801  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0877  alcohol dehydrogenase large subunit  34.56 
 
 
720 aa  281  2e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0779  methanol dehydrogenase protein, large subunit  34.78 
 
 
601 aa  281  3e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0879687  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0262  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  33.17 
 
 
737 aa  281  3e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0206165  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5968  methanol dehydrogenase large subunit  34.14 
 
 
601 aa  281  3e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.366255  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0700  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  34.55 
 
 
613 aa  280  4e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1451  Pyrrolo-quinoline quinone  35.08 
 
 
616 aa  276  5e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.924401  normal  0.0179554 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2578  putative PQQ dehydrogenase protein  31.99 
 
 
600 aa  276  6e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1236  Pyrrolo-quinoline quinone  31.99 
 
 
600 aa  276  6e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.278366 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0099  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  32.49 
 
 
605 aa  276  7e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.850532  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3733  Pyrrolo-quinoline quinone  31.66 
 
 
562 aa  276  8e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1945  Pyrrolo-quinoline quinone  31.99 
 
 
600 aa  276  9e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.188003  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2344  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  33.62 
 
 
611 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0903405  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1001  Pyrrolo-quinoline quinone  34.12 
 
 
698 aa  273  6e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.132908 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1781  Pyrrolo-quinoline quinone  32.99 
 
 
601 aa  273  8.000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.981644  normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2994  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  32.73 
 
 
613 aa  272  1e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0170734 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4150  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  32.92 
 
 
626 aa  270  4e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383489  normal  0.812853 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4518  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  32.92 
 
 
626 aa  270  4e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.966685  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4632  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  33.27 
 
 
626 aa  270  4e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.271906 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8040  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  32.63 
 
 
629 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.771392  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3943  Pyrrolo-quinoline quinone  32.01 
 
 
601 aa  266  7e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.237421  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4210  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  31.99 
 
 
627 aa  266  1e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.719388  normal  0.669409 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1587  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  32.36 
 
 
601 aa  264  4e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.174692 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0344  Pyrrolo-quinoline quinone  30.96 
 
 
623 aa  261  2e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.122301  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>