More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0427 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_3352  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  72.75 
 
 
707 aa  1054    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.32899  normal  0.291074 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1461  Pyrrolo-quinoline quinone  71.28 
 
 
718 aa  1030    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153207  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4160  Pyrrolo-quinoline quinone:cytochrome c, class I  74.82 
 
 
718 aa  1078    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.110436  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5502  putative alcohol dehydrogenase  70.13 
 
 
712 aa  1020    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.210225  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2355  Pyrrolo-quinoline quinone  71.05 
 
 
730 aa  1010    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0680369  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5302  Pyrrolo-quinoline quinone  77.52 
 
 
721 aa  1125    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.178096  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3110  Pyrrolo-quinoline quinone  70.8 
 
 
726 aa  1009    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.125237 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5136  Pyrrolo-quinoline quinone  65.19 
 
 
709 aa  975    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.388908  normal  0.506379 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0427  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 
706 aa  1447    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.196079 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3601  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  71.49 
 
 
724 aa  1012    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5018  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  90.85 
 
 
697 aa  1267    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.729726  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2696  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  49.49 
 
 
726 aa  615  1e-175  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0721  Pyrrolo-quinoline quinone  49.4 
 
 
702 aa  613  9.999999999999999e-175  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00760072 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1306  Pyrrolo-quinoline quinone  45.93 
 
 
738 aa  593  1e-168  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0575142 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0262  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  43.53 
 
 
737 aa  565  1e-160  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0206165  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2870  Pyrrolo-quinoline quinone  46.02 
 
 
705 aa  562  1.0000000000000001e-159  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.489222  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0877  alcohol dehydrogenase large subunit  44.96 
 
 
720 aa  552  1e-156  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0379  Pyrrolo-quinoline quinone  43.56 
 
 
727 aa  535  1e-151  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0905  alcohol dehydrogenase  44.35 
 
 
711 aa  533  1e-150  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.879569  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1001  Pyrrolo-quinoline quinone  42.77 
 
 
698 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.132908 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2227  Pyrrolo-quinoline quinone  45.22 
 
 
705 aa  514  1e-144  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.580603 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2878  Pyrrolo-quinoline quinone  41.82 
 
 
727 aa  457  1e-127  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4160  Pyrrolo-quinoline quinone  36.77 
 
 
690 aa  397  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0349949 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3084  Pyrrolo-quinoline quinone  39.8 
 
 
595 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2679  quinoprotein ethanol dehydrogenase, putative  39.97 
 
 
595 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3124  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  39.97 
 
 
595 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0497789  normal  0.831174 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1963  Pyrrolo-quinoline quinone  38.93 
 
 
591 aa  370  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0160229  normal  0.256272 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1855  Pyrrolo-quinoline quinone  40.07 
 
 
587 aa  369  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.668201  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2255  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  39.89 
 
 
588 aa  365  1e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.217629  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1339  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  41.67 
 
 
587 aa  365  1e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.38566  normal  0.435914 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1540  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  41.67 
 
 
587 aa  365  1e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4873  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  42.18 
 
 
587 aa  365  2e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.518263  normal  0.0810929 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2409  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  42.86 
 
 
589 aa  364  4e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13814  normal  0.848808 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0693  Pyrrolo-quinoline quinone  41.4 
 
 
579 aa  360  6e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.804984  normal  0.410128 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1887  quinoprotein alcohol dehydrogenase  39.4 
 
 
587 aa  356  6.999999999999999e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186722  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2817  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  40.5 
 
 
602 aa  353  4e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5964  putative quinoprotein ethanol dehydrogenase  38.42 
 
 
554 aa  351  2e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.206262  normal  0.383589 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3624  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  39.93 
 
 
579 aa  346  8.999999999999999e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214303  hitchhiker  0.00920421 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2100  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  40.43 
 
 
584 aa  343  5e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2494  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  40.25 
 
 
584 aa  341  2.9999999999999998e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.295659  normal  0.19306 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2729  Pyrrolo-quinoline quinone  39.89 
 
 
602 aa  340  4e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556411  normal  0.602163 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5155  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  37.16 
 
 
573 aa  339  9e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.843195 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3242  Pyrrolo-quinoline quinone  37.16 
 
 
573 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00434002  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5126  Pyrrolo-quinoline quinone  37.16 
 
 
573 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.281211  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0341  putative quinoprotein ethanol dehydrogenase precursor  37.43 
 
 
562 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.409253  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5895  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  38.21 
 
 
575 aa  337  7e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.136104  normal  0.867214 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5972  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  37.77 
 
 
575 aa  335  1e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0151209 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6162  Pyrrolo-quinoline quinone  37.86 
 
 
575 aa  335  2e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114811  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7192  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  36.59 
 
 
575 aa  332  1e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.426546  normal  0.582027 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0306  putative alcohol dehydrogenase  35.98 
 
 
575 aa  331  3e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.100044  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1784  Pyrrolo-quinoline quinone  39.53 
 
 
580 aa  330  4e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2673  quinoprotein ethanol dehydrogenase precursor  37.39 
 
 
588 aa  329  9e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0513715  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3387  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  36.88 
 
 
601 aa  327  7e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3312  quinoprotein alcohol dehydrogenase  38.94 
 
 
623 aa  324  4e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3129  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  39.3 
 
 
631 aa  323  7e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.957958  normal  0.28425 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38860  quinoprotein alcohol dehydrogenase  38.76 
 
 
623 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1741  Pyrrolo-quinoline quinone  37.03 
 
 
570 aa  322  1.9999999999999998e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3089  Pyrrolo-quinoline quinone  39.11 
 
 
631 aa  321  3e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.326291  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2674  quinoprotein ethanol dehydrogenase  39.11 
 
 
631 aa  321  3e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1957  Pyrrolo-quinoline quinone  36.45 
 
 
620 aa  319  1e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0809644  normal  0.548455 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2790  Pyrrolo-quinoline quinone  36.73 
 
 
615 aa  315  1.9999999999999998e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6242  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  38.13 
 
 
597 aa  314  3.9999999999999997e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6351  Pyrrolo-quinoline quinone  37.61 
 
 
604 aa  314  3.9999999999999997e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.346402  normal  0.871662 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1451  Pyrrolo-quinoline quinone  35.07 
 
 
616 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.924401  normal  0.0179554 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1023  Pyrrolo-quinoline quinone  38.35 
 
 
593 aa  312  1e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2344  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  36.57 
 
 
611 aa  312  1e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0903405  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2994  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  34.52 
 
 
613 aa  312  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0170734 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0099  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  35.09 
 
 
605 aa  311  2e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.850532  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1587  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  36.33 
 
 
601 aa  311  2e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.174692 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0473  quinoprotein ethanol dehydrogenase, putative  36.69 
 
 
580 aa  309  9e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0101481 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5444  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  37.11 
 
 
599 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1761  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  38.03 
 
 
601 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0700  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  36.84 
 
 
613 aa  308  2.0000000000000002e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3639  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  37.79 
 
 
566 aa  307  4.0000000000000004e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.347084  normal  0.430241 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2451  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  35.69 
 
 
576 aa  307  5.0000000000000004e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2145  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  37.48 
 
 
601 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.885263  normal  0.307838 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1809  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  37.48 
 
 
601 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1945  Pyrrolo-quinoline quinone  35.31 
 
 
600 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.188003  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2578  putative PQQ dehydrogenase protein  36.19 
 
 
600 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1236  Pyrrolo-quinoline quinone  36.19 
 
 
600 aa  305  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.278366 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5968  methanol dehydrogenase large subunit  36.91 
 
 
601 aa  303  1e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.366255  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2017  putative quinoprotein ethanol dehydrogenase  36.06 
 
 
592 aa  302  1e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.115973  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4686  Pyrrolo-quinoline quinone  37.16 
 
 
607 aa  301  2e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.829526 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0726  Pyrrolo-quinoline quinone  39.38 
 
 
549 aa  300  6e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0623502 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2260  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  36.93 
 
 
601 aa  300  9e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0508  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  37.36 
 
 
601 aa  299  1e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.619983  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1932  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  36.99 
 
 
592 aa  299  1e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0203998 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1781  Pyrrolo-quinoline quinone  36.64 
 
 
601 aa  298  2e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.981644  normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1811  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  36.32 
 
 
582 aa  295  2e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177841 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5977  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  36.63 
 
 
600 aa  295  2e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.391325  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0363  putative alcohol dehydrogenase precursor  36.52 
 
 
572 aa  292  1e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5752  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  36.08 
 
 
599 aa  291  3e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0649397 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0421  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  36.16 
 
 
590 aa  291  4e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0476  quinoprotein alcohol dehydrogenase  35.25 
 
 
618 aa  291  4e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0260666 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0299  methanol dehydrogenase protein, large subunit, putative  36.84 
 
 
619 aa  290  6e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0065801  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3943  Pyrrolo-quinoline quinone  34.87 
 
 
601 aa  287  5e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.237421  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4972  Pyrrolo-quinoline quinone  34.56 
 
 
608 aa  286  8e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.779778  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0779  methanol dehydrogenase protein, large subunit  34.57 
 
 
601 aa  286  1.0000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0879687  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3937  putative alcohol dehydrogenase (acceptor)  34.68 
 
 
580 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.79845 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6478  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  34.19 
 
 
606 aa  283  8.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.975384  normal  0.155074 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>